Protein–RNA interactions for Protein: P43699

NKX2-1, Homeobox protein Nkx-2.1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 371 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NKX2-1P43699 NOL4L-211ENST00000621426 6577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
NKX2-1P43699 GBGT1-203ENST00000372040 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NKX2-1P43699 CRHR2-207ENST00000471646 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NKX2-1P43699 PHRF1-202ENST00000413872 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NKX2-1P43699 TCF4-201ENST00000354452 3482 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
NKX2-1P43699 B3GNT9-201ENST00000449549 2917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NKX2-1P43699 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
NKX2-1P43699 SEPT2-245ENST00000616972 3446 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
NKX2-1P43699 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NKX2-1P43699 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NKX2-1P43699 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NKX2-1P43699 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC15.53■□□□□ 0.08
NKX2-1P43699 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
NKX2-1P43699 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.53■□□□□ 0.08
NKX2-1P43699 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
NKX2-1P43699 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
NKX2-1P43699 AC083906.6-201ENST00000641366 219 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
NKX2-1P43699 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NKX2-1P43699 ARHGAP35-201ENST00000404338 8889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NKX2-1P43699 NCOA6-207ENST00000616167 3271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
NKX2-1P43699 ZNF131-206ENST00000505606 3209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
NKX2-1P43699 CD276-201ENST00000318424 2738 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
NKX2-1P43699 SCARB1-203ENST00000415380 2731 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
NKX2-1P43699 RGS3-231ENST00000613049 1726 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NKX2-1P43699 AC135782.1-201ENST00000537498 2154 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
NKX2-1P43699 RABL6-201ENST00000311502 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NKX2-1P43699 MAPKAPK3-208ENST00000621469 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NKX2-1P43699 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
NKX2-1P43699 FO681492.1-201ENST00000623662 5321 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
NKX2-1P43699 DCAF17-211ENST00000539783 5623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
NKX2-1P43699 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NKX2-1P43699 ZBTB4-202ENST00000380599 5866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NKX2-1P43699 NID1-202ENST00000366595 5412 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NKX2-1P43699 AC067852.2-201ENST00000590513 2313 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
NKX2-1P43699 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
NKX2-1P43699 TUBGCP3-202ENST00000375669 2723 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
NKX2-1P43699 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
NKX2-1P43699 SH3BP4-202ENST00000392011 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
NKX2-1P43699 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
NKX2-1P43699 SLC43A1-201ENST00000278426 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
NKX2-1P43699 SSUH2-202ENST00000341795 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
NKX2-1P43699 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
NKX2-1P43699 TBC1D20-201ENST00000354200 4466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
NKX2-1P43699 OLA1-201ENST00000284719 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
NKX2-1P43699 CTNNBL1-204ENST00000405275 2076 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
NKX2-1P43699 MYO1B-202ENST00000339514 5026 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
NKX2-1P43699 MYH14-203ENST00000425460 6811 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
NKX2-1P43699 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
NKX2-1P43699 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
NKX2-1P43699 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
NKX2-1P43699 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
NKX2-1P43699 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
NKX2-1P43699 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
NKX2-1P43699 CORO6-210ENST00000580212 2345 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
NKX2-1P43699 HNRNPD-201ENST00000313899 3033 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
NKX2-1P43699 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
NKX2-1P43699 MARK2-209ENST00000509502 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
NKX2-1P43699 TRA2A-211ENST00000538367 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
NKX2-1P43699 SLCO6A1-201ENST00000379807 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
NKX2-1P43699 VKORC1L1-201ENST00000360768 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
NKX2-1P43699 APH1A-202ENST00000360244 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
NKX2-1P43699 TRIM33-201ENST00000358465 8339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
NKX2-1P43699 SPAG1-206ENST00000520643 1723 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
NKX2-1P43699 FZD10-201ENST00000229030 3281 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
NKX2-1P43699 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
NKX2-1P43699 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
NKX2-1P43699 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
NKX2-1P43699 PARD3-205ENST00000374773 3420 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
NKX2-1P43699 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
NKX2-1P43699 PDE9A-209ENST00000398227 1606 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
NKX2-1P43699 NAF1-202ENST00000422287 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
NKX2-1P43699 CDCP1-201ENST00000296129 6006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
NKX2-1P43699 SPTBN4-212ENST00000598249 8070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
NKX2-1P43699 EIF3B-201ENST00000360876 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
NKX2-1P43699 GAREM2-202ENST00000407684 5138 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
NKX2-1P43699 PANX1-201ENST00000227638 2769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
NKX2-1P43699 IL15-201ENST00000296545 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
NKX2-1P43699 NPNT-203ENST00000427316 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
NKX2-1P43699 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
NKX2-1P43699 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
NKX2-1P43699 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
NKX2-1P43699 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
NKX2-1P43699 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
NKX2-1P43699 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
NKX2-1P43699 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
NKX2-1P43699 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC15.51■□□□□ 0.07
NKX2-1P43699 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
NKX2-1P43699 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
NKX2-1P43699 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
NKX2-1P43699 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC15.51■□□□□ 0.07
NKX2-1P43699 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
NKX2-1P43699 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
NKX2-1P43699 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
NKX2-1P43699 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
NKX2-1P43699 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
NKX2-1P43699 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
NKX2-1P43699 POLR2C-201ENST00000219252 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
NKX2-1P43699 CDH23-205ENST00000398809 4533 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
NKX2-1P43699 WHAMMP3-203ENST00000621139 4494 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
NKX2-1P43699 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.8 ms