Protein–RNA interactions for Protein: P21709

EPHA1, Ephrin type-A receptor 1, humanhuman

Predictions only

Length 976 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EPHA1P21709 MCF2L-203ENST00000375604 6445 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
EPHA1P21709 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
EPHA1P21709 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
EPHA1P21709 CDC73-201ENST00000367435 4969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
EPHA1P21709 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
EPHA1P21709 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
EPHA1P21709 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
EPHA1P21709 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
EPHA1P21709 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
EPHA1P21709 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
EPHA1P21709 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
EPHA1P21709 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
EPHA1P21709 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
EPHA1P21709 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
EPHA1P21709 MALT1-202ENST00000348428 9368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
EPHA1P21709 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
EPHA1P21709 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
EPHA1P21709 PCDHA8-202ENST00000531613 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
EPHA1P21709 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
EPHA1P21709 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
EPHA1P21709 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
EPHA1P21709 ENTPD6-202ENST00000360031 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
EPHA1P21709 PTPDC1-202ENST00000375360 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
EPHA1P21709 SHANK1-201ENST00000293441 6643 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
EPHA1P21709 RNF146-213ENST00000610153 2070 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
EPHA1P21709 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
EPHA1P21709 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
EPHA1P21709 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
EPHA1P21709 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
EPHA1P21709 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
EPHA1P21709 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
EPHA1P21709 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
EPHA1P21709 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
EPHA1P21709 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
EPHA1P21709 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC16.24■□□□□ 0.19
EPHA1P21709 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
EPHA1P21709 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
EPHA1P21709 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
EPHA1P21709 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
EPHA1P21709 CROCC2-201ENST00000443866 5382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
EPHA1P21709 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
EPHA1P21709 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
EPHA1P21709 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
EPHA1P21709 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
EPHA1P21709 AC020922.1-201ENST00000591954 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
EPHA1P21709 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
EPHA1P21709 EMX2-201ENST00000442245 2710 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
EPHA1P21709 NLE1-203ENST00000586869 5286 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
EPHA1P21709 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
EPHA1P21709 SOGA3-203ENST00000525778 4077 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
EPHA1P21709 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
EPHA1P21709 INAVA-202ENST00000413687 2197 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
EPHA1P21709 CASP16P-202ENST00000575497 2161 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
EPHA1P21709 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
EPHA1P21709 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
EPHA1P21709 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
EPHA1P21709 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
EPHA1P21709 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
EPHA1P21709 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
EPHA1P21709 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
EPHA1P21709 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
EPHA1P21709 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
EPHA1P21709 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
EPHA1P21709 RCN1P1-201ENST00000400413 996 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
EPHA1P21709 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
EPHA1P21709 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
EPHA1P21709 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
EPHA1P21709 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
EPHA1P21709 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
EPHA1P21709 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
EPHA1P21709 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC16.23■□□□□ 0.19
EPHA1P21709 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
EPHA1P21709 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
EPHA1P21709 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
EPHA1P21709 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
EPHA1P21709 PGR-201ENST00000263463 2496 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
EPHA1P21709 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
EPHA1P21709 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
EPHA1P21709 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
EPHA1P21709 KDM5C-204ENST00000375401 6031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
EPHA1P21709 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
EPHA1P21709 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
EPHA1P21709 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
EPHA1P21709 SSC4D-201ENST00000275560 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
EPHA1P21709 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
EPHA1P21709 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
EPHA1P21709 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
EPHA1P21709 HACE1-202ENST00000369125 3102 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
EPHA1P21709 WNK2-201ENST00000297954 7138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
EPHA1P21709 AKAP17A-201ENST00000313871 3204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
EPHA1P21709 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
EPHA1P21709 MLXIP-201ENST00000319080 8427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
EPHA1P21709 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
EPHA1P21709 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
EPHA1P21709 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
EPHA1P21709 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
EPHA1P21709 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
EPHA1P21709 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
EPHA1P21709 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC16.22■□□□□ 0.19
EPHA1P21709 AC117500.4-201ENST00000542797 617 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.4 ms