Protein–RNA interactions for Protein: H3BVE0

BOLA2-SMG1P6, BOLA2-SMG1P6 readthrough (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 249 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC16.6■□□□□ 0.25
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 TTC8-202ENST00000345383 2329 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 STK17A-201ENST00000319357 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 DNAAF1-201ENST00000378553 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 CHRNA4-207ENST00000615287 5643 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 GHR-201ENST00000230882 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 DAG1-220ENST00000539901 5665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 EPB41L4A-AS1-201ENST00000413221 2969 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 AC011944.1-201ENST00000316148 1900 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 MAN1C1-201ENST00000263979 2627 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 FXN-201ENST00000377270 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 AC009163.2-201ENST00000460606 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 PABPC4-203ENST00000372858 2753 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 PPIF-201ENST00000225174 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 AFTPH-201ENST00000238855 4113 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 DSCR9-201ENST00000454482 1644 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 CTNNBIP1-203ENST00000377263 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 SLC6A17-201ENST00000331565 6427 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 UBE3A-201ENST00000232165 5051 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 MAP7-209ENST00000618822 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 TAOK2-202ENST00000308893 5169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 DOC2A-208ENST00000564944 1782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 STX6-201ENST00000258301 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 LBX2-AS1-201ENST00000548978 1852 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 MLXIP-201ENST00000319080 8427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 NDUFS2-202ENST00000392179 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 KDSR-202ENST00000406396 5447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 BECN1-201ENST00000361523 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 FAM13C-204ENST00000468840 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 TBC1D30-203ENST00000539867 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 KBTBD11-201ENST00000320248 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 KLF10-202ENST00000395884 3659 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 ZYG11A-202ENST00000371532 3942 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 TRAPPC8-210ENST00000582513 3205 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 TMUB2-204ENST00000538716 1953 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 AP5B1-201ENST00000532090 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 SDHA-204ENST00000504309 2067 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 KCNJ8-201ENST00000240662 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 WDR81-206ENST00000446363 2968 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 IRX6-201ENST00000290552 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 AGAP2-201ENST00000257897 5388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 WAC-205ENST00000375664 5924 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 PDLIM7-203ENST00000359895 1567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 PDE9A-209ENST00000398227 1606 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 MYO1B-202ENST00000339514 5026 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 MCOLN2-201ENST00000284027 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 IDH3G-202ENST00000370092 1712 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 SERINC2-205ENST00000536384 2062 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 ALDH3B1-208ENST00000617288 2078 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 SLC29A1-206ENST00000371755 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 CDKN2B-AS1-208ENST00000580576 2175 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 TCF25-201ENST00000263346 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 RBM6-210ENST00000442092 2260 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 ADAM22-202ENST00000398201 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 ZBTB7C-201ENST00000535628 4818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 YAP1-209ENST00000537274 5350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 ITGB4-201ENST00000200181 5919 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 GP5-201ENST00000401815 3534 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 PBX1-219ENST00000560641 3225 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 PLEKHG6-203ENST00000396988 2963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 IMPA1-201ENST00000256108 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 SLC2A6-201ENST00000371897 2301 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 PSRC1-201ENST00000369903 1710 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 PSRC1-206ENST00000409267 1730 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.3 ms