Protein–RNA interactions for Protein: P62684

HERVK_113, Endogenous retrovirus group K member 113 Gag polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 666 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERVK_113P62684 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
HERVK_113P62684 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
HERVK_113P62684 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
HERVK_113P62684 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
HERVK_113P62684 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
HERVK_113P62684 PHKG2-202ENST00000424889 1566 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
HERVK_113P62684 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
HERVK_113P62684 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
HERVK_113P62684 ICA1-208ENST00000407906 1615 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
HERVK_113P62684 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
HERVK_113P62684 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
HERVK_113P62684 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
HERVK_113P62684 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
HERVK_113P62684 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
HERVK_113P62684 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
HERVK_113P62684 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
HERVK_113P62684 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
HERVK_113P62684 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
HERVK_113P62684 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
HERVK_113P62684 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
HERVK_113P62684 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
HERVK_113P62684 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
HERVK_113P62684 OR10H5-201ENST00000308940 1132 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
HERVK_113P62684 HBZP1-201ENST00000354915 429 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
HERVK_113P62684 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
HERVK_113P62684 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
HERVK_113P62684 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
HERVK_113P62684 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
HERVK_113P62684 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
HERVK_113P62684 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
HERVK_113P62684 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
HERVK_113P62684 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
HERVK_113P62684 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
HERVK_113P62684 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
HERVK_113P62684 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
HERVK_113P62684 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
HERVK_113P62684 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
HERVK_113P62684 BOLA2B-201ENST00000305321 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
HERVK_113P62684 BOLA2-201ENST00000330978 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
HERVK_113P62684 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
HERVK_113P62684 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
HERVK_113P62684 IFI27L1-206ENST00000554562 571 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
HERVK_113P62684 TRAF7-205ENST00000567653 666 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
HERVK_113P62684 BIRC5-207ENST00000590449 568 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
HERVK_113P62684 AC004076.1-201ENST00000596831 664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
HERVK_113P62684 BCL10-202ENST00000620248 774 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
HERVK_113P62684 AC012313.10-201ENST00000623509 926 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
HERVK_113P62684 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
HERVK_113P62684 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
HERVK_113P62684 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
HERVK_113P62684 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
HERVK_113P62684 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
HERVK_113P62684 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
HERVK_113P62684 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
HERVK_113P62684 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
HERVK_113P62684 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
HERVK_113P62684 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
HERVK_113P62684 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
HERVK_113P62684 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
HERVK_113P62684 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
HERVK_113P62684 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
HERVK_113P62684 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
HERVK_113P62684 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
HERVK_113P62684 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
HERVK_113P62684 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
HERVK_113P62684 AL162457.2-201ENST00000447909 937 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
HERVK_113P62684 AP003396.3-201ENST00000530918 778 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
HERVK_113P62684 NTF4-201ENST00000593537 932 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
HERVK_113P62684 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
HERVK_113P62684 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
HERVK_113P62684 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
HERVK_113P62684 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
HERVK_113P62684 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
HERVK_113P62684 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
HERVK_113P62684 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
HERVK_113P62684 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
HERVK_113P62684 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
HERVK_113P62684 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
HERVK_113P62684 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
HERVK_113P62684 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
HERVK_113P62684 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
HERVK_113P62684 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
HERVK_113P62684 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
HERVK_113P62684 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
HERVK_113P62684 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
HERVK_113P62684 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
HERVK_113P62684 RABAC1-201ENST00000222008 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
HERVK_113P62684 PAFAH1B3-201ENST00000262890 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
HERVK_113P62684 RPA2-201ENST00000313433 1237 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
HERVK_113P62684 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
HERVK_113P62684 MRPL43-205ENST00000370234 798 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
HERVK_113P62684 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
HERVK_113P62684 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
HERVK_113P62684 AL117335.1-203ENST00000619200 948 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
HERVK_113P62684 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
HERVK_113P62684 RBFA-202ENST00000306735 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
HERVK_113P62684 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
HERVK_113P62684 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
HERVK_113P62684 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
HERVK_113P62684 YPEL3-202ENST00000398841 1588 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.7 ms