Protein–RNA interactions for Protein: P54284

CACNB3, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit beta-3, humanhuman

Predictions only

Length 484 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNB3P54284 ING5-202ENST00000406941 946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CACNB3P54284 CYHR1-203ENST00000424149 1162 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CACNB3P54284 LINC01534-202ENST00000433232 554 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CACNB3P54284 AC079385.1-201ENST00000551505 570 ntTSL 4 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CACNB3P54284 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CACNB3P54284 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CACNB3P54284 DTNBP1-203ENST00000355917 1359 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CACNB3P54284 AC016734.2-201ENST00000624325 1377 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
CACNB3P54284 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CACNB3P54284 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CACNB3P54284 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CACNB3P54284 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CACNB3P54284 AC010655.4-201ENST00000462662 707 ntTSL 4 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CACNB3P54284 AC125616.1-201ENST00000540369 1015 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CACNB3P54284 HOXB8-203ENST00000576562 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CACNB3P54284 IGFLR1-209ENST00000592537 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CACNB3P54284 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
CACNB3P54284 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CACNB3P54284 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CACNB3P54284 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CACNB3P54284 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CACNB3P54284 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CACNB3P54284 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
CACNB3P54284 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CACNB3P54284 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CACNB3P54284 DCTN3-201ENST00000259632 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CACNB3P54284 BEX1-201ENST00000372728 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CACNB3P54284 MPIG6B-205ENST00000375810 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CACNB3P54284 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CACNB3P54284 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CACNB3P54284 PRAP1-202ENST00000463201 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CACNB3P54284 SKP2-204ENST00000508514 821 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CACNB3P54284 CLDN7-204ENST00000571881 735 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CACNB3P54284 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CACNB3P54284 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CACNB3P54284 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CACNB3P54284 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CACNB3P54284 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CACNB3P54284 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CACNB3P54284 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.19
CACNB3P54284 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
CACNB3P54284 PTPRK-218ENST00000525459 1722 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.19
CACNB3P54284 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
CACNB3P54284 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
CACNB3P54284 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CACNB3P54284 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CACNB3P54284 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CACNB3P54284 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CACNB3P54284 HIST1H2AI-201ENST00000358739 503 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CACNB3P54284 EFCAB2-203ENST00000366523 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CACNB3P54284 AC093901.1-201ENST00000414886 778 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CACNB3P54284 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CACNB3P54284 AP002383.4-201ENST00000442518 975 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
CACNB3P54284 TSSC2-201ENST00000450217 709 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
CACNB3P54284 MTG1-205ENST00000477902 1283 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CACNB3P54284 C7orf49-209ENST00000483029 596 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CACNB3P54284 RPL26L1-205ENST00000519974 695 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CACNB3P54284 MIR3180-1-201ENST00000580374 94 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
CACNB3P54284 MIR3180-3-201ENST00000584616 94 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
CACNB3P54284 CCDC106-206ENST00000591241 1153 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CACNB3P54284 AC010463.1-201ENST00000596542 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CACNB3P54284 AC092329.2-201ENST00000598402 547 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
CACNB3P54284 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CACNB3P54284 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CACNB3P54284 C6orf203-202ENST00000405204 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CACNB3P54284 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CACNB3P54284 MCTP2-205ENST00000543482 1422 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CACNB3P54284 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CACNB3P54284 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CACNB3P54284 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CACNB3P54284 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CACNB3P54284 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CACNB3P54284 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CACNB3P54284 RAB28-202ENST00000330852 1715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CACNB3P54284 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CACNB3P54284 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CACNB3P54284 MAP3K7CL-206ENST00000399928 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CACNB3P54284 AC013402.1-201ENST00000456999 561 ntTSL 4 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CACNB3P54284 PGAP2-206ENST00000459679 795 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CACNB3P54284 RPLP0-219ENST00000551150 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CACNB3P54284 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CACNB3P54284 AC015961.2-201ENST00000589281 701 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CACNB3P54284 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CACNB3P54284 AC012366.1-201ENST00000615411 473 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CACNB3P54284 ADORA1-208ENST00000618295 862 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CACNB3P54284 KCNE1B-204ENST00000623803 811 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CACNB3P54284 AC112497.1-201ENST00000624824 639 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
CACNB3P54284 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CACNB3P54284 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CACNB3P54284 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
CACNB3P54284 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CACNB3P54284 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CACNB3P54284 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CACNB3P54284 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CACNB3P54284 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CACNB3P54284 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CACNB3P54284 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CACNB3P54284 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CACNB3P54284 TMEM91-210ENST00000542945 1610 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CACNB3P54284 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.8 ms