Protein–RNA interactions for Protein: P11926

ODC1, Ornithine decarboxylase, humanhuman

Predictions only

Length 461 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ODC1P11926 RHEBL1-201ENST00000301068 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ODC1P11926 AL023284.2-201ENST00000405850 579 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
ODC1P11926 CR769775.1-204ENST00000439760 747 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
ODC1P11926 MCCD1P1-208ENST00000445732 328 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
ODC1P11926 AC011498.2-201ENST00000588798 540 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
ODC1P11926 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ODC1P11926 RNF187-203ENST00000639044 708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ODC1P11926 HAGHL-203ENST00000389703 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ODC1P11926 HMBS-221ENST00000544387 1351 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
ODC1P11926 KATNBL1P6-202ENST00000562413 1466 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
ODC1P11926 ZHX3-212ENST00000558993 1528 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
ODC1P11926 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
ODC1P11926 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ODC1P11926 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ODC1P11926 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ODC1P11926 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ODC1P11926 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ODC1P11926 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
ODC1P11926 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ODC1P11926 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
ODC1P11926 ILF2-202ENST00000368681 726 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
ODC1P11926 FAM8A6P-201ENST00000407496 1135 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
ODC1P11926 AC074183.1-201ENST00000439105 782 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
ODC1P11926 LY6E-210ENST00000521182 1079 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ODC1P11926 MTHFS-202ENST00000559722 948 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
ODC1P11926 AC087388.1-201ENST00000571370 1112 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
ODC1P11926 ELAC2-212ENST00000578071 579 ntTSL 4 BASIC20.15■□□□□ 0.82
ODC1P11926 ADORA1-208ENST00000618295 862 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ODC1P11926 SPAG16-209ENST00000447990 1330 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ODC1P11926 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
ODC1P11926 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
ODC1P11926 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ODC1P11926 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
ODC1P11926 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ODC1P11926 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
ODC1P11926 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ODC1P11926 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ODC1P11926 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
ODC1P11926 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
ODC1P11926 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ODC1P11926 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ODC1P11926 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
ODC1P11926 FP475955.4-201ENST00000623131 1990 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
ODC1P11926 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
ODC1P11926 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
ODC1P11926 PIEZO1-202ENST00000327397 1246 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
ODC1P11926 GUCA2B-201ENST00000372581 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ODC1P11926 IMP3-202ENST00000403490 1237 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.81
ODC1P11926 PLCB1-204ENST00000404098 1260 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
ODC1P11926 AL513320.1-201ENST00000435049 622 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
ODC1P11926 AL441883.1-201ENST00000566170 1045 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
ODC1P11926 DCTN5-208ENST00000568589 772 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
ODC1P11926 KLHL29-203ENST00000486442 5287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
ODC1P11926 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ODC1P11926 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
ODC1P11926 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
ODC1P11926 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
ODC1P11926 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ODC1P11926 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ODC1P11926 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ODC1P11926 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ODC1P11926 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ODC1P11926 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ODC1P11926 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ODC1P11926 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
ODC1P11926 LCE3D-201ENST00000368787 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ODC1P11926 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ODC1P11926 HOMER2P1-201ENST00000455653 964 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
ODC1P11926 RNF146-204ENST00000476956 884 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ODC1P11926 MRPL46-202ENST00000558531 1002 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ODC1P11926 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ODC1P11926 C17orf62-221ENST00000581196 668 ntTSL 4 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ODC1P11926 MIR3180-5-201ENST00000583743 153 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
ODC1P11926 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ODC1P11926 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ODC1P11926 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ODC1P11926 TAPT1-201ENST00000405303 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ODC1P11926 PTPRK-218ENST00000525459 1722 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ODC1P11926 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ODC1P11926 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ODC1P11926 JPT1-203ENST00000409753 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ODC1P11926 AC036111.1-201ENST00000533973 1582 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
ODC1P11926 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ODC1P11926 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ODC1P11926 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ODC1P11926 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ODC1P11926 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ODC1P11926 KCNK4-205ENST00000538767 1389 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ODC1P11926 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ODC1P11926 COPE-203ENST00000351079 907 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ODC1P11926 GUK1-204ENST00000366721 689 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ODC1P11926 HSD11B1L-205ENST00000422535 730 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ODC1P11926 HDAC11-AS1-201ENST00000424112 515 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ODC1P11926 AC019068.1-202ENST00000483218 768 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ODC1P11926 TPM1-226ENST00000560959 925 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ODC1P11926 GEMIN7-203ENST00000591607 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ODC1P11926 UBA52-210ENST00000598780 668 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ODC1P11926 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ODC1P11926 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ODC1P11926 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.5 ms