Protein–RNA interactions for Protein: P55212

CASP6, Caspase-6, humanhuman

Predictions only

Length 293 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASP6P55212 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
CASP6P55212 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
CASP6P55212 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
CASP6P55212 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
CASP6P55212 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
CASP6P55212 AC093901.1-201ENST00000414886 778 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
CASP6P55212 AP000347.1-209ENST00000437294 557 ntTSL 4 BASIC17.02■□□□□ 0.32
CASP6P55212 DUSP5P1-201ENST00000441325 1139 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
CASP6P55212 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
CASP6P55212 PTK2-216ENST00000519881 863 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
CASP6P55212 LY6E-209ENST00000521003 740 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
CASP6P55212 NT5C-210ENST00000582160 860 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
CASP6P55212 GFOD2-207ENST00000602855 819 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
CASP6P55212 IQSEC2-218ENST00000640694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
CASP6P55212 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
CASP6P55212 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
CASP6P55212 SYT15-202ENST00000374323 6428 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
CASP6P55212 PTGER3-202ENST00000351052 1404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
CASP6P55212 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
CASP6P55212 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
CASP6P55212 ZBTB46-203ENST00000395104 5198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
CASP6P55212 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.31
CASP6P55212 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
CASP6P55212 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
CASP6P55212 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
CASP6P55212 ZDHHC20-201ENST00000320220 1351 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
CASP6P55212 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
CASP6P55212 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
CASP6P55212 CACNA1A-215ENST00000635727 7536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CASP6P55212 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CASP6P55212 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CASP6P55212 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CASP6P55212 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CASP6P55212 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CASP6P55212 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CASP6P55212 RNF144A-201ENST00000320892 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CASP6P55212 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CASP6P55212 NEURL2-201ENST00000372518 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CASP6P55212 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CASP6P55212 SPEG-204ENST00000396689 1274 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CASP6P55212 UBE2J2-205ENST00000400930 1021 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CASP6P55212 AC026396.1-201ENST00000419388 421 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
CASP6P55212 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CASP6P55212 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CASP6P55212 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CASP6P55212 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CASP6P55212 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CASP6P55212 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CASP6P55212 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CASP6P55212 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CASP6P55212 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CASP6P55212 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CASP6P55212 TLE4-205ENST00000376544 4871 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CASP6P55212 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
CASP6P55212 AKIRIN1-201ENST00000372984 1330 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
CASP6P55212 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
CASP6P55212 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CASP6P55212 ARID3A-201ENST00000263620 5941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CASP6P55212 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CASP6P55212 PXMP4-201ENST00000217398 979 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
CASP6P55212 RBFA-202ENST00000306735 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CASP6P55212 OR10H5-201ENST00000308940 1132 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
CASP6P55212 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CASP6P55212 MUC1-204ENST00000343256 648 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CASP6P55212 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
CASP6P55212 AL359747.1-201ENST00000442370 536 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
CASP6P55212 HOXB-AS3-203ENST00000465846 434 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
CASP6P55212 EHMT1-211ENST00000482340 691 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
CASP6P55212 CSRP1-214ENST00000531916 890 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
CASP6P55212 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CASP6P55212 AC010463.1-201ENST00000596542 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
CASP6P55212 VPS72-207ENST00000640458 689 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
CASP6P55212 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
CASP6P55212 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CASP6P55212 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
CASP6P55212 TRABD-201ENST00000303434 2329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CASP6P55212 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CASP6P55212 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CASP6P55212 FAM69B-201ENST00000371691 2410 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CASP6P55212 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CASP6P55212 GRAMD2B-219ENST00000544396 2822 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CASP6P55212 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CASP6P55212 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CASP6P55212 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CASP6P55212 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CASP6P55212 MAGED2-213ENST00000627068 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CASP6P55212 FXN-203ENST00000396366 922 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CASP6P55212 KRTAP5-10-201ENST00000398531 1176 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CASP6P55212 LINC00421-201ENST00000413833 1054 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CASP6P55212 BECN2-201ENST00000419583 1296 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CASP6P55212 BCL2L12-208ENST00000600947 633 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CASP6P55212 AC215522.2-202ENST00000633163 1143 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CASP6P55212 SPACA6-213ENST00000637797 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CASP6P55212 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CASP6P55212 AGPAT2-205ENST00000538402 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CASP6P55212 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CASP6P55212 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CASP6P55212 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CASP6P55212 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CASP6P55212 TLNRD1-201ENST00000267984 4845 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.9 ms