Protein–RNA interactions for Protein: O95786

DDX58, Probable ATP-dependent RNA helicase DDX58, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 925 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDX58O95786 MRPL46-202ENST00000558531 1002 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
DDX58O95786 MTHFS-202ENST00000559722 948 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
DDX58O95786 TPM1-226ENST00000560959 925 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
DDX58O95786 AL441883.1-201ENST00000566170 1045 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
DDX58O95786 C17orf62-221ENST00000581196 668 ntTSL 4 BASIC23.96■■□□□ 1.43
DDX58O95786 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
DDX58O95786 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
DDX58O95786 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
DDX58O95786 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
DDX58O95786 JPT1-203ENST00000409753 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
DDX58O95786 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.43
DDX58O95786 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
DDX58O95786 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
DDX58O95786 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
DDX58O95786 PIEZO1-202ENST00000327397 1246 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
DDX58O95786 GUK1-204ENST00000366721 689 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
DDX58O95786 LCE3D-201ENST00000368787 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
DDX58O95786 IMP3-202ENST00000403490 1237 ntAPPRIS P1 BASIC23.95■■□□□ 1.42
DDX58O95786 AC019068.1-202ENST00000483218 768 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
DDX58O95786 AC087388.1-201ENST00000571370 1112 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
DDX58O95786 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
DDX58O95786 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
DDX58O95786 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
DDX58O95786 PTPRK-218ENST00000525459 1722 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
DDX58O95786 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
DDX58O95786 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
DDX58O95786 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
DDX58O95786 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
DDX58O95786 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
DDX58O95786 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
DDX58O95786 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
DDX58O95786 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
DDX58O95786 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
DDX58O95786 MRPL3-202ENST00000425847 1457 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
DDX58O95786 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
DDX58O95786 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
DDX58O95786 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
DDX58O95786 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
DDX58O95786 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
DDX58O95786 TSPAN14-202ENST00000341863 1037 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
DDX58O95786 HSD11B1L-205ENST00000422535 730 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
DDX58O95786 HDAC11-AS1-201ENST00000424112 515 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
DDX58O95786 AL513320.1-201ENST00000435049 622 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
DDX58O95786 MIR3180-5-201ENST00000583743 153 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
DDX58O95786 UQCR11-201ENST00000585671 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
DDX58O95786 GEMIN7-203ENST00000591607 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
DDX58O95786 BCL2L12-208ENST00000600947 633 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
DDX58O95786 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC23.94■■□□□ 1.42
DDX58O95786 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
DDX58O95786 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
DDX58O95786 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
DDX58O95786 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
DDX58O95786 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
DDX58O95786 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
DDX58O95786 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
DDX58O95786 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
DDX58O95786 TMPRSS5-209ENST00000544634 1524 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
DDX58O95786 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
DDX58O95786 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
DDX58O95786 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
DDX58O95786 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
DDX58O95786 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
DDX58O95786 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
DDX58O95786 KCNK4-205ENST00000538767 1389 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
DDX58O95786 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
DDX58O95786 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
DDX58O95786 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
DDX58O95786 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
DDX58O95786 SIX5-203ENST00000560168 1975 ntTSL 4 BASIC23.93■■□□□ 1.42
DDX58O95786 GAD2-202ENST00000376248 680 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
DDX58O95786 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
DDX58O95786 SAPCD2P2-201ENST00000431719 1174 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
DDX58O95786 MAP3K13-213ENST00000454237 526 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
DDX58O95786 AZIN1-AS1-214ENST00000522850 473 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
DDX58O95786 UBA52-210ENST00000598780 668 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
DDX58O95786 COLCA2-205ENST00000614153 1264 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
DDX58O95786 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
DDX58O95786 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
DDX58O95786 TRPM4-213ENST00000599628 1829 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
DDX58O95786 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
DDX58O95786 VWA8-AS1-201ENST00000611103 2079 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
DDX58O95786 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC23.93■■□□□ 1.42
DDX58O95786 MED25-212ENST00000618715 1467 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
DDX58O95786 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
DDX58O95786 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
DDX58O95786 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
DDX58O95786 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
DDX58O95786 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
DDX58O95786 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
DDX58O95786 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
DDX58O95786 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
DDX58O95786 AC036111.1-201ENST00000533973 1582 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
DDX58O95786 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
DDX58O95786 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
DDX58O95786 COPE-203ENST00000351079 907 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
DDX58O95786 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
DDX58O95786 RNF146-204ENST00000476956 884 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
DDX58O95786 AC004080.5-201ENST00000498652 368 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
DDX58O95786 APBB3-216ENST00000511201 1014 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
DDX58O95786 CCNG1-211ENST00000512163 919 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.8 ms