Protein–RNA interactions for Protein: E9PMD0

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 336 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E9PMD0 AC120498.9-201ENST00000339021 3867 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
E9PMD0 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
E9PMD0 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
E9PMD0 CACYBP-202ENST00000405362 1059 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
E9PMD0 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
E9PMD0 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC21.16■□□□□ 0.98
E9PMD0 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
E9PMD0 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
E9PMD0 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
E9PMD0 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
E9PMD0 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
E9PMD0 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
E9PMD0 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
E9PMD0 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
E9PMD0 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
E9PMD0 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
E9PMD0 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
E9PMD0 TBC1D3P2-202ENST00000577902 1649 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
E9PMD0 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
E9PMD0 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
E9PMD0 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
E9PMD0 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
E9PMD0 CYP2D8P-201ENST00000433633 1490 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
E9PMD0 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
E9PMD0 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
E9PMD0 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
E9PMD0 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
E9PMD0 MOXD1-203ENST00000392401 2191 ntTSL 4 BASIC21.15■□□□□ 0.98
E9PMD0 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
E9PMD0 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
E9PMD0 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
E9PMD0 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
E9PMD0 AP5S1-203ENST00000379573 1848 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
E9PMD0 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
E9PMD0 GRK6-201ENST00000355472 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
E9PMD0 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
E9PMD0 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
E9PMD0 ZHX3-212ENST00000558993 1528 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
E9PMD0 EGFL7-203ENST00000371699 2125 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.98
E9PMD0 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
E9PMD0 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
E9PMD0 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
E9PMD0 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
E9PMD0 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
E9PMD0 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
E9PMD0 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
E9PMD0 TMEM185A-204ENST00000507237 903 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
E9PMD0 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
E9PMD0 DNAJC8-201ENST00000263697 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
E9PMD0 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
E9PMD0 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
E9PMD0 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
E9PMD0 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
E9PMD0 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
E9PMD0 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
E9PMD0 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
E9PMD0 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
E9PMD0 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
E9PMD0 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
E9PMD0 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
E9PMD0 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
E9PMD0 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
E9PMD0 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
E9PMD0 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
E9PMD0 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
E9PMD0 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
E9PMD0 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
E9PMD0 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
E9PMD0 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
E9PMD0 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.13■□□□□ 0.97
E9PMD0 AC008622.2-201ENST00000617006 1229 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
E9PMD0 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC21.13■□□□□ 0.97
E9PMD0 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
E9PMD0 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
E9PMD0 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
E9PMD0 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
E9PMD0 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
E9PMD0 FMR1-207ENST00000439526 3699 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
E9PMD0 NFATC4-220ENST00000555393 2235 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
E9PMD0 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
E9PMD0 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
E9PMD0 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
E9PMD0 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
E9PMD0 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC21.13■□□□□ 0.97
E9PMD0 PLEKHA2-206ENST00000521746 2127 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
E9PMD0 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
E9PMD0 GGT2-201ENST00000401924 2366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
E9PMD0 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
E9PMD0 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
E9PMD0 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
E9PMD0 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
E9PMD0 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
E9PMD0 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
E9PMD0 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
E9PMD0 SENP6-201ENST00000327284 2700 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
E9PMD0 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
E9PMD0 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
E9PMD0 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
E9PMD0 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
E9PMD0 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.1 ms