Protein–RNA interactions for Protein: P00746

CFD, Complement factor D, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 253 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CFDP00746 CDC25A-201ENST00000302506 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CFDP00746 AC112229.1-202ENST00000490013 2918 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CFDP00746 LINC01569-202ENST00000573042 2093 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CFDP00746 FAM69C-201ENST00000343998 3671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CFDP00746 CSK-210ENST00000567571 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CFDP00746 SPAG9-202ENST00000357122 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CFDP00746 NOMO2-211ENST00000621364 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CFDP00746 ZSWIM5-201ENST00000359600 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CFDP00746 LINC00574-201ENST00000420557 2318 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CFDP00746 BPHL-203ENST00000380379 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CFDP00746 EXT2-202ENST00000358681 2997 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CFDP00746 NFE2L3-201ENST00000056233 3686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CFDP00746 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CFDP00746 PCDH8P1-201ENST00000428983 2773 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
CFDP00746 MCOLN2-201ENST00000284027 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CFDP00746 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CFDP00746 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CFDP00746 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CFDP00746 UNKL-204ENST00000389221 5116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CFDP00746 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CFDP00746 SYVN1-201ENST00000294256 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CFDP00746 C5orf30-201ENST00000319933 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CFDP00746 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CFDP00746 ANKS1A-201ENST00000360359 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CFDP00746 FICD-204ENST00000552695 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CFDP00746 TMPRSS5-205ENST00000538955 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CFDP00746 PTPN5-202ENST00000396166 2299 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CFDP00746 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CFDP00746 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CFDP00746 PCDH1-201ENST00000287008 4793 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CFDP00746 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CFDP00746 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC15.77■□□□□ 0.11
CFDP00746 HNRNPF-204ENST00000443950 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CFDP00746 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
CFDP00746 LINC00200-201ENST00000425630 2434 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CFDP00746 RAB43-201ENST00000315150 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CFDP00746 DAGLB-204ENST00000436575 2385 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
CFDP00746 BCL7A-203ENST00000538010 6247 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CFDP00746 IGFBP3-203ENST00000381086 2322 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
CFDP00746 VSIG10L2-202ENST00000638636 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
CFDP00746 PEX6-202ENST00000304611 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CFDP00746 PRSS23-209ENST00000533902 2043 ntTSL 4 BASIC15.77■□□□□ 0.11
CFDP00746 MST1R-214ENST00000613534 2025 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CFDP00746 WT1-201ENST00000332351 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CFDP00746 AC018755.2-202ENST00000429354 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CFDP00746 POLR1D-220ENST00000637071 1943 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CFDP00746 AGO4-201ENST00000373210 7116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CFDP00746 CCT6A-201ENST00000275603 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CFDP00746 PDE9A-209ENST00000398227 1606 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CFDP00746 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CFDP00746 HCG11-201ENST00000411553 5696 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
CFDP00746 PP7080-201ENST00000342584 1876 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CFDP00746 MPP5-201ENST00000261681 5552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CFDP00746 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CFDP00746 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CFDP00746 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CFDP00746 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CFDP00746 ZIC1-201ENST00000282928 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CFDP00746 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CFDP00746 INPP5J-213ENST00000620191 2306 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CFDP00746 LMTK2-201ENST00000297293 8946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CFDP00746 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CFDP00746 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CFDP00746 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
CFDP00746 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
CFDP00746 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
CFDP00746 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CFDP00746 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CFDP00746 NRXN2-202ENST00000301894 3535 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CFDP00746 SPAG1-201ENST00000251809 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CFDP00746 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CFDP00746 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CFDP00746 ANO7L1-203ENST00000602586 1720 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
CFDP00746 ADCY3-201ENST00000260600 5050 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CFDP00746 MBD1-204ENST00000347968 3091 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CFDP00746 DDX51-202ENST00000397333 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CFDP00746 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CFDP00746 RAD1-202ENST00000341754 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CFDP00746 BAIAP2L2-201ENST00000332536 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CFDP00746 AFG3L2-201ENST00000269143 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CFDP00746 RASGRP2-206ENST00000377494 2983 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CFDP00746 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CFDP00746 AL513477.1-201ENST00000602865 2407 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
CFDP00746 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CFDP00746 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CFDP00746 HIBCH-201ENST00000359678 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CFDP00746 CMTM3-214ENST00000567572 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CFDP00746 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CFDP00746 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CFDP00746 PDCD1-201ENST00000334409 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CFDP00746 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CFDP00746 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
CFDP00746 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
CFDP00746 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CFDP00746 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CFDP00746 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CFDP00746 SNX2-213ENST00000514949 2119 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CFDP00746 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CFDP00746 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
CFDP00746 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.2 ms