Protein–RNA interactions for Protein: P28223

HTR2A, 5-hydroxytryptamine receptor 2A, humanhuman

Predictions only

Length 471 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HTR2AP28223 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
HTR2AP28223 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
HTR2AP28223 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
HTR2AP28223 UNC5D-204ENST00000420357 2966 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
HTR2AP28223 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
HTR2AP28223 DKK3-202ENST00000396505 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
HTR2AP28223 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
HTR2AP28223 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
HTR2AP28223 AC087457.1-201ENST00000503496 2727 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
HTR2AP28223 CDH23-212ENST00000616684 4814 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
HTR2AP28223 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
HTR2AP28223 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
HTR2AP28223 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
HTR2AP28223 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
HTR2AP28223 AC005056.1-201ENST00000435932 532 ntTSL 4 BASIC17.4■□□□□ 0.38
HTR2AP28223 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
HTR2AP28223 AC006504.5-207ENST00000586220 487 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
HTR2AP28223 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
HTR2AP28223 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
HTR2AP28223 AC083906.6-201ENST00000641366 219 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
HTR2AP28223 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
HTR2AP28223 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
HTR2AP28223 LRRC36-201ENST00000329956 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
HTR2AP28223 CASP16P-202ENST00000575497 2161 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
HTR2AP28223 AC104581.1-202ENST00000635932 2618 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
HTR2AP28223 KBTBD2-201ENST00000304056 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
HTR2AP28223 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
HTR2AP28223 HACE1-202ENST00000369125 3102 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
HTR2AP28223 RBL2-201ENST00000262133 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
HTR2AP28223 PAX1-205ENST00000613128 5352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
HTR2AP28223 PALM3-201ENST00000340790 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
HTR2AP28223 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
HTR2AP28223 RIOX2-201ENST00000333396 5347 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
HTR2AP28223 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
HTR2AP28223 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
HTR2AP28223 KLHL17-201ENST00000338591 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
HTR2AP28223 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
HTR2AP28223 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.38
HTR2AP28223 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
HTR2AP28223 PLEKHA2-206ENST00000521746 2127 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.38
HTR2AP28223 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
HTR2AP28223 RGS9BP-201ENST00000334176 2894 ntAPPRIS P1 BASIC17.39■□□□□ 0.37
HTR2AP28223 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
HTR2AP28223 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
HTR2AP28223 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
HTR2AP28223 RALGAPA1-219ENST00000637992 8512 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
HTR2AP28223 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
HTR2AP28223 WIZP1-201ENST00000531444 2299 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
HTR2AP28223 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
HTR2AP28223 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
HTR2AP28223 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
HTR2AP28223 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
HTR2AP28223 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
HTR2AP28223 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
HTR2AP28223 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
HTR2AP28223 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
HTR2AP28223 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
HTR2AP28223 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
HTR2AP28223 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
HTR2AP28223 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC17.39■□□□□ 0.37
HTR2AP28223 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
HTR2AP28223 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC17.39■□□□□ 0.37
HTR2AP28223 NUP50-AS1-201ENST00000426282 2076 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
HTR2AP28223 GRM2-204ENST00000442933 2064 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
HTR2AP28223 GLDN-201ENST00000335449 4971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
HTR2AP28223 CHPF-203ENST00000535926 2634 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
HTR2AP28223 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
HTR2AP28223 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
HTR2AP28223 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
HTR2AP28223 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
HTR2AP28223 RABL2B-205ENST00000395595 2428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
HTR2AP28223 BCL7A-203ENST00000538010 6247 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
HTR2AP28223 DNM1-206ENST00000475805 2710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
HTR2AP28223 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
HTR2AP28223 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
HTR2AP28223 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
HTR2AP28223 LUC7L2-210ENST00000619796 2783 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
HTR2AP28223 RANBP10-201ENST00000317506 5341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
HTR2AP28223 RANBP10-209ENST00000630626 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
HTR2AP28223 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
HTR2AP28223 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
HTR2AP28223 PLEKHB2-204ENST00000409158 2277 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
HTR2AP28223 ANKS3-202ENST00000446014 2265 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
HTR2AP28223 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
HTR2AP28223 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
HTR2AP28223 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
HTR2AP28223 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
HTR2AP28223 INSR-201ENST00000302850 4721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
HTR2AP28223 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
HTR2AP28223 PKD2-201ENST00000237596 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
HTR2AP28223 AC009113.1-201ENST00000570267 2443 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
HTR2AP28223 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
HTR2AP28223 MAFF-206ENST00000538320 2458 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.38■□□□□ 0.37
HTR2AP28223 MAPK9-201ENST00000343111 4369 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
HTR2AP28223 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
HTR2AP28223 FAM124A-202ENST00000322475 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
HTR2AP28223 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
HTR2AP28223 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
HTR2AP28223 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
HTR2AP28223 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.9 ms