Protein–RNA interactions for Protein: P05106

ITGB3, Integrin beta-3, humanhuman

Predictions only

Length 788 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGB3P05106 RCN1P1-201ENST00000400413 996 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
ITGB3P05106 HMGA1P5-201ENST00000412453 271 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
ITGB3P05106 AP001059.1-201ENST00000442785 523 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
ITGB3P05106 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
ITGB3P05106 KRT18P21-201ENST00000515767 1272 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
ITGB3P05106 MVB12A-204ENST00000528515 686 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
ITGB3P05106 AC010203.1-204ENST00000548782 407 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
ITGB3P05106 LY6L-201ENST00000562505 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
ITGB3P05106 P4HB-223ENST00000576390 439 ntTSL 4 BASIC20.37■□□□□ 0.85
ITGB3P05106 AL158151.3-201ENST00000599172 696 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
ITGB3P05106 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
ITGB3P05106 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
ITGB3P05106 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
ITGB3P05106 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
ITGB3P05106 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
ITGB3P05106 ZHX3-212ENST00000558993 1528 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
ITGB3P05106 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
ITGB3P05106 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC20.37■□□□□ 0.85
ITGB3P05106 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC20.36■□□□□ 0.85
ITGB3P05106 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
ITGB3P05106 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
ITGB3P05106 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
ITGB3P05106 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
ITGB3P05106 TMEM110-MUSTN1-202ENST00000504329 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
ITGB3P05106 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
ITGB3P05106 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
ITGB3P05106 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
ITGB3P05106 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
ITGB3P05106 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
ITGB3P05106 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC20.36■□□□□ 0.85
ITGB3P05106 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
ITGB3P05106 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
ITGB3P05106 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
ITGB3P05106 TERF1P1-201ENST00000311003 1181 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
ITGB3P05106 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
ITGB3P05106 INSIG1-202ENST00000342407 1127 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
ITGB3P05106 AC008105.2-201ENST00000420431 579 ntTSL 4 BASIC20.36■□□□□ 0.85
ITGB3P05106 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
ITGB3P05106 GXYLT1P6-201ENST00000456472 1187 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
ITGB3P05106 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
ITGB3P05106 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
ITGB3P05106 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
ITGB3P05106 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
ITGB3P05106 MIR4674-201ENST00000582457 87 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
ITGB3P05106 FP565260.3-205ENST00000620481 816 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
ITGB3P05106 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
ITGB3P05106 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
ITGB3P05106 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
ITGB3P05106 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
ITGB3P05106 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
ITGB3P05106 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
ITGB3P05106 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
ITGB3P05106 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
ITGB3P05106 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
ITGB3P05106 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
ITGB3P05106 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
ITGB3P05106 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
ITGB3P05106 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
ITGB3P05106 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
ITGB3P05106 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
ITGB3P05106 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
ITGB3P05106 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
ITGB3P05106 AL137013.1-201ENST00000432946 1228 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
ITGB3P05106 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
ITGB3P05106 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
ITGB3P05106 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
ITGB3P05106 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC20.35■□□□□ 0.85
ITGB3P05106 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
ITGB3P05106 KATNBL1P6-202ENST00000562413 1466 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
ITGB3P05106 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
ITGB3P05106 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
ITGB3P05106 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
ITGB3P05106 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
ITGB3P05106 TMEM91-210ENST00000542945 1610 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
ITGB3P05106 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ITGB3P05106 TMEM53-201ENST00000372235 890 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
ITGB3P05106 KRT18P57-201ENST00000443599 1254 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
ITGB3P05106 AC002467.1-201ENST00000457510 657 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
ITGB3P05106 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
ITGB3P05106 NDUFA10-214ENST00000620965 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
ITGB3P05106 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
ITGB3P05106 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
ITGB3P05106 AC116565.2-201ENST00000637674 1854 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
ITGB3P05106 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ITGB3P05106 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ITGB3P05106 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ITGB3P05106 DNAJC8-201ENST00000263697 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ITGB3P05106 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
ITGB3P05106 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
ITGB3P05106 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
ITGB3P05106 ST3GAL3-205ENST00000347631 1324 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
ITGB3P05106 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
ITGB3P05106 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
ITGB3P05106 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
ITGB3P05106 LIN28AP1-201ENST00000429574 405 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
ITGB3P05106 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
ITGB3P05106 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
ITGB3P05106 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
ITGB3P05106 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
ITGB3P05106 TMPRSS5-209ENST00000544634 1524 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.8 ms