Protein–RNA interactions for Protein: P35638

DDIT3, DNA damage-inducible transcript 3 protein, humanhuman

Predictions only

Length 169 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDIT3P35638 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
DDIT3P35638 MAPK9-208ENST00000455781 4336 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
DDIT3P35638 ACOXL-205ENST00000439055 2373 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
DDIT3P35638 PITPNM2-209ENST00000546049 1793 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
DDIT3P35638 FMR1-207ENST00000439526 3699 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
DDIT3P35638 ERICH1-201ENST00000262109 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
DDIT3P35638 CDKN1B-201ENST00000228872 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
DDIT3P35638 C3orf18-201ENST00000357203 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
DDIT3P35638 TMEM198-201ENST00000344458 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
DDIT3P35638 MARK2-207ENST00000502399 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
DDIT3P35638 CSAD-209ENST00000453446 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
DDIT3P35638 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
DDIT3P35638 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
DDIT3P35638 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
DDIT3P35638 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
DDIT3P35638 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
DDIT3P35638 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
DDIT3P35638 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC22.26■■□□□ 1.15
DDIT3P35638 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
DDIT3P35638 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC22.26■■□□□ 1.15
DDIT3P35638 AC135776.1-201ENST00000319817 2481 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
DDIT3P35638 FBXL3-201ENST00000355619 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
DDIT3P35638 PYGL-201ENST00000216392 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
DDIT3P35638 GPS1-201ENST00000306823 1842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
DDIT3P35638 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
DDIT3P35638 TRIM33-202ENST00000369543 3457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
DDIT3P35638 LURAP1-201ENST00000371980 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
DDIT3P35638 MTMR9LP-203ENST00000426597 1545 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
DDIT3P35638 MSI2-203ENST00000416426 1714 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
DDIT3P35638 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
DDIT3P35638 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
DDIT3P35638 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
DDIT3P35638 SLC5A10-204ENST00000395647 2140 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
DDIT3P35638 PCBP4-210ENST00000471622 1784 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
DDIT3P35638 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
DDIT3P35638 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
DDIT3P35638 RIC8A-208ENST00000527696 2565 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
DDIT3P35638 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
DDIT3P35638 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
DDIT3P35638 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
DDIT3P35638 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
DDIT3P35638 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
DDIT3P35638 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
DDIT3P35638 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
DDIT3P35638 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
DDIT3P35638 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
DDIT3P35638 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
DDIT3P35638 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
DDIT3P35638 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
DDIT3P35638 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
DDIT3P35638 GLYCTK-202ENST00000436784 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
DDIT3P35638 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
DDIT3P35638 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
DDIT3P35638 ELP5-214ENST00000574993 2209 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
DDIT3P35638 BFSP1-201ENST00000377868 2063 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
DDIT3P35638 FST-202ENST00000396947 2538 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
DDIT3P35638 AC005865.2-201ENST00000505276 2303 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
DDIT3P35638 AC026412.3-201ENST00000605200 1661 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
DDIT3P35638 HEIH-201ENST00000623091 1652 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
DDIT3P35638 IL17RC-201ENST00000295981 2621 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
DDIT3P35638 STK11-201ENST00000326873 2611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
DDIT3P35638 TCEA1-208ENST00000521604 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
DDIT3P35638 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
DDIT3P35638 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
DDIT3P35638 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
DDIT3P35638 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
DDIT3P35638 MATN4-205ENST00000537548 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
DDIT3P35638 TMPRSS5-209ENST00000544634 1524 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
DDIT3P35638 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
DDIT3P35638 FBXO44-201ENST00000251546 1896 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
DDIT3P35638 MTHFD2L-203ENST00000395759 2354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
DDIT3P35638 TSLP-203ENST00000420978 2621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
DDIT3P35638 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
DDIT3P35638 GOLGA7-204ENST00000520817 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
DDIT3P35638 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
DDIT3P35638 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
DDIT3P35638 RHOB-201ENST00000272233 2372 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
DDIT3P35638 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
DDIT3P35638 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
DDIT3P35638 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
DDIT3P35638 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
DDIT3P35638 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC22.23■■□□□ 1.15
DDIT3P35638 OSM-201ENST00000215781 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
DDIT3P35638 THOP1-205ENST00000586677 1872 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
DDIT3P35638 FAM129C-202ENST00000335393 2508 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
DDIT3P35638 WDR25-202ENST00000402312 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
DDIT3P35638 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
DDIT3P35638 NFYC-AS1-201ENST00000606277 1687 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
DDIT3P35638 RTKN-203ENST00000305557 2646 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
DDIT3P35638 PCDHA8-201ENST00000378123 2616 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
DDIT3P35638 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
DDIT3P35638 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
DDIT3P35638 RXRB-202ENST00000374685 2846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
DDIT3P35638 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
DDIT3P35638 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
DDIT3P35638 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
DDIT3P35638 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
DDIT3P35638 PABPC1L-217ENST00000537323 1910 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
DDIT3P35638 ULK3-220ENST00000569437 2611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
DDIT3P35638 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.6 ms