Protein–RNA interactions for Protein: P27815

PDE4A, cAMP-specific 3',5'-cyclic phosphodiesterase 4A, humanhuman

Predictions only

Length 886 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE4AP27815 GAREM2-201ENST00000401533 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
PDE4AP27815 HNRNPD-201ENST00000313899 3033 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
PDE4AP27815 SLC25A48-201ENST00000274513 1880 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
PDE4AP27815 ARHGEF18-202ENST00000359920 5733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
PDE4AP27815 NF2-203ENST00000353887 1845 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
PDE4AP27815 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
PDE4AP27815 CD276-203ENST00000537340 2439 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
PDE4AP27815 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
PDE4AP27815 SAR1B-208ENST00000507419 2287 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
PDE4AP27815 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
PDE4AP27815 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
PDE4AP27815 SCARB1-203ENST00000415380 2731 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
PDE4AP27815 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
PDE4AP27815 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
PDE4AP27815 PRKCB-202ENST00000321728 2689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
PDE4AP27815 GGNBP2-210ENST00000611219 2315 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
PDE4AP27815 SPAST-203ENST00000615843 5212 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
PDE4AP27815 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
PDE4AP27815 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
PDE4AP27815 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
PDE4AP27815 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
PDE4AP27815 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
PDE4AP27815 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
PDE4AP27815 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
PDE4AP27815 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
PDE4AP27815 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC23.86■■□□□ 1.41
PDE4AP27815 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
PDE4AP27815 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC23.86■■□□□ 1.41
PDE4AP27815 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
PDE4AP27815 ZNF74-201ENST00000357502 2788 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
PDE4AP27815 CCDC157-203ENST00000405659 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
PDE4AP27815 PLA2G2F-201ENST00000375102 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
PDE4AP27815 SKOR1-203ENST00000554054 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
PDE4AP27815 APH1A-202ENST00000360244 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
PDE4AP27815 FZD10-201ENST00000229030 3281 ntAPPRIS P1 BASIC23.86■■□□□ 1.41
PDE4AP27815 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
PDE4AP27815 RAB4B-EGLN2-201ENST00000594136 2554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
PDE4AP27815 ARPIN-202ENST00000460685 2145 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
PDE4AP27815 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
PDE4AP27815 FAM53A-207ENST00000489363 2776 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
PDE4AP27815 PSTPIP1-203ENST00000558012 1896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
PDE4AP27815 ZBTB16-201ENST00000335953 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
PDE4AP27815 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
PDE4AP27815 RABEP2-202ENST00000358201 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
PDE4AP27815 ZDHHC23-201ENST00000330212 3778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
PDE4AP27815 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
PDE4AP27815 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
PDE4AP27815 NAT8L-201ENST00000331662 5571 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
PDE4AP27815 ARNTL-201ENST00000389707 2776 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
PDE4AP27815 PNMA8B-202ENST00000599531 5308 ntAPPRIS P1 BASIC23.85■■□□□ 1.41
PDE4AP27815 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
PDE4AP27815 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
PDE4AP27815 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
PDE4AP27815 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
PDE4AP27815 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
PDE4AP27815 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC23.85■■□□□ 1.41
PDE4AP27815 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.85■■□□□ 1.41
PDE4AP27815 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
PDE4AP27815 GNAS-AS1-202ENST00000443966 2341 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
PDE4AP27815 USP48-204ENST00000400301 4309 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
PDE4AP27815 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
PDE4AP27815 ZAR1L-202ENST00000533490 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
PDE4AP27815 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
PDE4AP27815 MXRA8-209ENST00000477278 2728 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
PDE4AP27815 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
PDE4AP27815 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
PDE4AP27815 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
PDE4AP27815 SLC39A7-201ENST00000374675 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
PDE4AP27815 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
PDE4AP27815 LYNX1-204ENST00000614491 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
PDE4AP27815 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
PDE4AP27815 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
PDE4AP27815 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
PDE4AP27815 BIRC8-201ENST00000426466 2026 ntAPPRIS P1 BASIC23.84■■□□□ 1.41
PDE4AP27815 SH3BP2-202ENST00000435136 2318 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
PDE4AP27815 AC118553.2-203ENST00000639037 2590 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
PDE4AP27815 PCCA-202ENST00000376285 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
PDE4AP27815 STRADB-202ENST00000392249 2190 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
PDE4AP27815 ARRB1-201ENST00000360025 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
PDE4AP27815 CD2AP-201ENST00000359314 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
PDE4AP27815 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
PDE4AP27815 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
PDE4AP27815 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
PDE4AP27815 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
PDE4AP27815 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
PDE4AP27815 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
PDE4AP27815 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
PDE4AP27815 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
PDE4AP27815 SOST-201ENST00000301691 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
PDE4AP27815 SCYL1-203ENST00000420247 2583 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
PDE4AP27815 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
PDE4AP27815 RNFT2-202ENST00000319176 2180 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
PDE4AP27815 ZNF394-201ENST00000337673 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
PDE4AP27815 RNFT2-209ENST00000622220 2176 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
PDE4AP27815 GOLGA6L2-204ENST00000567107 3030 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
PDE4AP27815 POLR2C-201ENST00000219252 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
PDE4AP27815 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
PDE4AP27815 WWOX-205ENST00000539474 1670 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
PDE4AP27815 TCTN1-225ENST00000551590 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
PDE4AP27815 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.8 ms