Protein–RNA interactions for Protein: O00193

SMAP, Small acidic protein, humanhuman

Predictions only

Length 183 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMAPO00193 SPSB4-201ENST00000310546 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
SMAPO00193 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
SMAPO00193 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
SMAPO00193 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
SMAPO00193 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
SMAPO00193 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
SMAPO00193 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
SMAPO00193 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
SMAPO00193 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
SMAPO00193 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
SMAPO00193 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
SMAPO00193 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
SMAPO00193 TMEM206-201ENST00000261455 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
SMAPO00193 PLIN5-201ENST00000381848 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
SMAPO00193 HGNC:18790-203ENST00000433139 2254 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
SMAPO00193 KRT86-202ENST00000423955 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
SMAPO00193 AC138028.1-201ENST00000333666 2137 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
SMAPO00193 SLC9A6-201ENST00000370695 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
SMAPO00193 GXYLT1-202ENST00000398675 7497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
SMAPO00193 STRN3-202ENST00000357479 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
SMAPO00193 NOP14-204ENST00000502735 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
SMAPO00193 IQSEC1-201ENST00000273221 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
SMAPO00193 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.36■□□□□ 0.69
SMAPO00193 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
SMAPO00193 ZHX3-212ENST00000558993 1528 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
SMAPO00193 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
SMAPO00193 AC011416.4-201ENST00000639283 2195 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
SMAPO00193 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
SMAPO00193 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
SMAPO00193 AL031658.1-201ENST00000449519 2013 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
SMAPO00193 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
SMAPO00193 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
SMAPO00193 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
SMAPO00193 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
SMAPO00193 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
SMAPO00193 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC19.36■□□□□ 0.69
SMAPO00193 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
SMAPO00193 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
SMAPO00193 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC19.36■□□□□ 0.69
SMAPO00193 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
SMAPO00193 GLRB-205ENST00000512619 728 ntTSL 3 BASIC19.36■□□□□ 0.69
SMAPO00193 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC19.36■□□□□ 0.69
SMAPO00193 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC19.36■□□□□ 0.69
SMAPO00193 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC19.36■□□□□ 0.69
SMAPO00193 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
SMAPO00193 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
SMAPO00193 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
SMAPO00193 PACSIN2-203ENST00000402229 1883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
SMAPO00193 ZNF419-207ENST00000442920 1857 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
SMAPO00193 KCNC4-203ENST00000413138 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
SMAPO00193 MCOLN2-201ENST00000284027 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
SMAPO00193 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
SMAPO00193 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
SMAPO00193 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
SMAPO00193 IL17RC-215ENST00000455057 2244 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
SMAPO00193 PDE8A-202ENST00000339708 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
SMAPO00193 SENP6-202ENST00000370010 4644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
SMAPO00193 ETS1-208ENST00000535549 4594 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
SMAPO00193 CTSD-212ENST00000637815 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
SMAPO00193 AR-207ENST00000612010 3896 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
SMAPO00193 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
SMAPO00193 PAQR4-202ENST00000318782 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
SMAPO00193 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
SMAPO00193 MAPK8IP3-202ENST00000356010 4456 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
SMAPO00193 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
SMAPO00193 ZNF446-203ENST00000594369 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
SMAPO00193 DOC2A-208ENST00000564944 1782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
SMAPO00193 QKI-203ENST00000361752 9463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
SMAPO00193 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC19.35■□□□□ 0.69
SMAPO00193 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
SMAPO00193 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
SMAPO00193 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
SMAPO00193 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
SMAPO00193 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC19.35■□□□□ 0.69
SMAPO00193 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
SMAPO00193 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
SMAPO00193 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
SMAPO00193 GORASP1-206ENST00000422110 2523 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
SMAPO00193 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
SMAPO00193 DIO1-217ENST00000617230 1656 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
SMAPO00193 ANKRD10-201ENST00000267339 2495 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
SMAPO00193 PKP3-201ENST00000331563 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
SMAPO00193 AC018755.2-202ENST00000429354 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
SMAPO00193 KCNQ5-203ENST00000355635 6623 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
SMAPO00193 LGI3-201ENST00000306317 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
SMAPO00193 BANP-202ENST00000355022 2164 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
SMAPO00193 UBE3C-201ENST00000348165 5229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
SMAPO00193 LUC7L2-210ENST00000619796 2783 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
SMAPO00193 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
SMAPO00193 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
SMAPO00193 PTPRJ-207ENST00000613246 7851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
SMAPO00193 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
SMAPO00193 FBXL3-201ENST00000355619 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
SMAPO00193 EMX2-203ENST00000553456 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
SMAPO00193 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
SMAPO00193 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
SMAPO00193 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
SMAPO00193 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
SMAPO00193 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC19.34■□□□□ 0.69
SMAPO00193 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.9 ms