Protein–RNA interactions for Protein: O43490

PROM1, Prominin-1, humanhuman

Predictions only

Length 865 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PROM1O43490 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
PROM1O43490 AMIGO1-202ENST00000369864 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
PROM1O43490 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
PROM1O43490 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
PROM1O43490 IRS2-201ENST00000375856 8138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
PROM1O43490 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
PROM1O43490 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
PROM1O43490 SLMAP-201ENST00000295951 5433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
PROM1O43490 IL1R1-205ENST00000410023 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
PROM1O43490 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
PROM1O43490 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
PROM1O43490 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
PROM1O43490 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
PROM1O43490 CHST2-201ENST00000309575 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PROM1O43490 AC026471.1-201ENST00000564629 3026 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
PROM1O43490 MCTP1-218ENST00000515393 5396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PROM1O43490 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PROM1O43490 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PROM1O43490 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PROM1O43490 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PROM1O43490 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PROM1O43490 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PROM1O43490 SLC25A39-202ENST00000377095 1565 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PROM1O43490 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PROM1O43490 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PROM1O43490 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PROM1O43490 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PROM1O43490 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PROM1O43490 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PROM1O43490 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PROM1O43490 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PROM1O43490 PRSS44-201ENST00000515154 1146 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
PROM1O43490 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PROM1O43490 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PROM1O43490 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PROM1O43490 KANK3-205ENST00000610351 1191 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PROM1O43490 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PROM1O43490 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PROM1O43490 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PROM1O43490 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PROM1O43490 PARP15-202ENST00000464300 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PROM1O43490 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PROM1O43490 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PROM1O43490 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PROM1O43490 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PROM1O43490 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PROM1O43490 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PROM1O43490 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PROM1O43490 SMN1-209ENST00000514951 1308 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
PROM1O43490 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PROM1O43490 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
PROM1O43490 NFATC1-217ENST00000591814 4819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PROM1O43490 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PROM1O43490 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PROM1O43490 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PROM1O43490 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PROM1O43490 TLCD1-202ENST00000394933 784 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
PROM1O43490 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
PROM1O43490 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC18■□□□□ 0.47
PROM1O43490 AL359747.1-201ENST00000442370 536 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
PROM1O43490 FAM207BP-201ENST00000447172 505 ntBASIC18■□□□□ 0.47
PROM1O43490 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PROM1O43490 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
PROM1O43490 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
PROM1O43490 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
PROM1O43490 AP000692.2-201ENST00000608391 879 ntBASIC18■□□□□ 0.47
PROM1O43490 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC18■□□□□ 0.47
PROM1O43490 AC093627.4-201ENST00000484550 5008 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
PROM1O43490 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
PROM1O43490 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PROM1O43490 PRKCI-201ENST00000295797 4950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PROM1O43490 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
PROM1O43490 MYH7B-201ENST00000262873 6293 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PROM1O43490 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
PROM1O43490 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PROM1O43490 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
PROM1O43490 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PROM1O43490 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PROM1O43490 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PROM1O43490 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PROM1O43490 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PROM1O43490 NOP14-AS1-202ENST00000505731 1999 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PROM1O43490 FOXD2-201ENST00000334793 4675 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PROM1O43490 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PROM1O43490 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PROM1O43490 KANSL1-202ENST00000432791 5343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PROM1O43490 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PROM1O43490 HLA-DRB1-201ENST00000360004 1229 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PROM1O43490 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PROM1O43490 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PROM1O43490 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PROM1O43490 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PROM1O43490 PAX1-205ENST00000613128 5352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PROM1O43490 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PROM1O43490 SMARCC1-201ENST00000254480 6375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PROM1O43490 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PROM1O43490 MAFG-201ENST00000357736 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PROM1O43490 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PROM1O43490 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PROM1O43490 PKD2-201ENST00000237596 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.1 ms