Protein–RNA interactions for Protein: P35052

GPC1, Glypican-1, humanhuman

Predictions only

Length 558 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPC1P35052 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
GPC1P35052 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
GPC1P35052 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
GPC1P35052 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
GPC1P35052 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
GPC1P35052 XKR6-203ENST00000416569 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
GPC1P35052 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
GPC1P35052 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
GPC1P35052 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
GPC1P35052 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
GPC1P35052 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
GPC1P35052 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
GPC1P35052 AC020922.1-201ENST00000591954 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
GPC1P35052 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
GPC1P35052 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
GPC1P35052 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
GPC1P35052 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
GPC1P35052 KCTD15-202ENST00000430256 2555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
GPC1P35052 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
GPC1P35052 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
GPC1P35052 SIX5-203ENST00000560168 1975 ntTSL 4 BASIC18.02■□□□□ 0.47
GPC1P35052 FP475955.4-201ENST00000623131 1990 ntBASIC18.02■□□□□ 0.47
GPC1P35052 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC18.02■□□□□ 0.47
GPC1P35052 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.47
GPC1P35052 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
GPC1P35052 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
GPC1P35052 NOMO2-212ENST00000622306 4252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
GPC1P35052 HR-201ENST00000312841 5351 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
GPC1P35052 ADGRD2-201ENST00000334810 3244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
GPC1P35052 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
GPC1P35052 DIP2A-203ENST00000435722 2760 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
GPC1P35052 DDX51-202ENST00000397333 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
GPC1P35052 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
GPC1P35052 AP001626.1-201ENST00000424890 2854 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
GPC1P35052 SENP6-201ENST00000327284 2700 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
GPC1P35052 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
GPC1P35052 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
GPC1P35052 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
GPC1P35052 ASPHD2-201ENST00000215906 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
GPC1P35052 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
GPC1P35052 AHRR-204ENST00000506456 2350 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
GPC1P35052 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
GPC1P35052 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
GPC1P35052 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
GPC1P35052 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
GPC1P35052 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
GPC1P35052 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
GPC1P35052 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
GPC1P35052 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
GPC1P35052 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
GPC1P35052 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
GPC1P35052 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
GPC1P35052 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
GPC1P35052 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
GPC1P35052 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
GPC1P35052 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
GPC1P35052 ORAI2-204ENST00000473939 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
GPC1P35052 PHF12-201ENST00000268756 2957 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
GPC1P35052 NKX2-1-203ENST00000518149 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
GPC1P35052 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
GPC1P35052 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
GPC1P35052 PGAP3-206ENST00000579146 2220 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
GPC1P35052 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
GPC1P35052 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
GPC1P35052 AC138356.1-201ENST00000330539 2086 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
GPC1P35052 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
GPC1P35052 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
GPC1P35052 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
GPC1P35052 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
GPC1P35052 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
GPC1P35052 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
GPC1P35052 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
GPC1P35052 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
GPC1P35052 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC18■□□□□ 0.47
GPC1P35052 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
GPC1P35052 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
GPC1P35052 PTH2R-204ENST00000617735 2472 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
GPC1P35052 SEL1L3-202ENST00000399878 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
GPC1P35052 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
GPC1P35052 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
GPC1P35052 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
GPC1P35052 PKD1P1-201ENST00000458669 6805 ntBASIC18■□□□□ 0.47
GPC1P35052 ENTPD6-202ENST00000360031 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
GPC1P35052 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
GPC1P35052 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
GPC1P35052 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
GPC1P35052 CACNA1A-201ENST00000360228 8627 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
GPC1P35052 RAI1-201ENST00000353383 7662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
GPC1P35052 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
GPC1P35052 ST3GAL3-206ENST00000351035 2377 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
GPC1P35052 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
GPC1P35052 GGT2-201ENST00000401924 2366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
GPC1P35052 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
GPC1P35052 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
GPC1P35052 PGR-201ENST00000263463 2496 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
GPC1P35052 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
GPC1P35052 PCDHA5-202ENST00000529859 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
GPC1P35052 NRG2-202ENST00000289422 2923 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
GPC1P35052 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
GPC1P35052 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.6 ms