Protein–RNA interactions for Protein: P49005

POLD2, DNA polymerase delta subunit 2, humanhuman

Predictions only

Length 469 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLD2P49005 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
POLD2P49005 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
POLD2P49005 ACTR3B-203ENST00000397282 1692 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
POLD2P49005 DLG3-202ENST00000374355 5074 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
POLD2P49005 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
POLD2P49005 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
POLD2P49005 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
POLD2P49005 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
POLD2P49005 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
POLD2P49005 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
POLD2P49005 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
POLD2P49005 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
POLD2P49005 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
POLD2P49005 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
POLD2P49005 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
POLD2P49005 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
POLD2P49005 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
POLD2P49005 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
POLD2P49005 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC19.13■□□□□ 0.65
POLD2P49005 AC008040.2-201ENST00000461049 708 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
POLD2P49005 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
POLD2P49005 STAC3-202ENST00000546246 1014 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
POLD2P49005 PHOSPHO2-206ENST00000616481 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
POLD2P49005 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
POLD2P49005 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC19.13■□□□□ 0.65
POLD2P49005 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
POLD2P49005 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
POLD2P49005 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
POLD2P49005 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
POLD2P49005 FSCN1P1-201ENST00000568912 1481 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
POLD2P49005 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
POLD2P49005 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
POLD2P49005 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
POLD2P49005 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
POLD2P49005 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
POLD2P49005 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
POLD2P49005 ZNF280B-203ENST00000626650 5721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
POLD2P49005 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
POLD2P49005 IL10RB-201ENST00000290200 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
POLD2P49005 CBSL-210ENST00000624934 1992 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
POLD2P49005 ST3GAL3-206ENST00000351035 2377 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
POLD2P49005 PRMT5-204ENST00000397441 2418 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
POLD2P49005 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
POLD2P49005 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
POLD2P49005 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
POLD2P49005 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
POLD2P49005 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
POLD2P49005 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
POLD2P49005 NFKBIZ-201ENST00000326151 2058 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
POLD2P49005 NRXN1-208ENST00000405472 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
POLD2P49005 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
POLD2P49005 FEM1AP3-201ENST00000403722 1741 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
POLD2P49005 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
POLD2P49005 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
POLD2P49005 TRAK2-202ENST00000430254 1436 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
POLD2P49005 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
POLD2P49005 KLF13-201ENST00000307145 6825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
POLD2P49005 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
POLD2P49005 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
POLD2P49005 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
POLD2P49005 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
POLD2P49005 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
POLD2P49005 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
POLD2P49005 SH2B1-202ENST00000337120 6043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
POLD2P49005 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
POLD2P49005 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
POLD2P49005 NPTX1-201ENST00000306773 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
POLD2P49005 DOLPP1-203ENST00000406974 2037 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
POLD2P49005 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
POLD2P49005 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
POLD2P49005 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
POLD2P49005 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
POLD2P49005 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
POLD2P49005 DEF8-211ENST00000563795 1767 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
POLD2P49005 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
POLD2P49005 WWOX-205ENST00000539474 1670 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
POLD2P49005 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
POLD2P49005 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
POLD2P49005 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
POLD2P49005 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
POLD2P49005 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
POLD2P49005 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
POLD2P49005 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC19.11■□□□□ 0.65
POLD2P49005 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
POLD2P49005 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
POLD2P49005 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
POLD2P49005 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
POLD2P49005 TINAGL1-202ENST00000457433 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
POLD2P49005 AL160286.2-201ENST00000567150 934 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
POLD2P49005 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
POLD2P49005 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
POLD2P49005 AC130371.2-201ENST00000619443 611 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
POLD2P49005 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC19.11■□□□□ 0.65
POLD2P49005 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
POLD2P49005 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
POLD2P49005 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
POLD2P49005 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
POLD2P49005 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
POLD2P49005 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
POLD2P49005 GPRIN2-201ENST00000374314 1696 ntAPPRIS P1 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.7 ms