Protein–RNA interactions for Protein: P25105

PTAFR, Platelet-activating factor receptor, humanhuman

Predictions only

Length 342 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTAFRP25105 AC008105.2-201ENST00000420431 579 ntTSL 4 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PTAFRP25105 UNC5B-AS1-201ENST00000447119 647 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PTAFRP25105 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PTAFRP25105 KRT18P21-201ENST00000515767 1272 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
PTAFRP25105 SIGLEC15-202ENST00000546268 1054 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PTAFRP25105 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PTAFRP25105 KMT5A-202ENST00000402868 3140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PTAFRP25105 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PTAFRP25105 ZNF419-205ENST00000424930 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PTAFRP25105 FBLIM1-202ENST00000375766 3695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PTAFRP25105 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PTAFRP25105 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PTAFRP25105 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PTAFRP25105 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PTAFRP25105 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PTAFRP25105 B3GNT9-201ENST00000449549 2917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PTAFRP25105 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PTAFRP25105 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PTAFRP25105 ACTR3B-203ENST00000397282 1692 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PTAFRP25105 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PTAFRP25105 SLC25A39-202ENST00000377095 1565 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PTAFRP25105 TSC22D4-202ENST00000393991 1469 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PTAFRP25105 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PTAFRP25105 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PTAFRP25105 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PTAFRP25105 TSPY14P-201ENST00000303979 915 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
PTAFRP25105 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PTAFRP25105 GPM6B-204ENST00000398361 1033 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PTAFRP25105 MFAP1P1-201ENST00000442257 1255 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
PTAFRP25105 AC008040.2-201ENST00000461049 708 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
PTAFRP25105 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PTAFRP25105 ZNF667-AS1-208ENST00000594783 475 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PTAFRP25105 ST20-MTHFS-203ENST00000615374 679 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PTAFRP25105 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PTAFRP25105 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PTAFRP25105 CLN6-221ENST00000637494 765 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PTAFRP25105 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PTAFRP25105 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PTAFRP25105 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PTAFRP25105 ASNS-206ENST00000437628 1638 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PTAFRP25105 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PTAFRP25105 CNNM3-201ENST00000305510 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PTAFRP25105 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PTAFRP25105 RAPH1-201ENST00000308091 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PTAFRP25105 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PTAFRP25105 SMC4-201ENST00000344722 5356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PTAFRP25105 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PTAFRP25105 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PTAFRP25105 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PTAFRP25105 OGFOD2-222ENST00000545317 1481 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PTAFRP25105 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PTAFRP25105 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PTAFRP25105 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PTAFRP25105 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PTAFRP25105 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PTAFRP25105 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PTAFRP25105 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PTAFRP25105 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PTAFRP25105 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PTAFRP25105 ARNT-202ENST00000358595 4887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PTAFRP25105 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PTAFRP25105 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PTAFRP25105 TMEM53-201ENST00000372235 890 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PTAFRP25105 ERICH4-201ENST00000378187 946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PTAFRP25105 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PTAFRP25105 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PTAFRP25105 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PTAFRP25105 AC008771.1-201ENST00000508000 1151 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PTAFRP25105 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PTAFRP25105 COL18A1-202ENST00000355480 5924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PTAFRP25105 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PTAFRP25105 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PTAFRP25105 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PTAFRP25105 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PTAFRP25105 LANCL3-201ENST00000378619 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PTAFRP25105 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PTAFRP25105 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PTAFRP25105 SPTBN4-204ENST00000392025 8671 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
PTAFRP25105 ZNF470-201ENST00000330619 7151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PTAFRP25105 CERS6-201ENST00000305747 7217 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
PTAFRP25105 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
PTAFRP25105 QRICH1-201ENST00000357496 3083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
PTAFRP25105 EVPL-202ENST00000586740 6223 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PTAFRP25105 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PTAFRP25105 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PTAFRP25105 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
PTAFRP25105 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PTAFRP25105 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PTAFRP25105 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PTAFRP25105 SLC25A29-215ENST00000556505 1540 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
PTAFRP25105 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PTAFRP25105 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
PTAFRP25105 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PTAFRP25105 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PTAFRP25105 ANKRD29-201ENST00000322980 1658 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
PTAFRP25105 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PTAFRP25105 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PTAFRP25105 CCR12P-201ENST00000446203 998 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
PTAFRP25105 AL139246.2-201ENST00000456687 1297 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
PTAFRP25105 TMA16-209ENST00000513272 803 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.2 ms