Protein–RNA interactions for Protein: O75054

IGSF3, Immunoglobulin superfamily member 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,194 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IGSF3O75054 FAHD2CP-202ENST00000443258 893 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
IGSF3O75054 AC022616.7-201ENST00000525383 220 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
IGSF3O75054 AL132780.2-201ENST00000557615 1021 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
IGSF3O75054 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
IGSF3O75054 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
IGSF3O75054 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
IGSF3O75054 TMEM91-210ENST00000542945 1610 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
IGSF3O75054 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
IGSF3O75054 VLDLR-AS1-205ENST00000599229 1346 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
IGSF3O75054 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
IGSF3O75054 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
IGSF3O75054 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
IGSF3O75054 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
IGSF3O75054 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
IGSF3O75054 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
IGSF3O75054 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
IGSF3O75054 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
IGSF3O75054 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
IGSF3O75054 FAM213B-201ENST00000378424 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
IGSF3O75054 TBC1D10C-201ENST00000312390 1497 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
IGSF3O75054 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
IGSF3O75054 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
IGSF3O75054 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
IGSF3O75054 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
IGSF3O75054 UBL5-201ENST00000358666 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
IGSF3O75054 ANKRD20A18P-201ENST00000359341 492 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
IGSF3O75054 MRPL46-202ENST00000558531 1002 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
IGSF3O75054 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
IGSF3O75054 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
IGSF3O75054 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
IGSF3O75054 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
IGSF3O75054 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
IGSF3O75054 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
IGSF3O75054 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
IGSF3O75054 KRT8P45-201ENST00000414328 1447 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
IGSF3O75054 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
IGSF3O75054 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
IGSF3O75054 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
IGSF3O75054 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
IGSF3O75054 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
IGSF3O75054 JPT1-203ENST00000409753 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
IGSF3O75054 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
IGSF3O75054 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
IGSF3O75054 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
IGSF3O75054 PYDC1-201ENST00000302964 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
IGSF3O75054 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
IGSF3O75054 AC037459.1-202ENST00000430850 531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.8■■□□□ 1.24
IGSF3O75054 CR769775.1-204ENST00000439760 747 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
IGSF3O75054 KRT18P35-201ENST00000510488 1269 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
IGSF3O75054 APBB3-216ENST00000511201 1014 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
IGSF3O75054 CCNJL-205ENST00000519673 940 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
IGSF3O75054 IFI27L2-206ENST00000556727 556 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
IGSF3O75054 FAM104A-205ENST00000581110 512 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
IGSF3O75054 C17orf62-221ENST00000581196 668 ntTSL 4 BASIC22.8■■□□□ 1.24
IGSF3O75054 MIR4674-201ENST00000582457 87 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
IGSF3O75054 AL445228.2-201ENST00000605589 952 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
IGSF3O75054 AC139887.4-201ENST00000607877 719 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
IGSF3O75054 ADORA1-208ENST00000618295 862 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
IGSF3O75054 MYC-208ENST00000641036 567 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
IGSF3O75054 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
IGSF3O75054 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
IGSF3O75054 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
IGSF3O75054 AC020922.1-201ENST00000591954 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
IGSF3O75054 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
IGSF3O75054 PHKG2-202ENST00000424889 1566 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
IGSF3O75054 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
IGSF3O75054 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
IGSF3O75054 SPAG16-209ENST00000447990 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
IGSF3O75054 ADGRD2-201ENST00000334810 3244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
IGSF3O75054 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
IGSF3O75054 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
IGSF3O75054 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
IGSF3O75054 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
IGSF3O75054 EDEM1-204ENST00000445686 1363 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
IGSF3O75054 TMPRSS5-209ENST00000544634 1524 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
IGSF3O75054 LCE3D-201ENST00000368787 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
IGSF3O75054 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
IGSF3O75054 WDR45-218ENST00000473974 1077 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
IGSF3O75054 CMTM3-210ENST00000565666 769 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
IGSF3O75054 KLK7-206ENST00000597707 1054 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
IGSF3O75054 CR769767.2-201ENST00000622735 460 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
IGSF3O75054 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
IGSF3O75054 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
IGSF3O75054 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
IGSF3O75054 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
IGSF3O75054 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
IGSF3O75054 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
IGSF3O75054 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
IGSF3O75054 HMBS-221ENST00000544387 1351 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
IGSF3O75054 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
IGSF3O75054 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
IGSF3O75054 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
IGSF3O75054 AZU1-201ENST00000233997 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
IGSF3O75054 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
IGSF3O75054 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
IGSF3O75054 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
IGSF3O75054 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
IGSF3O75054 SAPCD2P2-201ENST00000431719 1174 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
IGSF3O75054 NT5C-211ENST00000582170 653 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
IGSF3O75054 SMIM8-209ENST00000608868 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19 ms