Protein–RNA interactions for Protein: O43583

DENR, Density-regulated protein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 198 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DENRO43583 WDR13-201ENST00000218056 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
DENRO43583 WBP2-204ENST00000585462 1895 ntTSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
DENRO43583 THOP1-205ENST00000586677 1872 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
DENRO43583 LTBP1-203ENST00000404816 6333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
DENRO43583 VSIG10L2-202ENST00000638636 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
DENRO43583 BLCAP-201ENST00000373537 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
DENRO43583 SNAI3-AS1-205ENST00000568633 2096 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
DENRO43583 DDX51-202ENST00000397333 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
DENRO43583 ARFGAP1-201ENST00000353546 2776 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
DENRO43583 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
DENRO43583 ZBTB47-202ENST00000505904 2456 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
DENRO43583 SNAPC3-207ENST00000610884 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
DENRO43583 AC011676.5-201ENST00000624864 2660 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
DENRO43583 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
DENRO43583 UBE3C-201ENST00000348165 5229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
DENRO43583 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
DENRO43583 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
DENRO43583 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
DENRO43583 DHRS2-201ENST00000250383 1705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
DENRO43583 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
DENRO43583 SH3BP5-206ENST00000426925 2190 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
DENRO43583 A4GALT-202ENST00000381278 1935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
DENRO43583 CPZ-201ENST00000315782 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
DENRO43583 RASA4-202ENST00000449970 2787 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
DENRO43583 KIAA1522-204ENST00000401073 5438 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
DENRO43583 QSOX2-201ENST00000358701 4530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
DENRO43583 ANKRD6-204ENST00000447838 2968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
DENRO43583 AC022211.2-201ENST00000585075 2527 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
DENRO43583 FGFR4-203ENST00000393648 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
DENRO43583 USB1-201ENST00000219281 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
DENRO43583 WT1-201ENST00000332351 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
DENRO43583 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
DENRO43583 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
DENRO43583 PODNL1-202ENST00000339560 2165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
DENRO43583 REPIN1-203ENST00000444957 2969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
DENRO43583 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
DENRO43583 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
DENRO43583 AMN1-201ENST00000281471 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
DENRO43583 ZNF454-201ENST00000320129 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
DENRO43583 PHF20L1-201ENST00000220847 3297 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
DENRO43583 TNIP1-208ENST00000520931 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
DENRO43583 AC018695.7-201ENST00000624587 2492 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
DENRO43583 SHC3-202ENST00000375835 9768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
DENRO43583 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
DENRO43583 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
DENRO43583 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
DENRO43583 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.53■□□□□ 0.4
DENRO43583 SUZ12-204ENST00000580398 3977 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
DENRO43583 C8orf34-206ENST00000518698 2223 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
DENRO43583 EHMT1-203ENST00000460843 5137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
DENRO43583 MYB-205ENST00000367814 3302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
DENRO43583 PTPRA-205ENST00000399903 3337 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
DENRO43583 NDFIP1-201ENST00000253814 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
DENRO43583 ST8SIA5-201ENST00000315087 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
DENRO43583 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
DENRO43583 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
DENRO43583 CFLAR-208ENST00000423241 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
DENRO43583 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
DENRO43583 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
DENRO43583 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC17.52■□□□□ 0.4
DENRO43583 HDAC10-222ENST00000626012 2607 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
DENRO43583 TBXAS1-210ENST00000458722 2057 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
DENRO43583 RREB1-203ENST00000379933 5826 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
DENRO43583 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC17.52■□□□□ 0.4
DENRO43583 SCYL1-202ENST00000279270 1659 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
DENRO43583 PRODH-205ENST00000420436 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
DENRO43583 DIDO1-203ENST00000370366 2383 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
DENRO43583 ZNF281-203ENST00000367353 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
DENRO43583 MFSD2A-201ENST00000372809 2173 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
DENRO43583 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
DENRO43583 SPAG9-202ENST00000357122 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
DENRO43583 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
DENRO43583 HTATSF1-204ENST00000535601 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
DENRO43583 SCAMP4-201ENST00000316097 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
DENRO43583 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
DENRO43583 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
DENRO43583 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
DENRO43583 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
DENRO43583 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
DENRO43583 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC17.52■□□□□ 0.4
DENRO43583 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
DENRO43583 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
DENRO43583 FAM120AOS-201ENST00000375412 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
DENRO43583 ADCK5-201ENST00000308860 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
DENRO43583 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
DENRO43583 ZAP70-201ENST00000264972 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
DENRO43583 CDH22-203ENST00000537909 3902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
DENRO43583 KRT79-201ENST00000330553 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
DENRO43583 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC17.52■□□□□ 0.39
DENRO43583 TLNRD1-201ENST00000267984 4845 ntAPPRIS P1 BASIC17.52■□□□□ 0.39
DENRO43583 AC093677.2-201ENST00000600169 1863 ntBASIC17.52■□□□□ 0.39
DENRO43583 PYCR3-201ENST00000220966 2678 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
DENRO43583 SLC8B1-210ENST00000550047 2493 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.39
DENRO43583 LITAF-209ENST00000571688 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
DENRO43583 SDHA-213ENST00000510361 2148 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
DENRO43583 DCAF12L2-201ENST00000360028 2599 ntAPPRIS P1 BASIC17.51■□□□□ 0.39
DENRO43583 NARF-204ENST00000390006 1766 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
DENRO43583 MTERF2-202ENST00000392830 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
DENRO43583 POLR3D-201ENST00000306433 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
DENRO43583 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.2 ms