Protein–RNA interactions for Protein: P06493

CDK1, Cyclin-dependent kinase 1, humanhuman

Predictions only

Length 297 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK1P06493 ZNF48-205ENST00000613509 3339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
CDK1P06493 PIP5K1C-205ENST00000589578 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
CDK1P06493 HDAC10-201ENST00000216271 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
CDK1P06493 IL17RC-201ENST00000295981 2621 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
CDK1P06493 STK11-201ENST00000326873 2611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
CDK1P06493 MTHFD2L-203ENST00000395759 2354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
CDK1P06493 POC1B-GALNT4-201ENST00000547474 2207 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
CDK1P06493 SAMD5-201ENST00000367474 6089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
CDK1P06493 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.33
CDK1P06493 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
CDK1P06493 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
CDK1P06493 ARAP1-AS2-201ENST00000500163 1824 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
CDK1P06493 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
CDK1P06493 KCNIP4-205ENST00000382152 1767 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
CDK1P06493 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CDK1P06493 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CDK1P06493 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CDK1P06493 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
CDK1P06493 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
CDK1P06493 ATPAF1-214ENST00000576409 4158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CDK1P06493 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CDK1P06493 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CDK1P06493 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CDK1P06493 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CDK1P06493 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CDK1P06493 GLIS1-201ENST00000312233 2812 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CDK1P06493 PIGZ-202ENST00000412723 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CDK1P06493 AVPR1A-201ENST00000299178 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CDK1P06493 CDK11A-203ENST00000357760 2446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CDK1P06493 CDK11A-204ENST00000358779 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CDK1P06493 CDK11A-206ENST00000378638 2429 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CDK1P06493 CDK11A-208ENST00000404249 2449 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CDK1P06493 KHNYN-206ENST00000556842 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CDK1P06493 MYC-207ENST00000621592 2366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CDK1P06493 SLC22A4-201ENST00000200652 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CDK1P06493 RPS6KA5-201ENST00000418736 2249 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CDK1P06493 MAEA-201ENST00000264750 2058 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CDK1P06493 AC142086.1-202ENST00000398669 1839 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CDK1P06493 WAC-205ENST00000375664 5924 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CDK1P06493 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CDK1P06493 PCDHA8-201ENST00000378123 2616 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CDK1P06493 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CDK1P06493 FHL1-205ENST00000370690 2441 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CDK1P06493 STX6-201ENST00000258301 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CDK1P06493 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CDK1P06493 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CDK1P06493 CPZ-201ENST00000315782 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CDK1P06493 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CDK1P06493 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CDK1P06493 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CDK1P06493 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CDK1P06493 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CDK1P06493 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CDK1P06493 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CDK1P06493 COL18A1-204ENST00000400337 5436 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CDK1P06493 SNAI3-AS1-205ENST00000568633 2096 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
CDK1P06493 HNRNPLL-202ENST00000358367 2779 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CDK1P06493 FARP1-242ENST00000627049 5103 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CDK1P06493 POLR1D-220ENST00000637071 1943 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CDK1P06493 ULK3-220ENST00000569437 2611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CDK1P06493 ZNF416-201ENST00000196489 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CDK1P06493 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CDK1P06493 ADGRA3-202ENST00000334304 4566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CDK1P06493 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CDK1P06493 UNC5B-201ENST00000335350 6841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CDK1P06493 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CDK1P06493 SYDE2-202ENST00000341460 5512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CDK1P06493 MAPK9-207ENST00000452135 4815 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CDK1P06493 SLC27A5-207ENST00000601355 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CDK1P06493 DDX51-202ENST00000397333 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CDK1P06493 RNF144A-201ENST00000320892 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CDK1P06493 THEG-201ENST00000342640 1877 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CDK1P06493 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CDK1P06493 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CDK1P06493 PCBP4-210ENST00000471622 1784 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CDK1P06493 DPAGT1-203ENST00000409993 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CDK1P06493 IFFO1-201ENST00000336604 2686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CDK1P06493 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CDK1P06493 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
CDK1P06493 DIO1-217ENST00000617230 1656 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CDK1P06493 TNIP1-221ENST00000610874 2629 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CDK1P06493 SMPD4-202ENST00000409031 4896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CDK1P06493 NLE1-203ENST00000586869 5286 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CDK1P06493 CDK16-223ENST00000622098 2968 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CDK1P06493 AC005498.3-201ENST00000596587 2045 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CDK1P06493 CMPK2-201ENST00000256722 2884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CDK1P06493 AHCYL2-201ENST00000325006 5056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CDK1P06493 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
CDK1P06493 IRAK3-202ENST00000457197 1853 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
CDK1P06493 RGL3-202ENST00000393423 2278 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CDK1P06493 NEXN-AS1-201ENST00000421331 2292 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
CDK1P06493 CDK10-202ENST00000353379 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CDK1P06493 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CDK1P06493 SIRPAP1-201ENST00000448467 1770 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
CDK1P06493 TMEM235-203ENST00000550981 1786 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
CDK1P06493 DYNLL1-209ENST00000550845 1376 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CDK1P06493 MCU-201ENST00000357157 2874 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CDK1P06493 BMS1P4-202ENST00000584747 1716 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CDK1P06493 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
CDK1P06493 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.5 ms