Protein–RNA interactions for Protein: P41219

PRPH, Peripherin, humanhuman

Predictions only

Length 470 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRPHP41219 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PRPHP41219 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PRPHP41219 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PRPHP41219 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PRPHP41219 GOSR2-226ENST00000639287 2367 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PRPHP41219 IDH3G-202ENST00000370092 1712 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PRPHP41219 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PRPHP41219 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PRPHP41219 KANSL1-202ENST00000432791 5343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PRPHP41219 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PRPHP41219 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PRPHP41219 P2RX5-203ENST00000547178 1998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PRPHP41219 DLG3-202ENST00000374355 5074 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PRPHP41219 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PRPHP41219 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PRPHP41219 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PRPHP41219 AC003982.1-201ENST00000477404 484 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PRPHP41219 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PRPHP41219 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PRPHP41219 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PRPHP41219 C14orf180-201ENST00000331952 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PRPHP41219 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PRPHP41219 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PRPHP41219 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PRPHP41219 AC093503.3-201ENST00000624917 2352 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
PRPHP41219 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PRPHP41219 LGI2-201ENST00000382114 6428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PRPHP41219 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PRPHP41219 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PRPHP41219 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PRPHP41219 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PRPHP41219 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PRPHP41219 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PRPHP41219 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PRPHP41219 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PRPHP41219 ORAI2-204ENST00000473939 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PRPHP41219 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PRPHP41219 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PRPHP41219 ZAR1L-202ENST00000533490 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PRPHP41219 SLC25A29-215ENST00000556505 1540 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PRPHP41219 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
PRPHP41219 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PRPHP41219 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PRPHP41219 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PRPHP41219 RIMKLB-202ENST00000357529 5830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PRPHP41219 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PRPHP41219 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PRPHP41219 ATRN-201ENST00000262919 8633 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PRPHP41219 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PRPHP41219 CBSL-210ENST00000624934 1992 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PRPHP41219 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PRPHP41219 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PRPHP41219 DIO1-217ENST00000617230 1656 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PRPHP41219 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PRPHP41219 OGFOD2-222ENST00000545317 1481 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PRPHP41219 KATNBL1P6-202ENST00000562413 1466 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
PRPHP41219 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PRPHP41219 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PRPHP41219 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PRPHP41219 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PRPHP41219 AC091153.3-201ENST00000497885 472 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PRPHP41219 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PRPHP41219 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PRPHP41219 AC117500.4-201ENST00000542797 617 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PRPHP41219 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
PRPHP41219 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PRPHP41219 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PRPHP41219 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PRPHP41219 ABCB9-202ENST00000344275 2394 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PRPHP41219 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PRPHP41219 ARHGEF18-202ENST00000359920 5733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PRPHP41219 TMEM8B-204ENST00000439587 2150 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PRPHP41219 NFKBIZ-201ENST00000326151 2058 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PRPHP41219 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PRPHP41219 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PRPHP41219 AP5S1-203ENST00000379573 1848 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PRPHP41219 MCTP1-218ENST00000515393 5396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PRPHP41219 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PRPHP41219 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PRPHP41219 MINOS1-NBL1-204ENST00000602662 1623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PRPHP41219 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PRPHP41219 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PRPHP41219 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PRPHP41219 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PRPHP41219 LINC01819-201ENST00000422351 2156 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PRPHP41219 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PRPHP41219 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PRPHP41219 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PRPHP41219 DAB1-202ENST00000371230 1150 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PRPHP41219 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PRPHP41219 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PRPHP41219 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PRPHP41219 QKI-203ENST00000361752 9463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PRPHP41219 MEPCE-202ENST00000414441 2261 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PRPHP41219 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PRPHP41219 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
PRPHP41219 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
PRPHP41219 IL10RB-201ENST00000290200 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
PRPHP41219 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
PRPHP41219 P2RY6-212ENST00000618468 2431 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.1 ms