Protein–RNA interactions for Protein: P19397

CD53, Leukocyte surface antigen CD53, humanhuman

Predictions only

Length 219 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD53P19397 WDTC1-201ENST00000319394 4819 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CD53P19397 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
CD53P19397 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CD53P19397 PPM1G-201ENST00000344034 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CD53P19397 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
CD53P19397 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CD53P19397 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CD53P19397 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CD53P19397 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CD53P19397 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CD53P19397 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
CD53P19397 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CD53P19397 AL109797.1-201ENST00000452501 835 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CD53P19397 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CD53P19397 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CD53P19397 RN7SL850P-201ENST00000579959 291 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
CD53P19397 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CD53P19397 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CD53P19397 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CD53P19397 GRM2-204ENST00000442933 2064 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CD53P19397 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CD53P19397 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CD53P19397 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CD53P19397 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CD53P19397 TINAGL1-202ENST00000457433 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CD53P19397 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CD53P19397 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CD53P19397 SEMA6D-205ENST00000389425 2318 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CD53P19397 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CD53P19397 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CD53P19397 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CD53P19397 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CD53P19397 FRRS1L-201ENST00000561981 8197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CD53P19397 ARNT-202ENST00000358595 4887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CD53P19397 RTEL1-204ENST00000370003 2273 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CD53P19397 NECAB1-201ENST00000417640 5289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CD53P19397 TMEM206-201ENST00000261455 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CD53P19397 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CD53P19397 HCG11-201ENST00000411553 5696 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
CD53P19397 ZBTB8A-201ENST00000316459 1943 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CD53P19397 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CD53P19397 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CD53P19397 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CD53P19397 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CD53P19397 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CD53P19397 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
CD53P19397 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CD53P19397 SCARF1-202ENST00000348987 2619 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CD53P19397 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CD53P19397 NUDT4-202ENST00000415493 4839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CD53P19397 RBL2-201ENST00000262133 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CD53P19397 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CD53P19397 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CD53P19397 GPT-202ENST00000394955 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CD53P19397 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CD53P19397 CBSL-210ENST00000624934 1992 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CD53P19397 CCDC17-209ENST00000528266 2181 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CD53P19397 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CD53P19397 GDF10-201ENST00000580279 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CD53P19397 ELOC-209ENST00000602840 2780 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CD53P19397 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CD53P19397 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CD53P19397 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CD53P19397 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CD53P19397 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CD53P19397 ATP6V1D-201ENST00000216442 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CD53P19397 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CD53P19397 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CD53P19397 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CD53P19397 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CD53P19397 PTPA-223ENST00000452489 2526 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CD53P19397 TLX1-201ENST00000370196 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CD53P19397 WWC3-201ENST00000380861 6647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CD53P19397 RIMBP3C-201ENST00000331505 5475 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CD53P19397 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CD53P19397 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CD53P19397 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CD53P19397 SORCS3-201ENST00000369699 5530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CD53P19397 USP25-204ENST00000400183 5341 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CD53P19397 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CD53P19397 AL031598.1-201ENST00000561511 1773 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
CD53P19397 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CD53P19397 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CD53P19397 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CD53P19397 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CD53P19397 KRT18P35-201ENST00000510488 1269 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
CD53P19397 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CD53P19397 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CD53P19397 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CD53P19397 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CD53P19397 AL390961.4-201ENST00000623958 2535 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
CD53P19397 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CD53P19397 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CD53P19397 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CD53P19397 ABHD13-201ENST00000375898 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
CD53P19397 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
CD53P19397 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
CD53P19397 STMN3-202ENST00000540534 2351 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.34
CD53P19397 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
CD53P19397 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC17.21■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.3 ms