Protein–RNA interactions for Protein: O60238

BNIP3L, BCL2/adenovirus E1B 19 kDa protein-interacting protein 3-like, humanhuman

Predictions only

Length 219 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BNIP3LO60238 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
BNIP3LO60238 ARHGEF28-203ENST00000426542 6118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
BNIP3LO60238 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
BNIP3LO60238 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
BNIP3LO60238 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
BNIP3LO60238 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
BNIP3LO60238 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
BNIP3LO60238 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
BNIP3LO60238 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
BNIP3LO60238 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
BNIP3LO60238 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
BNIP3LO60238 TMEM53-201ENST00000372235 890 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
BNIP3LO60238 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
BNIP3LO60238 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
BNIP3LO60238 MCF2L-207ENST00000397024 490 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
BNIP3LO60238 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
BNIP3LO60238 FAHD2CP-202ENST00000443258 893 ntTSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
BNIP3LO60238 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
BNIP3LO60238 SLC22A23-203ENST00000406686 5658 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
BNIP3LO60238 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
BNIP3LO60238 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
BNIP3LO60238 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC19.32■□□□□ 0.68
BNIP3LO60238 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
BNIP3LO60238 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
BNIP3LO60238 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
BNIP3LO60238 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
BNIP3LO60238 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
BNIP3LO60238 AC007040.2-201ENST00000606025 4170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
BNIP3LO60238 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC19.31■□□□□ 0.68
BNIP3LO60238 SHANK3-203ENST00000445220 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
BNIP3LO60238 N4BP3-201ENST00000274605 6080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
BNIP3LO60238 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
BNIP3LO60238 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
BNIP3LO60238 GOLGA6L5P-202ENST00000515341 1828 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
BNIP3LO60238 TSPY17P-201ENST00000450329 467 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
BNIP3LO60238 AC002467.1-201ENST00000457510 657 ntTSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
BNIP3LO60238 CDKN3-209ENST00000556102 938 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
BNIP3LO60238 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
BNIP3LO60238 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
BNIP3LO60238 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
BNIP3LO60238 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
BNIP3LO60238 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
BNIP3LO60238 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
BNIP3LO60238 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
BNIP3LO60238 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
BNIP3LO60238 MCF2L-208ENST00000397030 6580 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
BNIP3LO60238 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
BNIP3LO60238 COL5A3-201ENST00000264828 6174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
BNIP3LO60238 FRRS1L-201ENST00000561981 8197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
BNIP3LO60238 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
BNIP3LO60238 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
BNIP3LO60238 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
BNIP3LO60238 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
BNIP3LO60238 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
BNIP3LO60238 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
BNIP3LO60238 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
BNIP3LO60238 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
BNIP3LO60238 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
BNIP3LO60238 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
BNIP3LO60238 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
BNIP3LO60238 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
BNIP3LO60238 POMZP3-201ENST00000275569 1259 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
BNIP3LO60238 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
BNIP3LO60238 HMGA1P5-201ENST00000412453 271 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
BNIP3LO60238 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
BNIP3LO60238 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
BNIP3LO60238 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
BNIP3LO60238 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
BNIP3LO60238 MAGI3-201ENST00000307546 6430 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
BNIP3LO60238 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
BNIP3LO60238 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
BNIP3LO60238 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
BNIP3LO60238 BCL2-203ENST00000589955 5011 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
BNIP3LO60238 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
BNIP3LO60238 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
BNIP3LO60238 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
BNIP3LO60238 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
BNIP3LO60238 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
BNIP3LO60238 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
BNIP3LO60238 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
BNIP3LO60238 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
BNIP3LO60238 BMP8B-201ENST00000372827 4822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
BNIP3LO60238 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
BNIP3LO60238 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
BNIP3LO60238 HTR7P1-202ENST00000624664 4411 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
BNIP3LO60238 AC092338.2-201ENST00000568827 1415 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
BNIP3LO60238 AC103564.1-201ENST00000437330 562 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
BNIP3LO60238 AC134772.1-201ENST00000438872 885 ntTSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
BNIP3LO60238 AP003041.3-201ENST00000527151 707 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
BNIP3LO60238 AL049597.2-201ENST00000565575 961 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
BNIP3LO60238 AL353719.1-201ENST00000566847 864 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
BNIP3LO60238 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
BNIP3LO60238 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
BNIP3LO60238 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
BNIP3LO60238 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
BNIP3LO60238 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
BNIP3LO60238 GAREM2-201ENST00000401533 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
BNIP3LO60238 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
BNIP3LO60238 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
BNIP3LO60238 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.8 ms