Protein–RNA interactions for Protein: P0C875

FAM228B, Protein FAM228B, humanhuman

Predictions only

Length 321 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM228BP0C875 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
FAM228BP0C875 ADAMTS8-201ENST00000257359 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
FAM228BP0C875 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
FAM228BP0C875 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
FAM228BP0C875 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
FAM228BP0C875 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
FAM228BP0C875 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
FAM228BP0C875 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
FAM228BP0C875 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
FAM228BP0C875 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
FAM228BP0C875 MICU3-201ENST00000318063 3992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
FAM228BP0C875 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
FAM228BP0C875 GATAD1-201ENST00000287957 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
FAM228BP0C875 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
FAM228BP0C875 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
FAM228BP0C875 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
FAM228BP0C875 CCDC17-209ENST00000528266 2181 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
FAM228BP0C875 CABIN1-202ENST00000337989 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
FAM228BP0C875 MMD2-202ENST00000404774 2415 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
FAM228BP0C875 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
FAM228BP0C875 B4GALT4-202ENST00000393765 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
FAM228BP0C875 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
FAM228BP0C875 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
FAM228BP0C875 AL354751.1-201ENST00000412768 1863 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
FAM228BP0C875 SERPINA4-201ENST00000298841 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
FAM228BP0C875 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
FAM228BP0C875 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
FAM228BP0C875 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
FAM228BP0C875 PRDM14-201ENST00000276594 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
FAM228BP0C875 AC018470.1-201ENST00000624790 3129 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
FAM228BP0C875 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
FAM228BP0C875 LRP3-201ENST00000253193 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
FAM228BP0C875 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
FAM228BP0C875 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC20.24■□□□□ 0.83
FAM228BP0C875 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
FAM228BP0C875 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
FAM228BP0C875 Z85996.1-201ENST00000494644 937 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
FAM228BP0C875 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
FAM228BP0C875 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
FAM228BP0C875 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
FAM228BP0C875 ZNF667-AS1-206ENST00000591797 535 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
FAM228BP0C875 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC20.24■□□□□ 0.83
FAM228BP0C875 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
FAM228BP0C875 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
FAM228BP0C875 FAM3A-201ENST00000322269 1815 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
FAM228BP0C875 SAMD11-210ENST00000616016 2391 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
FAM228BP0C875 SAMD11-215ENST00000618779 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
FAM228BP0C875 ORC5-201ENST00000297431 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
FAM228BP0C875 LEFTY2-201ENST00000366820 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
FAM228BP0C875 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
FAM228BP0C875 GPT-202ENST00000394955 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
FAM228BP0C875 BAG3-201ENST00000369085 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
FAM228BP0C875 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
FAM228BP0C875 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
FAM228BP0C875 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
FAM228BP0C875 TMPRSS5-209ENST00000544634 1524 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
FAM228BP0C875 MATN4-201ENST00000353917 1657 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
FAM228BP0C875 NF2-203ENST00000353887 1845 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
FAM228BP0C875 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
FAM228BP0C875 ACADS-201ENST00000242592 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
FAM228BP0C875 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
FAM228BP0C875 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
FAM228BP0C875 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
FAM228BP0C875 KRT6A-201ENST00000330722 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
FAM228BP0C875 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
FAM228BP0C875 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
FAM228BP0C875 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
FAM228BP0C875 AC005056.1-201ENST00000435932 532 ntTSL 4 BASIC20.23■□□□□ 0.83
FAM228BP0C875 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
FAM228BP0C875 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
FAM228BP0C875 UBE2QL1-201ENST00000399816 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
FAM228BP0C875 PTPA-223ENST00000452489 2526 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
FAM228BP0C875 CLN8-211ENST00000636934 1790 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
FAM228BP0C875 GUCY1A2-201ENST00000282249 3047 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
FAM228BP0C875 FAM219B-204ENST00000563119 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
FAM228BP0C875 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
FAM228BP0C875 URI1-202ENST00000392271 3444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
FAM228BP0C875 ANKRD10-201ENST00000267339 2495 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
FAM228BP0C875 ZNF205-206ENST00000620094 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
FAM228BP0C875 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
FAM228BP0C875 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
FAM228BP0C875 CASD1-201ENST00000297273 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
FAM228BP0C875 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
FAM228BP0C875 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
FAM228BP0C875 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
FAM228BP0C875 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
FAM228BP0C875 AC126763.1-201ENST00000552015 2118 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
FAM228BP0C875 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
FAM228BP0C875 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
FAM228BP0C875 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
FAM228BP0C875 CBS-203ENST00000398158 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
FAM228BP0C875 CBSL-206ENST00000624406 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
FAM228BP0C875 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
FAM228BP0C875 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
FAM228BP0C875 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
FAM228BP0C875 ZHX3-212ENST00000558993 1528 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
FAM228BP0C875 SPART-209ENST00000494062 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
FAM228BP0C875 RRN3-205ENST00000563559 2128 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
FAM228BP0C875 KIFC3-201ENST00000379655 3427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
FAM228BP0C875 GNAS-AS1-202ENST00000443966 2341 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24 ms