Protein–RNA interactions for Protein: P36383

GJC1, Gap junction gamma-1 protein, humanhuman

Predictions only

Length 396 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJC1P36383 AL160286.2-201ENST00000567150 934 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
GJC1P36383 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC20.01■□□□□ 0.79
GJC1P36383 PLBD2-201ENST00000280800 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
GJC1P36383 ASXL1-202ENST00000375687 7031 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
GJC1P36383 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
GJC1P36383 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
GJC1P36383 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
GJC1P36383 TBC1D19-201ENST00000264866 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
GJC1P36383 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
GJC1P36383 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC20■□□□□ 0.79
GJC1P36383 MTDH-203ENST00000519934 2184 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
GJC1P36383 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
GJC1P36383 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
GJC1P36383 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
GJC1P36383 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
GJC1P36383 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
GJC1P36383 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
GJC1P36383 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
GJC1P36383 ARID3A-201ENST00000263620 5941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
GJC1P36383 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
GJC1P36383 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
GJC1P36383 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
GJC1P36383 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
GJC1P36383 PHKA2-201ENST00000379942 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
GJC1P36383 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
GJC1P36383 BICRA-201ENST00000396720 5739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
GJC1P36383 DDX42-202ENST00000389924 3939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
GJC1P36383 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
GJC1P36383 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
GJC1P36383 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
GJC1P36383 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
GJC1P36383 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
GJC1P36383 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
GJC1P36383 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
GJC1P36383 LUC7L2-210ENST00000619796 2783 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
GJC1P36383 ATPAF1-214ENST00000576409 4158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
GJC1P36383 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
GJC1P36383 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
GJC1P36383 LONP1-215ENST00000593119 2918 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
GJC1P36383 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
GJC1P36383 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
GJC1P36383 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
GJC1P36383 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
GJC1P36383 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
GJC1P36383 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
GJC1P36383 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
GJC1P36383 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
GJC1P36383 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
GJC1P36383 FBXO24-202ENST00000427939 2087 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
GJC1P36383 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
GJC1P36383 IL6R-202ENST00000368485 5914 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
GJC1P36383 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
GJC1P36383 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
GJC1P36383 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
GJC1P36383 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
GJC1P36383 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
GJC1P36383 LMTK2-201ENST00000297293 8946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
GJC1P36383 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
GJC1P36383 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
GJC1P36383 SREBF2-201ENST00000361204 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
GJC1P36383 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
GJC1P36383 ATXN2-227ENST00000616825 4575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
GJC1P36383 CERS6-201ENST00000305747 7217 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
GJC1P36383 FAM213A-206ENST00000615554 2213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
GJC1P36383 TNFAIP2-201ENST00000333007 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
GJC1P36383 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
GJC1P36383 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
GJC1P36383 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
GJC1P36383 ST3GAL3-206ENST00000351035 2377 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
GJC1P36383 CARD9-202ENST00000371734 1814 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
GJC1P36383 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
GJC1P36383 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
GJC1P36383 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
GJC1P36383 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
GJC1P36383 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
GJC1P36383 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
GJC1P36383 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
GJC1P36383 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC19.98■□□□□ 0.79
GJC1P36383 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
GJC1P36383 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
GJC1P36383 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
GJC1P36383 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
GJC1P36383 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC19.98■□□□□ 0.79
GJC1P36383 EMX2-203ENST00000553456 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
GJC1P36383 BLOC1S3-201ENST00000433642 2601 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
GJC1P36383 NADK-201ENST00000341426 3235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
GJC1P36383 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
GJC1P36383 KRT81-201ENST00000327741 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
GJC1P36383 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
GJC1P36383 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
GJC1P36383 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
GJC1P36383 PCDHB14-202ENST00000624896 2367 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
GJC1P36383 ADCY3-201ENST00000260600 5050 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
GJC1P36383 CLSTN1-202ENST00000377298 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
GJC1P36383 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
GJC1P36383 FZR1-203ENST00000441788 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
GJC1P36383 UBE2O-201ENST00000319380 5436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
GJC1P36383 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
GJC1P36383 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
GJC1P36383 KLHL31-201ENST00000370905 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.6 ms