Protein–RNA interactions for Protein: O75154

RAB11FIP3, Rab11 family-interacting protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 756 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB11FIP3O75154 P2RX5-203ENST00000547178 1998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
RAB11FIP3O75154 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
RAB11FIP3O75154 TBC1D3P2-202ENST00000577902 1649 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
RAB11FIP3O75154 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
RAB11FIP3O75154 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
RAB11FIP3O75154 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
RAB11FIP3O75154 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
RAB11FIP3O75154 AL365259.1-203ENST00000451660 707 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
RAB11FIP3O75154 AL139246.2-201ENST00000456687 1297 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
RAB11FIP3O75154 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
RAB11FIP3O75154 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
RAB11FIP3O75154 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
RAB11FIP3O75154 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
RAB11FIP3O75154 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
RAB11FIP3O75154 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
RAB11FIP3O75154 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
RAB11FIP3O75154 IDH3G-202ENST00000370092 1712 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
RAB11FIP3O75154 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
RAB11FIP3O75154 TINAGL1-202ENST00000457433 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
RAB11FIP3O75154 NFATC4-220ENST00000555393 2235 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
RAB11FIP3O75154 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
RAB11FIP3O75154 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
RAB11FIP3O75154 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
RAB11FIP3O75154 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
RAB11FIP3O75154 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
RAB11FIP3O75154 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
RAB11FIP3O75154 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
RAB11FIP3O75154 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
RAB11FIP3O75154 AC008622.2-201ENST00000617006 1229 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
RAB11FIP3O75154 AC068587.9-201ENST00000641814 219 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
RAB11FIP3O75154 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
RAB11FIP3O75154 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
RAB11FIP3O75154 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
RAB11FIP3O75154 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
RAB11FIP3O75154 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
RAB11FIP3O75154 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
RAB11FIP3O75154 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
RAB11FIP3O75154 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
RAB11FIP3O75154 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
RAB11FIP3O75154 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
RAB11FIP3O75154 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC23.32■■□□□ 1.32
RAB11FIP3O75154 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
RAB11FIP3O75154 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
RAB11FIP3O75154 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
RAB11FIP3O75154 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
RAB11FIP3O75154 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
RAB11FIP3O75154 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
RAB11FIP3O75154 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
RAB11FIP3O75154 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
RAB11FIP3O75154 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
RAB11FIP3O75154 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
RAB11FIP3O75154 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
RAB11FIP3O75154 CROCCP3-202ENST00000420820 1947 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
RAB11FIP3O75154 ZAR1L-202ENST00000533490 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
RAB11FIP3O75154 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
RAB11FIP3O75154 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
RAB11FIP3O75154 TSPY14P-201ENST00000303979 915 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
RAB11FIP3O75154 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
RAB11FIP3O75154 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
RAB11FIP3O75154 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
RAB11FIP3O75154 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
RAB11FIP3O75154 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
RAB11FIP3O75154 C2orf69P3-201ENST00000565542 1120 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
RAB11FIP3O75154 AL353719.1-201ENST00000566847 864 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
RAB11FIP3O75154 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC23.31■■□□□ 1.32
RAB11FIP3O75154 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
RAB11FIP3O75154 MEPCE-202ENST00000414441 2261 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
RAB11FIP3O75154 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
RAB11FIP3O75154 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
RAB11FIP3O75154 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
RAB11FIP3O75154 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
RAB11FIP3O75154 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
RAB11FIP3O75154 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
RAB11FIP3O75154 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
RAB11FIP3O75154 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
RAB11FIP3O75154 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
RAB11FIP3O75154 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
RAB11FIP3O75154 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
RAB11FIP3O75154 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
RAB11FIP3O75154 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
RAB11FIP3O75154 GPR83-202ENST00000539203 1909 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
RAB11FIP3O75154 INSR-201ENST00000302850 4721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
RAB11FIP3O75154 HEIH-201ENST00000623091 1652 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
RAB11FIP3O75154 BUB3-202ENST00000368859 667 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
RAB11FIP3O75154 TSPY17P-201ENST00000450329 467 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
RAB11FIP3O75154 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
RAB11FIP3O75154 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
RAB11FIP3O75154 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
RAB11FIP3O75154 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
RAB11FIP3O75154 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
RAB11FIP3O75154 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
RAB11FIP3O75154 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
RAB11FIP3O75154 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
RAB11FIP3O75154 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
RAB11FIP3O75154 CYP2D8P-201ENST00000433633 1490 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
RAB11FIP3O75154 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
RAB11FIP3O75154 HAUS4-218ENST00000555986 1626 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
RAB11FIP3O75154 DNAJC8-201ENST00000263697 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
RAB11FIP3O75154 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
RAB11FIP3O75154 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37 ms