Protein–RNA interactions for Protein: O94889

KLHL18, Kelch-like protein 18, humanhuman

Predictions only

Length 574 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL18O94889 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
KLHL18O94889 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
KLHL18O94889 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
KLHL18O94889 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
KLHL18O94889 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
KLHL18O94889 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
KLHL18O94889 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
KLHL18O94889 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
KLHL18O94889 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
KLHL18O94889 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
KLHL18O94889 SLC6A17-201ENST00000331565 6427 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
KLHL18O94889 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
KLHL18O94889 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
KLHL18O94889 CIDEB-202ENST00000336557 2409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
KLHL18O94889 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
KLHL18O94889 SHE-201ENST00000304760 6243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
KLHL18O94889 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
KLHL18O94889 FP475955.4-201ENST00000623131 1990 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
KLHL18O94889 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
KLHL18O94889 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
KLHL18O94889 KIAA1522-204ENST00000401073 5438 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
KLHL18O94889 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
KLHL18O94889 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
KLHL18O94889 SYNM-202ENST00000336292 7394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
KLHL18O94889 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
KLHL18O94889 RIOX2-201ENST00000333396 5347 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
KLHL18O94889 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
KLHL18O94889 Z85996.1-201ENST00000494644 937 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
KLHL18O94889 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC18.29■□□□□ 0.52
KLHL18O94889 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
KLHL18O94889 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
KLHL18O94889 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
KLHL18O94889 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC18.29■□□□□ 0.52
KLHL18O94889 AC006504.5-207ENST00000586220 487 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
KLHL18O94889 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
KLHL18O94889 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
KLHL18O94889 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
KLHL18O94889 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
KLHL18O94889 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
KLHL18O94889 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
KLHL18O94889 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
KLHL18O94889 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
KLHL18O94889 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
KLHL18O94889 LIPG-203ENST00000577628 2323 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
KLHL18O94889 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
KLHL18O94889 TLE3-226ENST00000627388 5742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
KLHL18O94889 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
KLHL18O94889 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
KLHL18O94889 P2RY6-212ENST00000618468 2431 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
KLHL18O94889 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
KLHL18O94889 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
KLHL18O94889 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
KLHL18O94889 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
KLHL18O94889 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
KLHL18O94889 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
KLHL18O94889 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
KLHL18O94889 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
KLHL18O94889 LINC01122-201ENST00000422723 675 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
KLHL18O94889 FAM210CP-201ENST00000445714 574 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
KLHL18O94889 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC18.28■□□□□ 0.52
KLHL18O94889 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
KLHL18O94889 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
KLHL18O94889 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
KLHL18O94889 MCUR1-201ENST00000379170 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
KLHL18O94889 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
KLHL18O94889 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
KLHL18O94889 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
KLHL18O94889 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
KLHL18O94889 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
KLHL18O94889 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
KLHL18O94889 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
KLHL18O94889 SORCS3-202ENST00000369701 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
KLHL18O94889 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
KLHL18O94889 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
KLHL18O94889 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
KLHL18O94889 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
KLHL18O94889 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
KLHL18O94889 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
KLHL18O94889 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
KLHL18O94889 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC18.27■□□□□ 0.52
KLHL18O94889 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
KLHL18O94889 REXO1L10P-201ENST00000615707 1290 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
KLHL18O94889 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
KLHL18O94889 ACTR3B-203ENST00000397282 1692 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
KLHL18O94889 PGAP3-206ENST00000579146 2220 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
KLHL18O94889 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
KLHL18O94889 PTH2R-204ENST00000617735 2472 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
KLHL18O94889 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
KLHL18O94889 FZD1-201ENST00000287934 6963 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.51
KLHL18O94889 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
KLHL18O94889 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
KLHL18O94889 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
KLHL18O94889 SNX27-203ENST00000368843 7197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
KLHL18O94889 SLC39A1-209ENST00000537590 2022 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
KLHL18O94889 FSCN1P1-201ENST00000568912 1481 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
KLHL18O94889 GDF5OS-201ENST00000374375 1734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
KLHL18O94889 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
KLHL18O94889 MRC2-201ENST00000303375 5988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
KLHL18O94889 GPRIN2-201ENST00000374314 1696 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
KLHL18O94889 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.2 ms