Protein–RNA interactions for Protein: P23468

PTPRD, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase delta, humanhuman

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Length 1,912 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRDP23468 OSR2-201ENST00000297565 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
PTPRDP23468 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
PTPRDP23468 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
PTPRDP23468 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
PTPRDP23468 TBC1D7-201ENST00000343141 1027 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
PTPRDP23468 KRT18P41-201ENST00000518924 1277 ntBASIC19.78■□□□□ 0.76
PTPRDP23468 FOSL1-203ENST00000531493 1200 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
PTPRDP23468 ABCD4-228ENST00000557588 763 ntTSL 3 BASIC19.78■□□□□ 0.76
PTPRDP23468 MRPL46-202ENST00000558531 1002 ntTSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
PTPRDP23468 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
PTPRDP23468 NFYC-AS1-201ENST00000606277 1687 ntBASIC19.78■□□□□ 0.76
PTPRDP23468 AC005332.1-201ENST00000577698 1310 ntBASIC19.78■□□□□ 0.76
PTPRDP23468 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
PTPRDP23468 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
PTPRDP23468 MAGED2-213ENST00000627068 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
PTPRDP23468 RAB29-205ENST00000446390 1441 ntTSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
PTPRDP23468 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
PTPRDP23468 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
PTPRDP23468 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
PTPRDP23468 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
PTPRDP23468 C7orf49-209ENST00000483029 596 ntTSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
PTPRDP23468 TEN1-204ENST00000588202 862 ntTSL 3 BASIC19.78■□□□□ 0.76
PTPRDP23468 RABAC1-210ENST00000601891 628 ntTSL 3 BASIC19.78■□□□□ 0.76
PTPRDP23468 GHDC-212ENST00000593209 1827 ntTSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
PTPRDP23468 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
PTPRDP23468 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
PTPRDP23468 SARAF-214ENST00000545648 1976 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
PTPRDP23468 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
PTPRDP23468 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
PTPRDP23468 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
PTPRDP23468 INTS11-249ENST00000618806 1523 ntTSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
PTPRDP23468 NUDT16-201ENST00000502852 1552 ntTSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
PTPRDP23468 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
PTPRDP23468 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
PTPRDP23468 CAB39-202ENST00000409788 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
PTPRDP23468 RAP1GDS1-201ENST00000264572 1686 ntTSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
PTPRDP23468 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
PTPRDP23468 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
PTPRDP23468 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
PTPRDP23468 SAPCD2P2-201ENST00000431719 1174 ntBASIC19.77■□□□□ 0.76
PTPRDP23468 AP006284.1-202ENST00000527113 527 ntTSL 4 BASIC19.77■□□□□ 0.76
PTPRDP23468 AC011498.2-201ENST00000588798 540 ntTSL 3 BASIC19.77■□□□□ 0.76
PTPRDP23468 AC004076.1-201ENST00000596831 664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
PTPRDP23468 AC064834.1-201ENST00000606986 503 ntTSL 3 BASIC19.77■□□□□ 0.76
PTPRDP23468 AC009477.2-201ENST00000635976 171 ntAPPRIS P1 BASIC19.77■□□□□ 0.76
PTPRDP23468 AC068587.9-201ENST00000641814 219 ntBASIC19.77■□□□□ 0.76
PTPRDP23468 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
PTPRDP23468 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
PTPRDP23468 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
PTPRDP23468 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
PTPRDP23468 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.75
PTPRDP23468 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.75
PTPRDP23468 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.75
PTPRDP23468 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.75
PTPRDP23468 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
PTPRDP23468 GGT1-205ENST00000403838 1033 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
PTPRDP23468 AL133410.2-201ENST00000425499 696 ntTSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
PTPRDP23468 SPDYE13P-201ENST00000445314 798 ntBASIC19.76■□□□□ 0.75
PTPRDP23468 CD320-202ENST00000537716 1119 ntTSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
PTPRDP23468 FAM104A-205ENST00000581110 512 ntTSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
PTPRDP23468 NAT14-202ENST00000587400 416 ntTSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
PTPRDP23468 GUCA1A-205ENST00000541991 1921 ntTSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
PTPRDP23468 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
PTPRDP23468 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
PTPRDP23468 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
PTPRDP23468 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
PTPRDP23468 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
PTPRDP23468 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
PTPRDP23468 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
PTPRDP23468 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
PTPRDP23468 FGF8-201ENST00000320185 799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
PTPRDP23468 TSPAN14-202ENST00000341863 1037 ntTSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
PTPRDP23468 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
PTPRDP23468 NT5C2-211ENST00000470299 249 ntTSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
PTPRDP23468 LY6E-210ENST00000521182 1079 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
PTPRDP23468 C14orf144-201ENST00000553757 537 ntTSL 4 BASIC19.76■□□□□ 0.75
PTPRDP23468 GCSHP2-201ENST00000560971 527 ntBASIC19.76■□□□□ 0.75
PTPRDP23468 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
PTPRDP23468 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
PTPRDP23468 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
PTPRDP23468 KCNIP4-205ENST00000382152 1767 ntTSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
PTPRDP23468 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
PTPRDP23468 AL109659.2-201ENST00000606809 1674 ntBASIC19.75■□□□□ 0.75
PTPRDP23468 FAM3A-204ENST00000369643 1521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
PTPRDP23468 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
PTPRDP23468 RHEBL1-201ENST00000301068 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
PTPRDP23468 AC114763.1-202ENST00000414911 867 ntTSL 3 BASIC19.75■□□□□ 0.75
PTPRDP23468 AC012618.3-202ENST00000440004 472 ntTSL 4 BASIC19.75■□□□□ 0.75
PTPRDP23468 PRTN3-202ENST00000544537 1036 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
PTPRDP23468 RMI2-205ENST00000576027 818 ntTSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
PTPRDP23468 BVES-AS1-203ENST00000580511 853 ntTSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
PTPRDP23468 AC243829.1-201ENST00000615128 1059 ntTSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
PTPRDP23468 CADM1-222ENST00000616271 1246 ntTSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
PTPRDP23468 HYMAI.1-201ENST00000620949 238 ntBASIC19.75■□□□□ 0.75
PTPRDP23468 ZNF420-201ENST00000304239 1945 ntTSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
PTPRDP23468 SLC26A11-212ENST00000572725 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
PTPRDP23468 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
PTPRDP23468 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
PTPRDP23468 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
PTPRDP23468 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
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