Protein–RNA interactions for Protein: P57059

SIK1, Serine/threonine-protein kinase SIK1, humanhuman

Predictions only

Length 783 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIK1P57059 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
SIK1P57059 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
SIK1P57059 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SIK1P57059 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SIK1P57059 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SIK1P57059 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SIK1P57059 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SIK1P57059 IRF3-202ENST00000377135 1442 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SIK1P57059 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SIK1P57059 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SIK1P57059 TMEM42-201ENST00000302392 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SIK1P57059 ART5-201ENST00000359918 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SIK1P57059 CD1E-203ENST00000368156 861 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SIK1P57059 VKORC1-205ENST00000394975 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SIK1P57059 GSTZ1-218ENST00000557053 580 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SIK1P57059 AC005332.3-201ENST00000589904 676 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
SIK1P57059 AC010240.3-201ENST00000607688 395 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
SIK1P57059 CHMP4A-211ENST00000609024 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SIK1P57059 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SIK1P57059 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SIK1P57059 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SIK1P57059 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
SIK1P57059 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SIK1P57059 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SIK1P57059 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SIK1P57059 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
SIK1P57059 AL109659.2-201ENST00000606809 1674 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
SIK1P57059 CDK10-208ENST00000505473 1424 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SIK1P57059 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SIK1P57059 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SIK1P57059 ZNF414-201ENST00000255616 1178 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SIK1P57059 HDDC3-201ENST00000330334 1047 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SIK1P57059 KRTAP5-6-201ENST00000382160 561 ntAPPRIS P1 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SIK1P57059 KRT18P23-201ENST00000435622 1283 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
SIK1P57059 AL611929.1-201ENST00000457340 449 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SIK1P57059 MYD88-211ENST00000495303 976 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SIK1P57059 AC104819.1-201ENST00000504587 486 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
SIK1P57059 NOP16-205ENST00000509257 1000 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SIK1P57059 AC104390.1-201ENST00000555663 520 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
SIK1P57059 EFCAB11-211ENST00000556609 568 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SIK1P57059 AC026471.3-201ENST00000565137 578 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SIK1P57059 CALM3-211ENST00000598871 561 ntTSL 4 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SIK1P57059 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SIK1P57059 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SIK1P57059 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SIK1P57059 RBFADN-201ENST00000562391 1350 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SIK1P57059 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SIK1P57059 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SIK1P57059 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SIK1P57059 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SIK1P57059 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SIK1P57059 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SIK1P57059 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SIK1P57059 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SIK1P57059 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SIK1P57059 ARID3C-201ENST00000378909 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SIK1P57059 CFC1-203ENST00000621673 1444 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SIK1P57059 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SIK1P57059 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SIK1P57059 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SIK1P57059 AL360181.3-201ENST00000468317 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SIK1P57059 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SIK1P57059 TMEM89-201ENST00000330862 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SIK1P57059 NFIB-201ENST00000380921 1274 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SIK1P57059 SEC61G-203ENST00000415949 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SIK1P57059 AC007834.1-201ENST00000446473 728 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SIK1P57059 ZNF706-206ENST00000519744 785 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SIK1P57059 TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 609 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SIK1P57059 AC092338.2-202ENST00000567158 611 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SIK1P57059 PPP1R1B-208ENST00000580825 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SIK1P57059 AC090616.6-201ENST00000582640 721 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
SIK1P57059 MIR2117HG-201ENST00000588060 506 ntTSL 4 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SIK1P57059 AC138894.3-201ENST00000603787 634 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
SIK1P57059 AL390719.2-201ENST00000606993 987 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
SIK1P57059 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SIK1P57059 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SIK1P57059 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SIK1P57059 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SIK1P57059 KRT8P7-201ENST00000533003 1432 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
SIK1P57059 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SIK1P57059 AC008556.1-201ENST00000610908 2040 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
SIK1P57059 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SIK1P57059 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SIK1P57059 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SIK1P57059 CMTM1-204ENST00000336328 606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SIK1P57059 MRPL3P1-201ENST00000400109 1033 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
SIK1P57059 EEF1E1-202ENST00000429723 562 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SIK1P57059 KRT16P4-201ENST00000453883 522 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
SIK1P57059 PQLC2L-205ENST00000461040 563 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SIK1P57059 CMTM1-213ENST00000529506 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SIK1P57059 AC074051.2-201ENST00000565115 352 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
SIK1P57059 TK1-205ENST00000590862 642 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SIK1P57059 AC008878.2-201ENST00000601870 942 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SIK1P57059 AL121912.1-201ENST00000603683 238 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
SIK1P57059 H2BFWT-202ENST00000611083 528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SIK1P57059 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SIK1P57059 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SIK1P57059 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SIK1P57059 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SIK1P57059 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.4 ms