Protein–RNA interactions for Protein: P51884

LUM, Lumican, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 338 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LUMP51884 LANCL3-201ENST00000378619 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
LUMP51884 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
LUMP51884 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
LUMP51884 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
LUMP51884 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
LUMP51884 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
LUMP51884 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
LUMP51884 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
LUMP51884 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
LUMP51884 ZNF133-210ENST00000535822 2341 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
LUMP51884 CCT7-215ENST00000539919 2031 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
LUMP51884 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
LUMP51884 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
LUMP51884 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
LUMP51884 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
LUMP51884 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
LUMP51884 PTP4A3-202ENST00000349124 2710 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
LUMP51884 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
LUMP51884 WIZP1-201ENST00000531444 2299 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
LUMP51884 RAB22A-201ENST00000244040 8670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
LUMP51884 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
LUMP51884 QPRT-202ENST00000395384 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
LUMP51884 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.18
LUMP51884 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
LUMP51884 PIF1-205ENST00000559239 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
LUMP51884 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
LUMP51884 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
LUMP51884 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
LUMP51884 AC127496.1-202ENST00000573602 2091 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
LUMP51884 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
LUMP51884 ADRA1A-201ENST00000276393 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
LUMP51884 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
LUMP51884 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
LUMP51884 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
LUMP51884 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
LUMP51884 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
LUMP51884 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
LUMP51884 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
LUMP51884 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
LUMP51884 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
LUMP51884 PTEN-201ENST00000371953 9027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
LUMP51884 MAPKAPK3-201ENST00000357955 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
LUMP51884 KCTD20-202ENST00000373731 5619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
LUMP51884 SH2D3C-203ENST00000373277 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
LUMP51884 PGM5-202ENST00000396396 3338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
LUMP51884 SQSTM1-202ENST00000389805 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
LUMP51884 GAB1-201ENST00000262994 2648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
LUMP51884 KCNH2-203ENST00000430723 2648 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
LUMP51884 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
LUMP51884 PDZD3-202ENST00000355547 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
LUMP51884 CBS-203ENST00000398158 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
LUMP51884 CBSL-206ENST00000624406 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
LUMP51884 PPP1R18-201ENST00000274853 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
LUMP51884 PPP1R18-205ENST00000615527 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
LUMP51884 NCOA6-207ENST00000616167 3271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
LUMP51884 ENC1-201ENST00000302351 5520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
LUMP51884 BSG-201ENST00000333511 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
LUMP51884 ACTN3-203ENST00000513398 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
LUMP51884 KCNMA1-261ENST00000639486 8850 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
LUMP51884 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
LUMP51884 PARP12-201ENST00000263549 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
LUMP51884 TSPAN17-201ENST00000298564 2810 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
LUMP51884 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
LUMP51884 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
LUMP51884 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
LUMP51884 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
LUMP51884 GCDH-216ENST00000591470 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
LUMP51884 PDCD7-201ENST00000204549 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
LUMP51884 ITGA9-201ENST00000264741 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
LUMP51884 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
LUMP51884 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
LUMP51884 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
LUMP51884 PARD3-205ENST00000374773 3420 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
LUMP51884 PYGL-201ENST00000216392 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
LUMP51884 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
LUMP51884 TCEA1-208ENST00000521604 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
LUMP51884 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
LUMP51884 ADPGK-AS1-201ENST00000563592 2730 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
LUMP51884 ADGRG2-202ENST00000354791 4494 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
LUMP51884 C6orf132-201ENST00000341865 6210 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
LUMP51884 PTGER3-201ENST00000306666 2333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
LUMP51884 FZR1-203ENST00000441788 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
LUMP51884 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
LUMP51884 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
LUMP51884 TAOK2-202ENST00000308893 5169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
LUMP51884 NOL4L-211ENST00000621426 6577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
LUMP51884 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
LUMP51884 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
LUMP51884 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
LUMP51884 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
LUMP51884 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
LUMP51884 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
LUMP51884 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
LUMP51884 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
LUMP51884 BEND4-201ENST00000502486 8765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
LUMP51884 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
LUMP51884 ZNF853-201ENST00000457543 3857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
LUMP51884 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
LUMP51884 LRRC43-201ENST00000339777 2028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
LUMP51884 SLC47A2-201ENST00000325411 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54 ms