Protein–RNA interactions for Protein: P0DI81

TRAPPC2, Trafficking protein particle complex subunit 2, humanhuman

Predictions only

Length 140 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC2P0DI81 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
TRAPPC2P0DI81 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
TRAPPC2P0DI81 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
TRAPPC2P0DI81 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
TRAPPC2P0DI81 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
TRAPPC2P0DI81 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
TRAPPC2P0DI81 PDE4A-201ENST00000293683 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
TRAPPC2P0DI81 ADAMTS16-203ENST00000511368 2682 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
TRAPPC2P0DI81 CLCN2-204ENST00000434054 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
TRAPPC2P0DI81 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
TRAPPC2P0DI81 PDE3B-201ENST00000282096 6076 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
TRAPPC2P0DI81 MAPK9-207ENST00000452135 4815 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
TRAPPC2P0DI81 LINC01126-201ENST00000623515 1646 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
TRAPPC2P0DI81 BMS1P4-202ENST00000584747 1716 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
TRAPPC2P0DI81 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
TRAPPC2P0DI81 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
TRAPPC2P0DI81 ADCK5-201ENST00000308860 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
TRAPPC2P0DI81 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
TRAPPC2P0DI81 FERMT2-204ENST00000399304 2082 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
TRAPPC2P0DI81 LINC00336-201ENST00000477984 2107 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
TRAPPC2P0DI81 GRB7-201ENST00000309156 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
TRAPPC2P0DI81 SPIN3-224ENST00000639583 2245 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
TRAPPC2P0DI81 DCAF12L2-201ENST00000360028 2599 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.2
TRAPPC2P0DI81 NKILA-202ENST00000614771 2598 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
TRAPPC2P0DI81 DDHD1-201ENST00000323669 5503 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
TRAPPC2P0DI81 DENR-201ENST00000280557 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
TRAPPC2P0DI81 EGR2-203ENST00000439032 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
TRAPPC2P0DI81 PXK-206ENST00000463280 2825 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
TRAPPC2P0DI81 PARP9-204ENST00000471785 3040 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
TRAPPC2P0DI81 TMEM131-201ENST00000186436 6640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
TRAPPC2P0DI81 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
TRAPPC2P0DI81 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
TRAPPC2P0DI81 AC135776.1-201ENST00000319817 2481 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
TRAPPC2P0DI81 DLK1-202ENST00000341267 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
TRAPPC2P0DI81 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
TRAPPC2P0DI81 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
TRAPPC2P0DI81 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
TRAPPC2P0DI81 ZNF589-203ENST00000427617 1677 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
TRAPPC2P0DI81 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
TRAPPC2P0DI81 CDH6-205ENST00000514738 2569 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
TRAPPC2P0DI81 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
TRAPPC2P0DI81 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
TRAPPC2P0DI81 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
TRAPPC2P0DI81 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
TRAPPC2P0DI81 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
TRAPPC2P0DI81 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
TRAPPC2P0DI81 GRAMD1B-214ENST00000635736 2814 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
TRAPPC2P0DI81 KIAA1549-201ENST00000422774 6283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
TRAPPC2P0DI81 CDK13-201ENST00000181839 7298 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
TRAPPC2P0DI81 RAB35-201ENST00000229340 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
TRAPPC2P0DI81 U73166.1-201ENST00000439898 2625 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
TRAPPC2P0DI81 TOM1L1-221ENST00000575882 2507 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
TRAPPC2P0DI81 LRCH3-201ENST00000334859 2258 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
TRAPPC2P0DI81 SACS-AS1-201ENST00000443092 2234 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
TRAPPC2P0DI81 RNPS1-203ENST00000397086 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
TRAPPC2P0DI81 TLK2-201ENST00000326270 3512 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
TRAPPC2P0DI81 PSRC1-201ENST00000369903 1710 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
TRAPPC2P0DI81 PSRC1-206ENST00000409267 1730 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
TRAPPC2P0DI81 VOPP1-201ENST00000285279 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
TRAPPC2P0DI81 PTPRU-202ENST00000373779 5579 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
TRAPPC2P0DI81 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
TRAPPC2P0DI81 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
TRAPPC2P0DI81 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
TRAPPC2P0DI81 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
TRAPPC2P0DI81 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC16.31■□□□□ 0.2
TRAPPC2P0DI81 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
TRAPPC2P0DI81 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC16.31■□□□□ 0.2
TRAPPC2P0DI81 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
TRAPPC2P0DI81 WWP1-202ENST00000517970 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
TRAPPC2P0DI81 PCNP-201ENST00000265260 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
TRAPPC2P0DI81 AQP10-203ENST00000484864 2262 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
TRAPPC2P0DI81 ALDH3B1-204ENST00000614849 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
TRAPPC2P0DI81 FOXD4L4-201ENST00000377413 2230 ntAPPRIS P1 BASIC16.31■□□□□ 0.2
TRAPPC2P0DI81 CFLAR-208ENST00000423241 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
TRAPPC2P0DI81 EDA-203ENST00000374552 5278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
TRAPPC2P0DI81 AP000347.2-202ENST00000421064 3041 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
TRAPPC2P0DI81 ELFN2-208ENST00000430883 1970 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
TRAPPC2P0DI81 SULT1A1-204ENST00000395609 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
TRAPPC2P0DI81 GCSH-208ENST00000639169 2537 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
TRAPPC2P0DI81 LINC01502-201ENST00000445997 2471 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
TRAPPC2P0DI81 SNAPC3-207ENST00000610884 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
TRAPPC2P0DI81 PLCG1-202ENST00000373271 7395 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
TRAPPC2P0DI81 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
TRAPPC2P0DI81 ALDH1A3-201ENST00000329841 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
TRAPPC2P0DI81 EVI5L-201ENST00000270530 3855 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
TRAPPC2P0DI81 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
TRAPPC2P0DI81 GPRC5B-201ENST00000300571 5213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
TRAPPC2P0DI81 DCST1-202ENST00000368419 2207 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
TRAPPC2P0DI81 POC1B-GALNT4-201ENST00000547474 2207 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
TRAPPC2P0DI81 ZSCAN10-207ENST00000575108 2247 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
TRAPPC2P0DI81 FBXO18-201ENST00000362091 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
TRAPPC2P0DI81 CREG2-201ENST00000324768 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
TRAPPC2P0DI81 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
TRAPPC2P0DI81 AC027796.3-201ENST00000572919 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
TRAPPC2P0DI81 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
TRAPPC2P0DI81 NOMO3-201ENST00000263012 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
TRAPPC2P0DI81 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
TRAPPC2P0DI81 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
TRAPPC2P0DI81 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
TRAPPC2P0DI81 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.3 ms