Protein–RNA interactions for Protein: P61758

VBP1, Prefoldin subunit 3, humanhuman

Predictions only

Length 197 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VBP1P61758 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
VBP1P61758 SLC10A3-202ENST00000369649 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
VBP1P61758 MOGS-205ENST00000452063 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
VBP1P61758 MAPKAP1-208ENST00000394063 2977 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
VBP1P61758 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
VBP1P61758 COBL-210ENST00000632460 1941 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
VBP1P61758 LINC00574-201ENST00000420557 2318 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
VBP1P61758 VPS51-201ENST00000279281 2714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
VBP1P61758 KCNB1-203ENST00000635465 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
VBP1P61758 SNAPC3-202ENST00000380821 5680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
VBP1P61758 GPD2-201ENST00000310454 6041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
VBP1P61758 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
VBP1P61758 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
VBP1P61758 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
VBP1P61758 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
VBP1P61758 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
VBP1P61758 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC17.02■□□□□ 0.32
VBP1P61758 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
VBP1P61758 AC004890.2-201ENST00000426347 2419 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
VBP1P61758 LENG8-202ENST00000376514 5146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
VBP1P61758 C17orf62-202ENST00000342572 1849 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
VBP1P61758 RBM17-201ENST00000379888 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
VBP1P61758 CBS-201ENST00000352178 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
VBP1P61758 LZTS3-203ENST00000360342 4055 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
VBP1P61758 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
VBP1P61758 DIP2A-205ENST00000466639 2711 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
VBP1P61758 SPECC1-203ENST00000395525 2536 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
VBP1P61758 LRRC58-201ENST00000295628 7903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
VBP1P61758 XYLT2-203ENST00000507602 2107 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
VBP1P61758 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
VBP1P61758 ANKMY1-202ENST00000361678 2499 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
VBP1P61758 PTPRU-202ENST00000373779 5579 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
VBP1P61758 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
VBP1P61758 CCDC43-201ENST00000315286 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
VBP1P61758 FAM69C-201ENST00000343998 3671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
VBP1P61758 CTSA-201ENST00000191018 1898 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
VBP1P61758 GLRB-201ENST00000264428 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
VBP1P61758 IRAK3-202ENST00000457197 1853 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
VBP1P61758 MYZAP-201ENST00000267853 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
VBP1P61758 ST8SIA5-201ENST00000315087 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
VBP1P61758 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
VBP1P61758 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
VBP1P61758 BHLHE41-201ENST00000242728 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
VBP1P61758 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
VBP1P61758 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
VBP1P61758 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC17.01■□□□□ 0.31
VBP1P61758 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
VBP1P61758 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
VBP1P61758 OBSL1-201ENST00000289656 2274 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
VBP1P61758 ELN-202ENST00000320399 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
VBP1P61758 PML-220ENST00000569477 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
VBP1P61758 RND2-202ENST00000587250 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
VBP1P61758 AD000671.2-201ENST00000589807 1925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
VBP1P61758 LEF1-201ENST00000265165 3068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
VBP1P61758 AC011474.1-201ENST00000582581 2582 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
VBP1P61758 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
VBP1P61758 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
VBP1P61758 HTATSF1-204ENST00000535601 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
VBP1P61758 MST1R-214ENST00000613534 2025 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
VBP1P61758 IL18BP-207ENST00000404792 2172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
VBP1P61758 BEND4-201ENST00000502486 8765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
VBP1P61758 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
VBP1P61758 SLC39A1-211ENST00000621013 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
VBP1P61758 TNFAIP1-202ENST00000544907 1656 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
VBP1P61758 HDAC10-222ENST00000626012 2607 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
VBP1P61758 C6orf118-201ENST00000230301 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
VBP1P61758 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC17■□□□□ 0.31
VBP1P61758 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
VBP1P61758 PCDHGC5-202ENST00000610789 2763 ntAPPRIS ALT2 BASIC17■□□□□ 0.31
VBP1P61758 DHX33-201ENST00000225296 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
VBP1P61758 LDLRAP1-201ENST00000374338 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
VBP1P61758 SERPINH1-215ENST00000533603 2299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
VBP1P61758 PCK2-205ENST00000558096 2433 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
VBP1P61758 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
VBP1P61758 PPP2R5B-201ENST00000164133 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
VBP1P61758 PGRMC2-207ENST00000520121 3785 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
VBP1P61758 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
VBP1P61758 POLR1D-220ENST00000637071 1943 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
VBP1P61758 SCARB2-201ENST00000264896 4792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
VBP1P61758 DENND6B-201ENST00000413817 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
VBP1P61758 HS3ST2-201ENST00000261374 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
VBP1P61758 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
VBP1P61758 AC135776.1-201ENST00000319817 2481 ntBASIC17■□□□□ 0.31
VBP1P61758 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
VBP1P61758 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
VBP1P61758 SPAG1-206ENST00000520643 1723 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
VBP1P61758 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
VBP1P61758 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
VBP1P61758 USP7-201ENST00000344836 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
VBP1P61758 UBFD1-201ENST00000395878 5110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
VBP1P61758 KHNYN-206ENST00000556842 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
VBP1P61758 ENPP1-201ENST00000360971 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
VBP1P61758 PHKA1-201ENST00000339490 6121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
VBP1P61758 AL645608.8-201ENST00000606034 2086 ntBASIC17■□□□□ 0.31
VBP1P61758 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
VBP1P61758 CCDC154-202ENST00000409671 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
VBP1P61758 IQSEC2-202ENST00000396435 6015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
VBP1P61758 TACC1-202ENST00000317827 7802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
VBP1P61758 AHSA2-202ENST00000394457 6574 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
VBP1P61758 CD1E-205ENST00000368160 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.4 ms