Protein–RNA interactions for Protein: P20142

PGC, Gastricsin, humanhuman

Predictions only

Length 388 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGCP20142 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PGCP20142 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PGCP20142 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PGCP20142 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
PGCP20142 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PGCP20142 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PGCP20142 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
PGCP20142 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
PGCP20142 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PGCP20142 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PGCP20142 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PGCP20142 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PGCP20142 NOP14-AS1-202ENST00000505731 1999 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
PGCP20142 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PGCP20142 CHST11-201ENST00000303694 5709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PGCP20142 SCRIB-201ENST00000320476 5143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PGCP20142 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
PGCP20142 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PGCP20142 ANKS1A-201ENST00000360359 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PGCP20142 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
PGCP20142 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PGCP20142 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PGCP20142 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PGCP20142 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PGCP20142 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
PGCP20142 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
PGCP20142 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
PGCP20142 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PGCP20142 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PGCP20142 AC008771.1-201ENST00000508000 1151 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
PGCP20142 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
PGCP20142 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC17.31■□□□□ 0.36
PGCP20142 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
PGCP20142 AP000692.2-201ENST00000608391 879 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
PGCP20142 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
PGCP20142 DPYSL3-202ENST00000398514 5309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PGCP20142 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PGCP20142 SEPT8-201ENST00000296873 4394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PGCP20142 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
PGCP20142 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PGCP20142 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
PGCP20142 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PGCP20142 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PGCP20142 POMT2-201ENST00000261534 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PGCP20142 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC17.31■□□□□ 0.36
PGCP20142 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PGCP20142 FGFR3-202ENST00000340107 4293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
PGCP20142 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PGCP20142 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
PGCP20142 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PGCP20142 DLK1-202ENST00000341267 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PGCP20142 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PGCP20142 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
PGCP20142 SMN1-209ENST00000514951 1308 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
PGCP20142 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PGCP20142 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PGCP20142 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PGCP20142 ANKIB1-201ENST00000265742 6081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PGCP20142 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PGCP20142 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PGCP20142 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PGCP20142 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
PGCP20142 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
PGCP20142 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
PGCP20142 AC008040.2-201ENST00000461049 708 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
PGCP20142 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
PGCP20142 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PGCP20142 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PGCP20142 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
PGCP20142 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PGCP20142 CKBP1-201ENST00000565489 1086 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
PGCP20142 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
PGCP20142 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC17.3■□□□□ 0.36
PGCP20142 SLC25A39-202ENST00000377095 1565 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PGCP20142 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PGCP20142 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PGCP20142 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PGCP20142 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
PGCP20142 GPR135-201ENST00000395116 4578 ntAPPRIS P1 BASIC17.3■□□□□ 0.36
PGCP20142 TLE4-205ENST00000376544 4871 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PGCP20142 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
PGCP20142 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PGCP20142 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PGCP20142 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PGCP20142 USP32-201ENST00000300896 5171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PGCP20142 COL18A1-204ENST00000400337 5436 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PGCP20142 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PGCP20142 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PGCP20142 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PGCP20142 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
PGCP20142 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
PGCP20142 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
PGCP20142 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
PGCP20142 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PGCP20142 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
PGCP20142 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PGCP20142 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
PGCP20142 AC003982.1-201ENST00000477404 484 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
PGCP20142 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC17.29■□□□□ 0.36
PGCP20142 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.7 ms