Protein–RNA interactions for Protein: P08575

PTPRC, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase C, humanhuman

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Length 1,304 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRCP08575 AC008735.6-201ENST00000635964 1292 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
PTPRCP08575 CLN6-221ENST00000637494 765 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
PTPRCP08575 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
PTPRCP08575 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
PTPRCP08575 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
PTPRCP08575 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
PTPRCP08575 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC23.97■■□□□ 1.43
PTPRCP08575 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
PTPRCP08575 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC23.97■■□□□ 1.43
PTPRCP08575 AL109659.2-201ENST00000606809 1674 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
PTPRCP08575 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PTPRCP08575 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PTPRCP08575 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PTPRCP08575 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PTPRCP08575 LINC02028-204ENST00000449350 1419 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
PTPRCP08575 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PTPRCP08575 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
PTPRCP08575 AIF1L-203ENST00000372298 849 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
PTPRCP08575 HMGA1P5-201ENST00000412453 271 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
PTPRCP08575 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PTPRCP08575 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
PTPRCP08575 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
PTPRCP08575 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PTPRCP08575 HEIH-201ENST00000623091 1652 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
PTPRCP08575 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PTPRCP08575 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PTPRCP08575 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PTPRCP08575 MRPL3-202ENST00000425847 1457 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
PTPRCP08575 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PTPRCP08575 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PTPRCP08575 P2RX5-203ENST00000547178 1998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
PTPRCP08575 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.43
PTPRCP08575 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
PTPRCP08575 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
PTPRCP08575 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
PTPRCP08575 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
PTPRCP08575 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
PTPRCP08575 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
PTPRCP08575 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
PTPRCP08575 INSIG1-202ENST00000342407 1127 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
PTPRCP08575 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC23.95■■□□□ 1.42
PTPRCP08575 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
PTPRCP08575 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
PTPRCP08575 NDUFB10-202ENST00000543683 830 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
PTPRCP08575 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC23.95■■□□□ 1.42
PTPRCP08575 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
PTPRCP08575 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
PTPRCP08575 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
PTPRCP08575 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC23.95■■□□□ 1.42
PTPRCP08575 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
PTPRCP08575 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
PTPRCP08575 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
PTPRCP08575 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
PTPRCP08575 PHKG2-202ENST00000424889 1566 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
PTPRCP08575 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
PTPRCP08575 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
PTPRCP08575 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
PTPRCP08575 TMEM104-202ENST00000417024 1781 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
PTPRCP08575 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PTPRCP08575 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PTPRCP08575 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
PTPRCP08575 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PTPRCP08575 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PTPRCP08575 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PTPRCP08575 PHB2-202ENST00000440277 996 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
PTPRCP08575 SLC25A3P1-201ENST00000443844 931 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
PTPRCP08575 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
PTPRCP08575 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
PTPRCP08575 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
PTPRCP08575 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PTPRCP08575 GOSR2-226ENST00000639287 2367 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
PTPRCP08575 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PTPRCP08575 ILK-203ENST00000420936 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PTPRCP08575 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PTPRCP08575 LINC00466-207ENST00000634725 1736 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
PTPRCP08575 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
PTPRCP08575 MCCD1P1-208ENST00000445732 328 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
PTPRCP08575 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
PTPRCP08575 AP006621.4-201ENST00000527021 532 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
PTPRCP08575 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
PTPRCP08575 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC23.93■■□□□ 1.42
PTPRCP08575 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
PTPRCP08575 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
PTPRCP08575 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
PTPRCP08575 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
PTPRCP08575 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
PTPRCP08575 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
PTPRCP08575 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
PTPRCP08575 POMZP3-201ENST00000275569 1259 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
PTPRCP08575 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
PTPRCP08575 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
PTPRCP08575 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
PTPRCP08575 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
PTPRCP08575 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
PTPRCP08575 AC002094.1-201ENST00000591482 1050 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
PTPRCP08575 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
PTPRCP08575 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
PTPRCP08575 AP2M1-201ENST00000292807 1931 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
PTPRCP08575 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
PTPRCP08575 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
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