Protein–RNA interactions for Protein: P49759

CLK1, Dual specificity protein kinase CLK1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 484 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLK1P49759 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CLK1P49759 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CLK1P49759 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CLK1P49759 TFCP2-204ENST00000548115 1862 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CLK1P49759 LONRF1-208ENST00000533751 3043 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CLK1P49759 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CLK1P49759 SLCO4A1-201ENST00000217159 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CLK1P49759 NLGN2-201ENST00000302926 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CLK1P49759 ZNF385A-202ENST00000352268 2076 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CLK1P49759 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CLK1P49759 MYH14-203ENST00000425460 6811 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CLK1P49759 DTX2-211ENST00000446600 2281 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CLK1P49759 LRCH3-207ENST00000441090 2034 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CLK1P49759 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CLK1P49759 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CLK1P49759 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CLK1P49759 MYH14-202ENST00000376970 6787 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CLK1P49759 AC011416.4-201ENST00000639283 2195 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CLK1P49759 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CLK1P49759 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CLK1P49759 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CLK1P49759 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CLK1P49759 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CLK1P49759 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CLK1P49759 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CLK1P49759 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CLK1P49759 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CLK1P49759 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CLK1P49759 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CLK1P49759 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CLK1P49759 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CLK1P49759 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CLK1P49759 COMP-202ENST00000425807 2292 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CLK1P49759 RETREG1-201ENST00000306320 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CLK1P49759 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CLK1P49759 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CLK1P49759 DCLK2-207ENST00000635524 2153 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CLK1P49759 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CLK1P49759 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CLK1P49759 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CLK1P49759 GALNT14-202ENST00000349752 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CLK1P49759 FMR1-207ENST00000439526 3699 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CLK1P49759 AC107464.1-203ENST00000468356 2120 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CLK1P49759 WNK2-201ENST00000297954 7138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CLK1P49759 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CLK1P49759 CROCCP3-202ENST00000420820 1947 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
CLK1P49759 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CLK1P49759 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CLK1P49759 KIFC3-201ENST00000379655 3427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CLK1P49759 CHTOP-201ENST00000368686 2250 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CLK1P49759 LRRC58-201ENST00000295628 7903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CLK1P49759 PPP2R2B-203ENST00000394411 2071 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CLK1P49759 EVI5L-201ENST00000270530 3855 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CLK1P49759 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CLK1P49759 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CLK1P49759 MAGI1-213ENST00000483466 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CLK1P49759 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CLK1P49759 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CLK1P49759 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CLK1P49759 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CLK1P49759 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CLK1P49759 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CLK1P49759 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CLK1P49759 TFEB-203ENST00000358871 2188 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CLK1P49759 MYO1B-204ENST00000392318 5082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CLK1P49759 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CLK1P49759 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CLK1P49759 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CLK1P49759 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CLK1P49759 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CLK1P49759 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CLK1P49759 ADGRB2-201ENST00000373655 5400 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CLK1P49759 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CLK1P49759 PPP1R3F-202ENST00000376188 2443 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CLK1P49759 AC009113.1-201ENST00000570267 2443 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
CLK1P49759 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CLK1P49759 COQ10B-201ENST00000263960 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CLK1P49759 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CLK1P49759 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CLK1P49759 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CLK1P49759 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CLK1P49759 AC020916.1-201ENST00000587762 1774 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
CLK1P49759 LINC01168-201ENST00000461291 5254 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CLK1P49759 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CLK1P49759 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CLK1P49759 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CLK1P49759 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CLK1P49759 THAP12-201ENST00000260045 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CLK1P49759 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CLK1P49759 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CLK1P49759 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CLK1P49759 ZNF419-204ENST00000415379 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
CLK1P49759 MAFK-201ENST00000343242 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
CLK1P49759 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
CLK1P49759 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
CLK1P49759 RTEL1-204ENST00000370003 2273 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
CLK1P49759 P2RY6-208ENST00000540124 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CLK1P49759 PGLYRP2-202ENST00000340880 2230 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CLK1P49759 KLHL23-201ENST00000272797 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CLK1P49759 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.7 ms