Protein–RNA interactions for Protein: P42025

ACTR1B, Beta-centractin, humanhuman

Predictions only

Length 376 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTR1BP42025 UBL5-201ENST00000358666 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
ACTR1BP42025 AC007731.5-201ENST00000429594 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
ACTR1BP42025 GMDS-208ENST00000530927 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
ACTR1BP42025 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
ACTR1BP42025 LINC01238-205ENST00000567549 1107 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
ACTR1BP42025 ULK4P3-205ENST00000568486 1158 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
ACTR1BP42025 AC087388.1-201ENST00000571370 1112 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
ACTR1BP42025 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
ACTR1BP42025 AC022154.1-201ENST00000600303 766 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
ACTR1BP42025 AC008622.2-201ENST00000617006 1229 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
ACTR1BP42025 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
ACTR1BP42025 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
ACTR1BP42025 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
ACTR1BP42025 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
ACTR1BP42025 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
ACTR1BP42025 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
ACTR1BP42025 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
ACTR1BP42025 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
ACTR1BP42025 PHF12-202ENST00000332830 4759 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
ACTR1BP42025 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
ACTR1BP42025 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
ACTR1BP42025 VLDLR-AS1-205ENST00000599229 1346 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
ACTR1BP42025 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
ACTR1BP42025 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
ACTR1BP42025 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
ACTR1BP42025 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
ACTR1BP42025 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
ACTR1BP42025 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
ACTR1BP42025 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
ACTR1BP42025 Telomerase-vert.1-201ENST00000363312 438 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
ACTR1BP42025 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
ACTR1BP42025 AL513320.1-201ENST00000435049 622 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
ACTR1BP42025 AC007563.2-201ENST00000447289 552 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
ACTR1BP42025 AC092647.4-201ENST00000457211 535 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
ACTR1BP42025 AC063952.2-201ENST00000498792 1227 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
ACTR1BP42025 CCNJL-205ENST00000519673 940 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
ACTR1BP42025 AP006621.4-201ENST00000527021 532 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
ACTR1BP42025 LTBR-211ENST00000543190 785 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
ACTR1BP42025 ELAC2-212ENST00000578071 579 ntTSL 4 BASIC18.52■□□□□ 0.56
ACTR1BP42025 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
ACTR1BP42025 AC140113.3-201ENST00000605663 199 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
ACTR1BP42025 AC011558.1-201ENST00000623459 338 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
ACTR1BP42025 AL023973.1-201ENST00000624619 620 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
ACTR1BP42025 PRLHR-202ENST00000636925 1275 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.56
ACTR1BP42025 AL031432.5-201ENST00000641059 760 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
ACTR1BP42025 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
ACTR1BP42025 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
ACTR1BP42025 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
ACTR1BP42025 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
ACTR1BP42025 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ACTR1BP42025 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ACTR1BP42025 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
ACTR1BP42025 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ACTR1BP42025 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
ACTR1BP42025 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
ACTR1BP42025 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ACTR1BP42025 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
ACTR1BP42025 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ACTR1BP42025 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
ACTR1BP42025 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ACTR1BP42025 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
ACTR1BP42025 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
ACTR1BP42025 RHEBL1-201ENST00000301068 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ACTR1BP42025 TSPY5P-201ENST00000426936 936 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
ACTR1BP42025 AC009947.2-201ENST00000444014 672 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
ACTR1BP42025 MYH14-208ENST00000598205 6137 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
ACTR1BP42025 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
ACTR1BP42025 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ACTR1BP42025 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
ACTR1BP42025 EDEM1-204ENST00000445686 1363 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
ACTR1BP42025 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ACTR1BP42025 MAFG-201ENST00000357736 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ACTR1BP42025 CACNA1A-246ENST00000637736 8340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
ACTR1BP42025 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
ACTR1BP42025 DCBLD2-201ENST00000326840 6122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ACTR1BP42025 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ACTR1BP42025 PAX1-205ENST00000613128 5352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ACTR1BP42025 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ACTR1BP42025 SPAG16-209ENST00000447990 1330 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ACTR1BP42025 SLC35A3-224ENST00000640732 1777 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ACTR1BP42025 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ACTR1BP42025 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ACTR1BP42025 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ACTR1BP42025 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ACTR1BP42025 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ACTR1BP42025 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ACTR1BP42025 PIEZO1-202ENST00000327397 1246 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ACTR1BP42025 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ACTR1BP42025 RNF146-204ENST00000476956 884 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ACTR1BP42025 DCTN5-208ENST00000568589 772 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ACTR1BP42025 MED9-202ENST00000580462 565 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ACTR1BP42025 MAPK9-201ENST00000343111 4369 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ACTR1BP42025 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ACTR1BP42025 GRM5-201ENST00000305432 4475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ACTR1BP42025 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ACTR1BP42025 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ACTR1BP42025 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ACTR1BP42025 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ACTR1BP42025 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ACTR1BP42025 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.6 ms