Protein–RNA interactions for Protein: O95696

BRD1, Bromodomain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,058 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRD1O95696 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
BRD1O95696 SNAI3-AS1-205ENST00000568633 2096 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
BRD1O95696 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
BRD1O95696 RNFT2-202ENST00000319176 2180 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
BRD1O95696 RNFT2-209ENST00000622220 2176 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
BRD1O95696 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
BRD1O95696 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
BRD1O95696 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
BRD1O95696 CPZ-201ENST00000315782 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
BRD1O95696 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
BRD1O95696 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
BRD1O95696 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
BRD1O95696 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
BRD1O95696 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
BRD1O95696 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
BRD1O95696 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
BRD1O95696 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
BRD1O95696 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
BRD1O95696 BMP2K-208ENST00000628286 3848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
BRD1O95696 NR4A1-203ENST00000394824 2639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
BRD1O95696 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
BRD1O95696 DNAJA3-203ENST00000431375 2294 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
BRD1O95696 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
BRD1O95696 KCNQ2-218ENST00000629676 2399 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
BRD1O95696 AL034417.2-201ENST00000445300 2044 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
BRD1O95696 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
BRD1O95696 PCCA-202ENST00000376285 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
BRD1O95696 AC026412.3-201ENST00000605200 1661 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
BRD1O95696 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
BRD1O95696 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
BRD1O95696 ADRA1A-201ENST00000276393 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
BRD1O95696 FPGS-201ENST00000373225 2278 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
BRD1O95696 PLEKHB1-203ENST00000398492 2275 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
BRD1O95696 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
BRD1O95696 SPART-209ENST00000494062 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
BRD1O95696 C12orf65-202ENST00000366329 1901 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
BRD1O95696 PRRT2-212ENST00000636619 2065 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
BRD1O95696 LRRC43-201ENST00000339777 2028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
BRD1O95696 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
BRD1O95696 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
BRD1O95696 MMP9-201ENST00000372330 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
BRD1O95696 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
BRD1O95696 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
BRD1O95696 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
BRD1O95696 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
BRD1O95696 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
BRD1O95696 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
BRD1O95696 CCDC157-201ENST00000338306 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
BRD1O95696 KHNYN-206ENST00000556842 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
BRD1O95696 HERPUD2-202ENST00000396081 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
BRD1O95696 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
BRD1O95696 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
BRD1O95696 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
BRD1O95696 HNRNPUL1-203ENST00000378215 2864 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
BRD1O95696 CD276-201ENST00000318424 2738 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
BRD1O95696 WIPF1-206ENST00000409891 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
BRD1O95696 PTTG1IP-203ENST00000397887 2413 ntTSL 4 BASIC22.09■■□□□ 1.13
BRD1O95696 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
BRD1O95696 ACAP3-202ENST00000354700 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
BRD1O95696 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
BRD1O95696 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
BRD1O95696 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
BRD1O95696 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
BRD1O95696 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
BRD1O95696 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
BRD1O95696 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
BRD1O95696 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
BRD1O95696 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
BRD1O95696 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
BRD1O95696 TDP2-202ENST00000378198 2071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
BRD1O95696 ADAM33-203ENST00000379861 3674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
BRD1O95696 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
BRD1O95696 ZCWPW1-201ENST00000360951 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
BRD1O95696 SOCS3-201ENST00000330871 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
BRD1O95696 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
BRD1O95696 C5orf30-203ENST00000515669 1573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
BRD1O95696 AC127496.1-202ENST00000573602 2091 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
BRD1O95696 ARPC4-201ENST00000397261 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
BRD1O95696 CADPS-201ENST00000283269 4591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
BRD1O95696 MINPP1-201ENST00000371994 2183 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
BRD1O95696 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
BRD1O95696 ZCCHC17-205ENST00000615916 1652 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
BRD1O95696 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
BRD1O95696 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
BRD1O95696 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
BRD1O95696 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
BRD1O95696 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
BRD1O95696 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
BRD1O95696 SLC25A48-201ENST00000274513 1880 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
BRD1O95696 PLK1-201ENST00000300093 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
BRD1O95696 BEGAIN-211ENST00000637646 2911 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
BRD1O95696 IGSF9-206ENST00000611023 2663 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
BRD1O95696 KCNC4-203ENST00000413138 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
BRD1O95696 ISLR2-210ENST00000565540 2780 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.08■■□□□ 1.12
BRD1O95696 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
BRD1O95696 LGI4-201ENST00000310123 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
BRD1O95696 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
BRD1O95696 TTC22-201ENST00000371274 2149 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
BRD1O95696 XYLT2-203ENST00000507602 2107 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
BRD1O95696 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.2 ms