Protein–RNA interactions for Protein: P01763

IGHV3-48, Immunoglobulin heavy variable 3-48, humanhuman

Predictions only

Length 117 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IGHV3-48P01763 FAM90A1-201ENST00000307435 2342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
IGHV3-48P01763 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
IGHV3-48P01763 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
IGHV3-48P01763 PRODH-215ENST00000610940 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
IGHV3-48P01763 MAGI3-201ENST00000307546 6430 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
IGHV3-48P01763 ST3GAL3-201ENST00000262915 2470 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
IGHV3-48P01763 GDF10-201ENST00000580279 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
IGHV3-48P01763 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
IGHV3-48P01763 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
IGHV3-48P01763 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
IGHV3-48P01763 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
IGHV3-48P01763 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
IGHV3-48P01763 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
IGHV3-48P01763 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
IGHV3-48P01763 KCNC4-203ENST00000413138 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
IGHV3-48P01763 APP-203ENST00000354192 3167 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
IGHV3-48P01763 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
IGHV3-48P01763 IL10RB-201ENST00000290200 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
IGHV3-48P01763 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
IGHV3-48P01763 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
IGHV3-48P01763 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
IGHV3-48P01763 ADK-206ENST00000541550 2222 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
IGHV3-48P01763 ZNFX1-203ENST00000371754 5235 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
IGHV3-48P01763 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
IGHV3-48P01763 MAPKAP1-205ENST00000373503 3045 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
IGHV3-48P01763 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
IGHV3-48P01763 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC15.05■□□□□ -0
IGHV3-48P01763 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
IGHV3-48P01763 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC15.05■□□□□ -0
IGHV3-48P01763 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
IGHV3-48P01763 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
IGHV3-48P01763 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
IGHV3-48P01763 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
IGHV3-48P01763 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
IGHV3-48P01763 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
IGHV3-48P01763 CACNA1A-253ENST00000637927 6847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
IGHV3-48P01763 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
IGHV3-48P01763 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
IGHV3-48P01763 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
IGHV3-48P01763 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
IGHV3-48P01763 GDF5OS-201ENST00000374375 1734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
IGHV3-48P01763 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
IGHV3-48P01763 PHKA2-201ENST00000379942 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
IGHV3-48P01763 CBSL-210ENST00000624934 1992 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
IGHV3-48P01763 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
IGHV3-48P01763 TMEM206-201ENST00000261455 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
IGHV3-48P01763 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
IGHV3-48P01763 ELL2-201ENST00000237853 6046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
IGHV3-48P01763 RNF146-201ENST00000309649 2624 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC15.04■□□□□ -0
IGHV3-48P01763 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
IGHV3-48P01763 CD55-206ENST00000391921 2433 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
IGHV3-48P01763 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
IGHV3-48P01763 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
IGHV3-48P01763 FDXR-217ENST00000582944 1766 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
IGHV3-48P01763 PDE1C-206ENST00000396193 5109 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
IGHV3-48P01763 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
IGHV3-48P01763 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
IGHV3-48P01763 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
IGHV3-48P01763 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
IGHV3-48P01763 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
IGHV3-48P01763 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
IGHV3-48P01763 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
IGHV3-48P01763 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
IGHV3-48P01763 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
IGHV3-48P01763 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
IGHV3-48P01763 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
IGHV3-48P01763 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC15.04■□□□□ -0
IGHV3-48P01763 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
IGHV3-48P01763 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC15.04■□□□□ -0
IGHV3-48P01763 SLC35A3-217ENST00000639807 2767 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
IGHV3-48P01763 IL6R-202ENST00000368485 5914 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
IGHV3-48P01763 ZNF274-203ENST00000424679 2539 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
IGHV3-48P01763 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
IGHV3-48P01763 WWOX-214ENST00000566780 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
IGHV3-48P01763 WIZP1-201ENST00000531444 2299 ntBASIC15.04■□□□□ -0
IGHV3-48P01763 TAF4B-201ENST00000269142 5260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
IGHV3-48P01763 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
IGHV3-48P01763 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
IGHV3-48P01763 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
IGHV3-48P01763 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
IGHV3-48P01763 GCDH-216ENST00000591470 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
IGHV3-48P01763 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC15.03■□□□□ -0
IGHV3-48P01763 DEF8-211ENST00000563795 1767 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
IGHV3-48P01763 PLCG1-201ENST00000244007 5285 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
IGHV3-48P01763 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
IGHV3-48P01763 CASKIN2-201ENST00000321617 5015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
IGHV3-48P01763 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
IGHV3-48P01763 DIAPH2-205ENST00000373061 4983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
IGHV3-48P01763 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
IGHV3-48P01763 IFFO1-204ENST00000396840 2677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
IGHV3-48P01763 PIF1-205ENST00000559239 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
IGHV3-48P01763 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
IGHV3-48P01763 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
IGHV3-48P01763 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
IGHV3-48P01763 SEC14L2-215ENST00000617837 2632 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
IGHV3-48P01763 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
IGHV3-48P01763 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
IGHV3-48P01763 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
IGHV3-48P01763 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
IGHV3-48P01763 SEMA3C-201ENST00000265361 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31 ms