Protein–RNA interactions for Protein: C9JLJ4

USP17L13, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 17-like protein 13, humanhuman

Predictions only

Length 530 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP17L13C9JLJ4 CHRNB1-207ENST00000575379 1095 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
USP17L13C9JLJ4 LINC01785-201ENST00000598042 1112 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
USP17L13C9JLJ4 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
USP17L13C9JLJ4 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
USP17L13C9JLJ4 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
USP17L13C9JLJ4 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
USP17L13C9JLJ4 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
USP17L13C9JLJ4 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
USP17L13C9JLJ4 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
USP17L13C9JLJ4 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
USP17L13C9JLJ4 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
USP17L13C9JLJ4 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
USP17L13C9JLJ4 MMAB-204ENST00000537236 1342 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
USP17L13C9JLJ4 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
USP17L13C9JLJ4 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
USP17L13C9JLJ4 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
USP17L13C9JLJ4 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.11
USP17L13C9JLJ4 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
USP17L13C9JLJ4 AC026412.3-201ENST00000605200 1661 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
USP17L13C9JLJ4 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
USP17L13C9JLJ4 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
USP17L13C9JLJ4 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
USP17L13C9JLJ4 KCNMB3-202ENST00000349697 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
USP17L13C9JLJ4 IPPK-202ENST00000375522 882 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
USP17L13C9JLJ4 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
USP17L13C9JLJ4 PLPP5-202ENST00000422581 853 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
USP17L13C9JLJ4 AL596442.1-201ENST00000429305 429 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
USP17L13C9JLJ4 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
USP17L13C9JLJ4 AC106771.1-201ENST00000502209 372 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
USP17L13C9JLJ4 AC022424.1-201ENST00000512155 889 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
USP17L13C9JLJ4 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
USP17L13C9JLJ4 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
USP17L13C9JLJ4 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
USP17L13C9JLJ4 DNASE1L2-201ENST00000320700 1326 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
USP17L13C9JLJ4 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
USP17L13C9JLJ4 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
USP17L13C9JLJ4 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
USP17L13C9JLJ4 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
USP17L13C9JLJ4 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
USP17L13C9JLJ4 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
USP17L13C9JLJ4 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
USP17L13C9JLJ4 ICA1-208ENST00000407906 1615 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
USP17L13C9JLJ4 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
USP17L13C9JLJ4 KRTAP5-11-201ENST00000398530 1021 ntAPPRIS P2 BASIC22■■□□□ 1.11
USP17L13C9JLJ4 DUSP5P1-201ENST00000441325 1139 ntBASIC22■■□□□ 1.11
USP17L13C9JLJ4 AL162457.2-201ENST00000447909 937 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
USP17L13C9JLJ4 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
USP17L13C9JLJ4 AP1S2-206ENST00000545766 576 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
USP17L13C9JLJ4 Metazoa_SRP.33-201ENST00000613468 285 ntBASIC22■■□□□ 1.11
USP17L13C9JLJ4 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
USP17L13C9JLJ4 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
USP17L13C9JLJ4 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
USP17L13C9JLJ4 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
USP17L13C9JLJ4 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
USP17L13C9JLJ4 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
USP17L13C9JLJ4 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
USP17L13C9JLJ4 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
USP17L13C9JLJ4 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
USP17L13C9JLJ4 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
USP17L13C9JLJ4 METTL5-207ENST00000410097 1370 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
USP17L13C9JLJ4 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
USP17L13C9JLJ4 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
USP17L13C9JLJ4 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
USP17L13C9JLJ4 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
USP17L13C9JLJ4 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
USP17L13C9JLJ4 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
USP17L13C9JLJ4 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
USP17L13C9JLJ4 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
USP17L13C9JLJ4 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
USP17L13C9JLJ4 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
USP17L13C9JLJ4 TLCD1-201ENST00000292090 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
USP17L13C9JLJ4 SWI5-201ENST00000320188 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
USP17L13C9JLJ4 IFT27-201ENST00000340630 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
USP17L13C9JLJ4 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
USP17L13C9JLJ4 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
USP17L13C9JLJ4 LINC00421-201ENST00000413833 1054 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
USP17L13C9JLJ4 TRIM73-203ENST00000437796 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
USP17L13C9JLJ4 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
USP17L13C9JLJ4 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
USP17L13C9JLJ4 RAP1B-228ENST00000542145 1060 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
USP17L13C9JLJ4 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
USP17L13C9JLJ4 AC016582.2-201ENST00000591908 446 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
USP17L13C9JLJ4 AC004076.1-201ENST00000596831 664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
USP17L13C9JLJ4 TBC1D9B-220ENST00000630103 303 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
USP17L13C9JLJ4 SETD3-209ENST00000630307 1281 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
USP17L13C9JLJ4 SPACA6-213ENST00000637797 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
USP17L13C9JLJ4 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
USP17L13C9JLJ4 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
USP17L13C9JLJ4 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
USP17L13C9JLJ4 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
USP17L13C9JLJ4 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
USP17L13C9JLJ4 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
USP17L13C9JLJ4 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
USP17L13C9JLJ4 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
USP17L13C9JLJ4 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
USP17L13C9JLJ4 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
USP17L13C9JLJ4 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
USP17L13C9JLJ4 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
USP17L13C9JLJ4 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
USP17L13C9JLJ4 RAP1GDS1-201ENST00000264572 1686 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.3 ms