Protein–RNA interactions for Protein: P55210

CASP7, Caspase-7, humanhuman

Predictions only

Length 303 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASP7P55210 MATN4-201ENST00000353917 1657 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CASP7P55210 GUCA1A-205ENST00000541991 1921 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CASP7P55210 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CASP7P55210 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CASP7P55210 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CASP7P55210 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CASP7P55210 ABCD4-228ENST00000557588 763 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CASP7P55210 EEF2KMT-206ENST00000587133 873 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CASP7P55210 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CASP7P55210 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CASP7P55210 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CASP7P55210 RAP1GDS1-201ENST00000264572 1686 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CASP7P55210 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CASP7P55210 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CASP7P55210 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CASP7P55210 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CASP7P55210 DDRGK1-202ENST00000380201 1128 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CASP7P55210 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CASP7P55210 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CASP7P55210 IMP3-202ENST00000403490 1237 ntAPPRIS P1 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CASP7P55210 AC112907.2-201ENST00000448639 330 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
CASP7P55210 MOK-234ENST00000524370 1165 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CASP7P55210 C17orf49-208ENST00000552402 760 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CASP7P55210 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CASP7P55210 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CASP7P55210 NUDT17-201ENST00000334513 1473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CASP7P55210 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CASP7P55210 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CASP7P55210 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CASP7P55210 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CASP7P55210 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CASP7P55210 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CASP7P55210 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CASP7P55210 GPR32-201ENST00000270590 1269 ntAPPRIS P1 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CASP7P55210 ISCA1-202ENST00000326094 1264 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CASP7P55210 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CASP7P55210 COPS8-203ENST00000409334 794 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CASP7P55210 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CASP7P55210 RPL26L1-205ENST00000519974 695 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CASP7P55210 LY6E-213ENST00000522528 606 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CASP7P55210 AC024243.1-201ENST00000609234 778 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
CASP7P55210 AC068587.9-201ENST00000641814 219 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
CASP7P55210 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CASP7P55210 GAMT-202ENST00000447102 1769 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CASP7P55210 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CASP7P55210 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CASP7P55210 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CASP7P55210 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CASP7P55210 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CASP7P55210 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CASP7P55210 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CASP7P55210 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CASP7P55210 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CASP7P55210 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CASP7P55210 AC003075.1-204ENST00000433005 540 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CASP7P55210 ZNF534-205ENST00000617900 1085 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CASP7P55210 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CASP7P55210 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
CASP7P55210 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CASP7P55210 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CASP7P55210 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CASP7P55210 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CASP7P55210 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CASP7P55210 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CASP7P55210 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CASP7P55210 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CASP7P55210 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CASP7P55210 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CASP7P55210 PBXIP1-201ENST00000368460 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CASP7P55210 PTK2-216ENST00000519881 863 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CASP7P55210 AC127526.4-201ENST00000527970 983 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CASP7P55210 RNASET2-213ENST00000611959 1124 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CASP7P55210 AC005332.1-201ENST00000577698 1310 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
CASP7P55210 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CASP7P55210 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CASP7P55210 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CASP7P55210 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CASP7P55210 AC012615.6-201ENST00000593201 1697 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CASP7P55210 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CASP7P55210 OSR2-201ENST00000297565 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CASP7P55210 CHTOP-207ENST00000614256 1840 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CASP7P55210 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CASP7P55210 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CASP7P55210 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CASP7P55210 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CASP7P55210 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CASP7P55210 UBE2C-204ENST00000356455 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CASP7P55210 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CASP7P55210 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CASP7P55210 C16orf91-201ENST00000442039 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CASP7P55210 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
CASP7P55210 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CASP7P55210 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CASP7P55210 AC116407.4-201ENST00000623319 1061 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
CASP7P55210 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CASP7P55210 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CASP7P55210 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CASP7P55210 PFDN6-206ENST00000463584 1915 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.35
CASP7P55210 GPR83-202ENST00000539203 1909 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.35
CASP7P55210 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.8 ms