Protein–RNA interactions for Protein: O94817

ATG12, Ubiquitin-like protein ATG12, humanhuman

Predictions only

Length 140 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG12O94817 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ATG12O94817 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ATG12O94817 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
ATG12O94817 OLFM1-201ENST00000252854 2591 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ATG12O94817 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ATG12O94817 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ATG12O94817 IGF2-205ENST00000416167 5585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ATG12O94817 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ATG12O94817 JRK-211ENST00000615982 2823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ATG12O94817 TMEM8B-204ENST00000439587 2150 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ATG12O94817 TTLL8-201ENST00000266182 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ATG12O94817 GAL3ST4-201ENST00000360039 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ATG12O94817 NDFIP1-201ENST00000253814 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ATG12O94817 TCEA1-201ENST00000396401 2718 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ATG12O94817 DNM1-211ENST00000627061 2724 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ATG12O94817 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ATG12O94817 MXRA8-202ENST00000342753 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ATG12O94817 NFIC-211ENST00000641145 8399 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
ATG12O94817 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ATG12O94817 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ATG12O94817 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ATG12O94817 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ATG12O94817 KRT6A-201ENST00000330722 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ATG12O94817 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
ATG12O94817 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
ATG12O94817 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ATG12O94817 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
ATG12O94817 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
ATG12O94817 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ATG12O94817 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ATG12O94817 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ATG12O94817 FPGS-201ENST00000373225 2278 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ATG12O94817 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ATG12O94817 ADAM15-207ENST00000368413 1901 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ATG12O94817 EIF4G3-205ENST00000400422 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ATG12O94817 AL096870.2-201ENST00000565988 2108 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ATG12O94817 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ATG12O94817 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ATG12O94817 TJP1-212ENST00000614355 6977 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ATG12O94817 ZNF500-202ENST00000545009 2440 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ATG12O94817 TRIM50-201ENST00000333149 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ATG12O94817 KCNH1-210ENST00000640044 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ATG12O94817 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ATG12O94817 EXD3-201ENST00000340951 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ATG12O94817 MCF2L-203ENST00000375604 6445 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ATG12O94817 TOR3A-203ENST00000367627 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ATG12O94817 DAPK1-202ENST00000408954 5892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ATG12O94817 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ATG12O94817 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ATG12O94817 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ATG12O94817 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ATG12O94817 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ATG12O94817 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ATG12O94817 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ATG12O94817 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ATG12O94817 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ATG12O94817 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ATG12O94817 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ATG12O94817 PRR18-201ENST00000322583 3084 ntAPPRIS P2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ATG12O94817 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ATG12O94817 RAN-212ENST00000543796 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ATG12O94817 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ATG12O94817 MMP17-206ENST00000535291 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ATG12O94817 LINC01215-201ENST00000607746 2592 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ATG12O94817 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ATG12O94817 PFDN6-206ENST00000463584 1915 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ATG12O94817 BRMS1L-201ENST00000216807 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ATG12O94817 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ATG12O94817 SLC47A2-201ENST00000325411 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ATG12O94817 UNC13A-205ENST00000551649 6052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ATG12O94817 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ATG12O94817 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ATG12O94817 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ATG12O94817 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ATG12O94817 FBXL5-202ENST00000412094 2837 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ATG12O94817 NLGN2-201ENST00000302926 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ATG12O94817 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ATG12O94817 TADA3-201ENST00000301964 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ATG12O94817 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ATG12O94817 MAGI1-213ENST00000483466 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ATG12O94817 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ATG12O94817 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ATG12O94817 NR2F1-201ENST00000327111 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ATG12O94817 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ATG12O94817 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ATG12O94817 ASB1-201ENST00000264607 6994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ATG12O94817 REPIN1-203ENST00000444957 2969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ATG12O94817 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ATG12O94817 SCNN1D-206ENST00000400928 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ATG12O94817 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ATG12O94817 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ATG12O94817 PGM5-202ENST00000396396 3338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ATG12O94817 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ATG12O94817 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
ATG12O94817 PDS5A-201ENST00000303538 7176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ATG12O94817 NBPF11-205ENST00000615281 5494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ATG12O94817 PTGER3-201ENST00000306666 2333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ATG12O94817 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ATG12O94817 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ATG12O94817 NMRK1-203ENST00000376811 2050 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 79.6 ms