Protein–RNA interactions for Protein: P0DJI9

SAA2, Serum amyloid A-2 protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 122 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SAA2P0DJI9 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SAA2P0DJI9 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SAA2P0DJI9 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SAA2P0DJI9 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SAA2P0DJI9 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
SAA2P0DJI9 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SAA2P0DJI9 RANBP10-201ENST00000317506 5341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SAA2P0DJI9 RANBP10-209ENST00000630626 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SAA2P0DJI9 ENOPH1-201ENST00000273920 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SAA2P0DJI9 ST3GAL3-206ENST00000351035 2377 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SAA2P0DJI9 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SAA2P0DJI9 ANKRD9-201ENST00000286918 6727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SAA2P0DJI9 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SAA2P0DJI9 ACVR1B-203ENST00000426655 1782 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SAA2P0DJI9 Z98044.1-201ENST00000632503 1764 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
SAA2P0DJI9 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SAA2P0DJI9 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SAA2P0DJI9 AMIGO1-202ENST00000369864 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SAA2P0DJI9 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SAA2P0DJI9 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SAA2P0DJI9 CLIP2-201ENST00000223398 5563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SAA2P0DJI9 BAG5-201ENST00000299204 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SAA2P0DJI9 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SAA2P0DJI9 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SAA2P0DJI9 HOXA13-201ENST00000222753 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SAA2P0DJI9 MEN1-205ENST00000377316 2868 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SAA2P0DJI9 GHDC-212ENST00000593209 1827 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SAA2P0DJI9 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SAA2P0DJI9 ATRN-201ENST00000262919 8633 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SAA2P0DJI9 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SAA2P0DJI9 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SAA2P0DJI9 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SAA2P0DJI9 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SAA2P0DJI9 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SAA2P0DJI9 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SAA2P0DJI9 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
SAA2P0DJI9 AC083906.6-201ENST00000641366 219 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
SAA2P0DJI9 DEF8-211ENST00000563795 1767 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SAA2P0DJI9 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SAA2P0DJI9 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
SAA2P0DJI9 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SAA2P0DJI9 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SAA2P0DJI9 MICU3-201ENST00000318063 3992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SAA2P0DJI9 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SAA2P0DJI9 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SAA2P0DJI9 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SAA2P0DJI9 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SAA2P0DJI9 FAM131A-204ENST00000418281 1664 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SAA2P0DJI9 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SAA2P0DJI9 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SAA2P0DJI9 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SAA2P0DJI9 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SAA2P0DJI9 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SAA2P0DJI9 TMC5-203ENST00000396229 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SAA2P0DJI9 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SAA2P0DJI9 PLA2G7-201ENST00000274793 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SAA2P0DJI9 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SAA2P0DJI9 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SAA2P0DJI9 KRT8P11-201ENST00000409686 1436 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
SAA2P0DJI9 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
SAA2P0DJI9 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SAA2P0DJI9 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SAA2P0DJI9 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SAA2P0DJI9 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SAA2P0DJI9 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SAA2P0DJI9 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SAA2P0DJI9 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SAA2P0DJI9 MTDH-203ENST00000519934 2184 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SAA2P0DJI9 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SAA2P0DJI9 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SAA2P0DJI9 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SAA2P0DJI9 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SAA2P0DJI9 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
SAA2P0DJI9 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SAA2P0DJI9 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SAA2P0DJI9 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SAA2P0DJI9 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SAA2P0DJI9 C19orf25-203ENST00000585675 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SAA2P0DJI9 GPRIN2-201ENST00000374314 1696 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SAA2P0DJI9 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SAA2P0DJI9 KCNIP4-206ENST00000447367 1641 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SAA2P0DJI9 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SAA2P0DJI9 DLK1-202ENST00000341267 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SAA2P0DJI9 BPIFB3-201ENST00000375494 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SAA2P0DJI9 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SAA2P0DJI9 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SAA2P0DJI9 HSD11B1L-221ENST00000583928 1319 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SAA2P0DJI9 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SAA2P0DJI9 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SAA2P0DJI9 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SAA2P0DJI9 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SAA2P0DJI9 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SAA2P0DJI9 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
SAA2P0DJI9 TNPO2-203ENST00000450764 4993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SAA2P0DJI9 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SAA2P0DJI9 BLOC1S3-201ENST00000433642 2601 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SAA2P0DJI9 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SAA2P0DJI9 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SAA2P0DJI9 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SAA2P0DJI9 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24 ms