Protein–RNA interactions for Protein: P50897

PPT1, Palmitoyl-protein thioesterase 1, humanhuman

Predictions only

Length 306 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPT1P50897 AC073592.3-201ENST00000625118 1834 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
PPT1P50897 CRAMP1-202ENST00000397412 7772 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PPT1P50897 MON2-203ENST00000546600 6130 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PPT1P50897 NFATC4-231ENST00000557451 5613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PPT1P50897 SHANK1-204ENST00000391814 6622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PPT1P50897 AP001273.2-201ENST00000638767 2993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PPT1P50897 VASN-201ENST00000304735 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PPT1P50897 DOK4-201ENST00000340099 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PPT1P50897 ZNF416-201ENST00000196489 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PPT1P50897 DKC1-201ENST00000369550 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PPT1P50897 MDGA2-202ENST00000399232 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PPT1P50897 MIB1-201ENST00000261537 9576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PPT1P50897 NEXN-AS1-201ENST00000421331 2292 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PPT1P50897 AC005498.3-201ENST00000596587 2045 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PPT1P50897 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PPT1P50897 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
PPT1P50897 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PPT1P50897 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PPT1P50897 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PPT1P50897 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PPT1P50897 ZBTB10-203ENST00000430430 10132 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PPT1P50897 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PPT1P50897 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PPT1P50897 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PPT1P50897 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PPT1P50897 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PPT1P50897 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PPT1P50897 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PPT1P50897 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
PPT1P50897 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PPT1P50897 GGT5-201ENST00000263112 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PPT1P50897 SLC47A2-202ENST00000350657 2285 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PPT1P50897 MEPCE-202ENST00000414441 2261 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PPT1P50897 WIF1-201ENST00000286574 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PPT1P50897 SLC39A1-210ENST00000617697 2214 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PPT1P50897 PRPF19-201ENST00000227524 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PPT1P50897 WSCD1-209ENST00000574232 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PPT1P50897 PRRT2-212ENST00000636619 2065 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PPT1P50897 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PPT1P50897 TEFM-205ENST00000581216 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PPT1P50897 GHDC-212ENST00000593209 1827 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PPT1P50897 PPP2R5B-201ENST00000164133 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PPT1P50897 CICP6-201ENST00000457191 2729 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
PPT1P50897 XRCC3-201ENST00000352127 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PPT1P50897 RELL2-201ENST00000297164 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PPT1P50897 ZFP90-203ENST00000563169 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PPT1P50897 CD40-201ENST00000372276 1623 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PPT1P50897 OGFR-201ENST00000290291 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PPT1P50897 RASL10B-201ENST00000603017 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PPT1P50897 ZNF385A-212ENST00000551109 2369 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PPT1P50897 DNM1P34-201ENST00000567292 2276 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PPT1P50897 LYNX1-206ENST00000621401 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PPT1P50897 TUBA4A-201ENST00000248437 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PPT1P50897 DDX17-211ENST00000640332 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PPT1P50897 DDX17-212ENST00000640668 2196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PPT1P50897 PRSS36-201ENST00000268281 2840 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PPT1P50897 ADGRB2-206ENST00000398556 4879 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PPT1P50897 TACC3-201ENST00000313288 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PPT1P50897 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PPT1P50897 PPFIA3-201ENST00000334186 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PPT1P50897 NFATC4-228ENST00000556759 2025 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PPT1P50897 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PPT1P50897 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PPT1P50897 SEPHS1-201ENST00000327347 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PPT1P50897 CACNA1A-238ENST00000637276 7135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PPT1P50897 CRAMP1-201ENST00000293925 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PPT1P50897 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PPT1P50897 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PPT1P50897 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PPT1P50897 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PPT1P50897 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PPT1P50897 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PPT1P50897 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PPT1P50897 DYM-201ENST00000269445 5049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PPT1P50897 AL139130.1-201ENST00000451362 5586 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PPT1P50897 RGS12-203ENST00000344733 5469 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PPT1P50897 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PPT1P50897 SPATC1L-201ENST00000291672 2303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PPT1P50897 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PPT1P50897 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PPT1P50897 ZNF668-201ENST00000300849 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PPT1P50897 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PPT1P50897 PIF1-201ENST00000268043 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PPT1P50897 DVL2-209ENST00000575458 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PPT1P50897 ATP1B1-202ENST00000367816 2608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PPT1P50897 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PPT1P50897 ARHGAP27-214ENST00000532891 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PPT1P50897 CCDC154-202ENST00000409671 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PPT1P50897 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
PPT1P50897 ALDOC-201ENST00000226253 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
PPT1P50897 LBX1-201ENST00000370193 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
PPT1P50897 TXNRD3-202ENST00000523403 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
PPT1P50897 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
PPT1P50897 SAMD11-216ENST00000620200 1874 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
PPT1P50897 C18orf63-201ENST00000579455 5127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
PPT1P50897 SH3BP2-202ENST00000435136 2318 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
PPT1P50897 HASPIN-201ENST00000325418 2797 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.04
PPT1P50897 KIF16B-203ENST00000408042 4640 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
PPT1P50897 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
PPT1P50897 AK1-203ENST00000373176 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.6 ms