Protein–RNA interactions for Protein: P61587

RND3, Rho-related GTP-binding protein RhoE, humanhuman

Predictions only

Length 244 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RND3P61587 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
RND3P61587 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
RND3P61587 SREBF2-201ENST00000361204 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RND3P61587 ZNF394-201ENST00000337673 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RND3P61587 ATRIP-202ENST00000346691 2509 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RND3P61587 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RND3P61587 RASA4B-201ENST00000306682 2589 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RND3P61587 B3GNT9-201ENST00000449549 2917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RND3P61587 KLC1-217ENST00000554280 2426 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
RND3P61587 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RND3P61587 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RND3P61587 C21orf58-203ENST00000397680 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
RND3P61587 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RND3P61587 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
RND3P61587 SOST-201ENST00000301691 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RND3P61587 KRT6A-201ENST00000330722 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RND3P61587 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RND3P61587 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
RND3P61587 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RND3P61587 SCOC-208ENST00000510586 2193 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
RND3P61587 KIFC3-201ENST00000379655 3427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RND3P61587 PDE4A-202ENST00000344979 2579 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RND3P61587 SLC35A3-217ENST00000639807 2767 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
RND3P61587 CTNNBL1-204ENST00000405275 2076 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
RND3P61587 GSEC-201ENST00000626810 2289 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
RND3P61587 VPS37B-201ENST00000267202 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RND3P61587 AD000671.2-201ENST00000589807 1925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
RND3P61587 EIF2B5-201ENST00000273783 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RND3P61587 TAPT1-201ENST00000405303 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RND3P61587 C19orf54-203ENST00000470681 2521 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
RND3P61587 ANKRD13D-201ENST00000308440 2219 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
RND3P61587 FAM131A-202ENST00000340957 2421 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RND3P61587 MPP5-201ENST00000261681 5552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RND3P61587 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RND3P61587 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
RND3P61587 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
RND3P61587 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
RND3P61587 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
RND3P61587 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC15.62■□□□□ 0.09
RND3P61587 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
RND3P61587 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RND3P61587 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
RND3P61587 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
RND3P61587 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
RND3P61587 KLHDC10-201ENST00000335420 6437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RND3P61587 TJP3-205ENST00000587686 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RND3P61587 SLC5A10-204ENST00000395647 2140 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
RND3P61587 NOP9-202ENST00000396802 1942 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
RND3P61587 CD1E-205ENST00000368160 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RND3P61587 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
RND3P61587 RNF157-201ENST00000269391 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RND3P61587 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
RND3P61587 SLC35F5-201ENST00000245680 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RND3P61587 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RND3P61587 PCSK5-202ENST00000376767 2845 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
RND3P61587 B4GALT2-202ENST00000356836 2629 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
RND3P61587 ZNRF2-201ENST00000323037 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RND3P61587 HOXC11-201ENST00000243082 2039 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
RND3P61587 DACH1-202ENST00000613252 5233 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RND3P61587 SPERT-202ENST00000378966 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RND3P61587 FPGS-201ENST00000373225 2278 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
RND3P61587 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RND3P61587 SALRNA1-201ENST00000555871 2086 ntTSL 4 BASIC15.61■□□□□ 0.09
RND3P61587 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
RND3P61587 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RND3P61587 DIO1-217ENST00000617230 1656 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
RND3P61587 TTC22-201ENST00000371274 2149 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
RND3P61587 BORCS6-201ENST00000389017 2575 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
RND3P61587 GAS2L1P1-201ENST00000420145 1480 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
RND3P61587 UNKL-204ENST00000389221 5116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
RND3P61587 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RND3P61587 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RND3P61587 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RND3P61587 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
RND3P61587 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
RND3P61587 SLC39A5-201ENST00000266980 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RND3P61587 TRAPPC12-201ENST00000324266 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RND3P61587 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
RND3P61587 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
RND3P61587 C5orf30-203ENST00000515669 1573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
RND3P61587 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RND3P61587 POLR2C-201ENST00000219252 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RND3P61587 SLC35B2-207ENST00000619636 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RND3P61587 TCTN1-225ENST00000551590 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RND3P61587 SLC43A1-201ENST00000278426 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RND3P61587 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RND3P61587 SMG5-201ENST00000361813 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RND3P61587 PSMG4-209ENST00000473000 4603 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
RND3P61587 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
RND3P61587 AP003071.5-201ENST00000641568 2695 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
RND3P61587 JAKMIP1-202ENST00000409021 2975 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RND3P61587 FGFR3-202ENST00000340107 4293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RND3P61587 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RND3P61587 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RND3P61587 RBCK1-203ENST00000382181 2208 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RND3P61587 ADAMTS17-201ENST00000268070 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RND3P61587 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RND3P61587 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RND3P61587 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RND3P61587 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41 ms