Protein–RNA interactions for Protein: O75683

SURF6, Surfeit locus protein 6, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 361 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SURF6O75683 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SURF6O75683 GOSR2-226ENST00000639287 2367 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SURF6O75683 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SURF6O75683 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SURF6O75683 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SURF6O75683 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SURF6O75683 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SURF6O75683 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SURF6O75683 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SURF6O75683 TSPY14P-201ENST00000303979 915 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
SURF6O75683 SLC25A1P2-201ENST00000430693 912 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
SURF6O75683 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SURF6O75683 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SURF6O75683 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SURF6O75683 SIGLEC15-202ENST00000546268 1054 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SURF6O75683 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SURF6O75683 AC008622.2-201ENST00000617006 1229 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
SURF6O75683 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SURF6O75683 DHRS11-210ENST00000611337 1341 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SURF6O75683 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SURF6O75683 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SURF6O75683 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SURF6O75683 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
SURF6O75683 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SURF6O75683 ZHX3-212ENST00000558993 1528 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SURF6O75683 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SURF6O75683 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SURF6O75683 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SURF6O75683 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SURF6O75683 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SURF6O75683 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SURF6O75683 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SURF6O75683 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SURF6O75683 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SURF6O75683 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SURF6O75683 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SURF6O75683 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SURF6O75683 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SURF6O75683 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SURF6O75683 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SURF6O75683 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
SURF6O75683 SHBG-203ENST00000416273 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SURF6O75683 ABHD11-207ENST00000458339 890 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SURF6O75683 EGLN1P1-201ENST00000531623 762 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
SURF6O75683 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SURF6O75683 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SURF6O75683 SHBG-215ENST00000575903 1196 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SURF6O75683 PHOSPHO2-206ENST00000616481 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SURF6O75683 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SURF6O75683 LINC01568-207ENST00000641790 1380 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
SURF6O75683 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SURF6O75683 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SURF6O75683 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SURF6O75683 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SURF6O75683 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
SURF6O75683 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
SURF6O75683 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
SURF6O75683 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.35
SURF6O75683 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
SURF6O75683 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.35
SURF6O75683 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
SURF6O75683 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.35
SURF6O75683 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.35
SURF6O75683 AP5S1-203ENST00000379573 1848 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SURF6O75683 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SURF6O75683 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SURF6O75683 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SURF6O75683 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SURF6O75683 CRAT-202ENST00000393384 973 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SURF6O75683 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SURF6O75683 UNC5B-AS1-201ENST00000447119 647 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SURF6O75683 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SURF6O75683 PRR29-205ENST00000579184 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SURF6O75683 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SURF6O75683 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SURF6O75683 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SURF6O75683 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SURF6O75683 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SURF6O75683 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
SURF6O75683 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SURF6O75683 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SURF6O75683 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SURF6O75683 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SURF6O75683 BUB3-202ENST00000368859 667 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SURF6O75683 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SURF6O75683 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SURF6O75683 DHRS4L2-202ENST00000397071 1117 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SURF6O75683 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SURF6O75683 AL353719.1-201ENST00000566847 864 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
SURF6O75683 AC006942.1-201ENST00000600669 520 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SURF6O75683 AC116562.4-202ENST00000641738 218 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
SURF6O75683 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SURF6O75683 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SURF6O75683 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SURF6O75683 TMPRSS5-209ENST00000544634 1524 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SURF6O75683 SLC5A10-205ENST00000417251 1984 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SURF6O75683 OGFOD2-207ENST00000536150 1956 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SURF6O75683 KATNBL1P6-202ENST00000562413 1466 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
SURF6O75683 AC092338.2-201ENST00000568827 1415 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
SURF6O75683 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.9 ms