Protein–RNA interactions for Protein: P48163

ME1, NADP-dependent malic enzyme, humanhuman

Predictions only

Length 572 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ME1P48163 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
ME1P48163 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
ME1P48163 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
ME1P48163 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
ME1P48163 SEPHS1-206ENST00000545675 2988 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
ME1P48163 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
ME1P48163 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
ME1P48163 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
ME1P48163 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC21.72■■□□□ 1.07
ME1P48163 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
ME1P48163 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
ME1P48163 EPB41L2-211ENST00000525271 2568 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
ME1P48163 ATP1B1-202ENST00000367816 2608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
ME1P48163 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
ME1P48163 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
ME1P48163 RAPH1-211ENST00000457812 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
ME1P48163 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
ME1P48163 IRS2-201ENST00000375856 8138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
ME1P48163 ZNF668-208ENST00000538906 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
ME1P48163 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
ME1P48163 CHRNA4-207ENST00000615287 5643 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
ME1P48163 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
ME1P48163 GCH1-207ENST00000622544 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
ME1P48163 NUMBL-202ENST00000540131 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
ME1P48163 SLC12A4-201ENST00000316341 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
ME1P48163 TEKT5-201ENST00000283025 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
ME1P48163 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
ME1P48163 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
ME1P48163 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
ME1P48163 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
ME1P48163 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
ME1P48163 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
ME1P48163 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
ME1P48163 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
ME1P48163 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
ME1P48163 AC083906.6-201ENST00000641366 219 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
ME1P48163 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
ME1P48163 CACTIN-201ENST00000221899 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
ME1P48163 PRSS33-201ENST00000293851 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
ME1P48163 CD55-206ENST00000391921 2433 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
ME1P48163 GDF10-201ENST00000580279 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
ME1P48163 ETS1-208ENST00000535549 4594 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
ME1P48163 BMP2K-208ENST00000628286 3848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
ME1P48163 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
ME1P48163 GAS2L1P1-201ENST00000420145 1480 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
ME1P48163 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
ME1P48163 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
ME1P48163 ARHGAP22-203ENST00000374172 2380 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.07
ME1P48163 TSHZ3-201ENST00000240587 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
ME1P48163 TFEB-203ENST00000358871 2188 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
ME1P48163 ENTPD8-202ENST00000371506 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
ME1P48163 BEGAIN-202ENST00000443071 2744 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
ME1P48163 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
ME1P48163 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
ME1P48163 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
ME1P48163 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
ME1P48163 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
ME1P48163 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC21.7■■□□□ 1.06
ME1P48163 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
ME1P48163 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
ME1P48163 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
ME1P48163 HEXDC-203ENST00000577944 1820 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
ME1P48163 AD000671.2-201ENST00000589807 1925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
ME1P48163 PCDHAC2-201ENST00000289269 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
ME1P48163 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
ME1P48163 CHRND-201ENST00000258385 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
ME1P48163 TCAP-201ENST00000309889 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
ME1P48163 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
ME1P48163 TTLL3-209ENST00000426895 2767 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
ME1P48163 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
ME1P48163 ANKS1A-201ENST00000360359 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
ME1P48163 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
ME1P48163 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
ME1P48163 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
ME1P48163 ASIC3-202ENST00000349064 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
ME1P48163 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
ME1P48163 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
ME1P48163 CLK1-205ENST00000434813 2026 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
ME1P48163 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
ME1P48163 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
ME1P48163 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC21.69■■□□□ 1.06
ME1P48163 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
ME1P48163 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.69■■□□□ 1.06
ME1P48163 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
ME1P48163 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
ME1P48163 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
ME1P48163 MFHAS1-201ENST00000276282 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
ME1P48163 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
ME1P48163 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
ME1P48163 COMP-202ENST00000425807 2292 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
ME1P48163 TSC22D4-202ENST00000393991 1469 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
ME1P48163 WWOX-214ENST00000566780 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
ME1P48163 ANKS3-201ENST00000304283 2662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
ME1P48163 CADPS2-201ENST00000313070 6065 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
ME1P48163 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
ME1P48163 ENTPD6-202ENST00000360031 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
ME1P48163 ZNF74-203ENST00000403682 2789 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
ME1P48163 VAV1-204ENST00000596764 2775 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
ME1P48163 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
ME1P48163 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 79.4 ms