Protein–RNA interactions for Protein: P0C7W6

CCDC172, Coiled-coil domain-containing protein 172, humanhuman

Predictions only

Length 258 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC172P0C7W6 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CCDC172P0C7W6 TSC22D4-202ENST00000393991 1469 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CCDC172P0C7W6 MCCC1-214ENST00000610757 2410 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CCDC172P0C7W6 FDXR-217ENST00000582944 1766 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CCDC172P0C7W6 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CCDC172P0C7W6 ZSCAN18-201ENST00000240727 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CCDC172P0C7W6 DIP2A-203ENST00000435722 2760 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CCDC172P0C7W6 ELOC-209ENST00000602840 2780 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CCDC172P0C7W6 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CCDC172P0C7W6 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CCDC172P0C7W6 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CCDC172P0C7W6 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CCDC172P0C7W6 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CCDC172P0C7W6 FGFR3-205ENST00000440486 4287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CCDC172P0C7W6 PLA2R1-202ENST00000392771 5160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CCDC172P0C7W6 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CCDC172P0C7W6 ENOPH1-203ENST00000509635 1874 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CCDC172P0C7W6 ANKIB1-201ENST00000265742 6081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CCDC172P0C7W6 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CCDC172P0C7W6 SLC39A1-209ENST00000537590 2022 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CCDC172P0C7W6 ISLR2-201ENST00000361742 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CCDC172P0C7W6 CHRNA4-201ENST00000370263 5577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CCDC172P0C7W6 AC011944.1-201ENST00000316148 1900 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CCDC172P0C7W6 ZBTB45-201ENST00000354590 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CCDC172P0C7W6 CLMP-201ENST00000448775 5072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CCDC172P0C7W6 SENP6-201ENST00000327284 2700 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CCDC172P0C7W6 OGFOD2-207ENST00000536150 1956 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CCDC172P0C7W6 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CCDC172P0C7W6 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CCDC172P0C7W6 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CCDC172P0C7W6 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CCDC172P0C7W6 MTMR1-208ENST00000445323 4516 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CCDC172P0C7W6 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CCDC172P0C7W6 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CCDC172P0C7W6 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CCDC172P0C7W6 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CCDC172P0C7W6 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CCDC172P0C7W6 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CCDC172P0C7W6 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CCDC172P0C7W6 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CCDC172P0C7W6 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CCDC172P0C7W6 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CCDC172P0C7W6 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CCDC172P0C7W6 SMC4-201ENST00000344722 5356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CCDC172P0C7W6 SLC35E4-201ENST00000343605 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CCDC172P0C7W6 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CCDC172P0C7W6 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CCDC172P0C7W6 ARNTL-201ENST00000389707 2776 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CCDC172P0C7W6 STK10-201ENST00000176763 6060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CCDC172P0C7W6 FMR1-207ENST00000439526 3699 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CCDC172P0C7W6 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CCDC172P0C7W6 DAG1-220ENST00000539901 5665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CCDC172P0C7W6 AL031598.1-201ENST00000561511 1773 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
CCDC172P0C7W6 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CCDC172P0C7W6 SNX27-203ENST00000368843 7197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CCDC172P0C7W6 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CCDC172P0C7W6 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CCDC172P0C7W6 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CCDC172P0C7W6 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CCDC172P0C7W6 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CCDC172P0C7W6 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CCDC172P0C7W6 AC005056.1-201ENST00000435932 532 ntTSL 4 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CCDC172P0C7W6 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CCDC172P0C7W6 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
CCDC172P0C7W6 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CCDC172P0C7W6 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CCDC172P0C7W6 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CCDC172P0C7W6 COX20-203ENST00000411948 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CCDC172P0C7W6 HIPK1-207ENST00000369561 3777 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CCDC172P0C7W6 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CCDC172P0C7W6 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CCDC172P0C7W6 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CCDC172P0C7W6 FZD10-202ENST00000539839 3282 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
CCDC172P0C7W6 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CCDC172P0C7W6 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CCDC172P0C7W6 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CCDC172P0C7W6 TLK2-203ENST00000346027 3449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CCDC172P0C7W6 LRCH3-207ENST00000441090 2034 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CCDC172P0C7W6 RASSF1-210ENST00000616212 1842 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CCDC172P0C7W6 ESPN-216ENST00000636330 4731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CCDC172P0C7W6 ITGB5-201ENST00000296181 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CCDC172P0C7W6 GCDH-216ENST00000591470 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CCDC172P0C7W6 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CCDC172P0C7W6 ADAMTS8-201ENST00000257359 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CCDC172P0C7W6 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CCDC172P0C7W6 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CCDC172P0C7W6 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CCDC172P0C7W6 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
CCDC172P0C7W6 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CCDC172P0C7W6 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CCDC172P0C7W6 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CCDC172P0C7W6 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CCDC172P0C7W6 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CCDC172P0C7W6 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CCDC172P0C7W6 PHF20L1-209ENST00000395386 6237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CCDC172P0C7W6 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CCDC172P0C7W6 NEFHP1-201ENST00000412845 2629 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
CCDC172P0C7W6 COL5A3-201ENST00000264828 6174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CCDC172P0C7W6 MICU3-201ENST00000318063 3992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CCDC172P0C7W6 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.1 ms