Protein–RNA interactions for Protein: A6NFT4

CFAP73, Cilia- and flagella-associated protein 73, humanhuman

Predictions only

Length 308 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CFAP73A6NFT4 DIABLO-206ENST00000443649 2250 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CFAP73A6NFT4 TMEM183A-201ENST00000367242 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CFAP73A6NFT4 ZBP1-202ENST00000395822 2073 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CFAP73A6NFT4 CTSB-232ENST00000534510 1989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CFAP73A6NFT4 PIGZ-202ENST00000412723 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CFAP73A6NFT4 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CFAP73A6NFT4 GJA3-201ENST00000241125 5211 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CFAP73A6NFT4 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CFAP73A6NFT4 LINC00472-203ENST00000426635 2958 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CFAP73A6NFT4 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CFAP73A6NFT4 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CFAP73A6NFT4 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CFAP73A6NFT4 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CFAP73A6NFT4 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CFAP73A6NFT4 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
CFAP73A6NFT4 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
CFAP73A6NFT4 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CFAP73A6NFT4 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CFAP73A6NFT4 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CFAP73A6NFT4 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CFAP73A6NFT4 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CFAP73A6NFT4 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CFAP73A6NFT4 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CFAP73A6NFT4 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CFAP73A6NFT4 AC012317.2-201ENST00000623305 2251 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
CFAP73A6NFT4 PRPF19-201ENST00000227524 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CFAP73A6NFT4 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CFAP73A6NFT4 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CFAP73A6NFT4 GYPC-202ENST00000356887 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CFAP73A6NFT4 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CFAP73A6NFT4 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CFAP73A6NFT4 SLC39A1-211ENST00000621013 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CFAP73A6NFT4 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CFAP73A6NFT4 SCUBE2-202ENST00000450649 2912 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CFAP73A6NFT4 IDUA-210ENST00000514224 2130 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CFAP73A6NFT4 NSFL1C-206ENST00000476071 2800 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CFAP73A6NFT4 ZNF853-201ENST00000457543 3857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CFAP73A6NFT4 TXNRD3-202ENST00000523403 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CFAP73A6NFT4 AC018755.2-202ENST00000429354 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CFAP73A6NFT4 PPRC1-201ENST00000278070 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CFAP73A6NFT4 RELL2-201ENST00000297164 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CFAP73A6NFT4 STAMBPL1-203ENST00000371926 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CFAP73A6NFT4 GLCCI1-201ENST00000223145 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CFAP73A6NFT4 HDAC10-202ENST00000349505 1950 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CFAP73A6NFT4 SIX5-203ENST00000560168 1975 ntTSL 4 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CFAP73A6NFT4 ATOH1-201ENST00000306011 2212 ntAPPRIS P1 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CFAP73A6NFT4 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
CFAP73A6NFT4 NOMO2-202ENST00000381474 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CFAP73A6NFT4 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CFAP73A6NFT4 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CFAP73A6NFT4 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
CFAP73A6NFT4 NEXN-AS1-201ENST00000421331 2292 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CFAP73A6NFT4 DDX1-207ENST00000617198 2257 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CFAP73A6NFT4 WWC1-201ENST00000265293 7130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CFAP73A6NFT4 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CFAP73A6NFT4 MCM9-201ENST00000316068 2442 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CFAP73A6NFT4 SPRYD7-201ENST00000361840 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CFAP73A6NFT4 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CFAP73A6NFT4 ZDHHC2-201ENST00000262096 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CFAP73A6NFT4 MEST-201ENST00000223215 2465 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CFAP73A6NFT4 NOP14-AS1-202ENST00000505731 1999 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CFAP73A6NFT4 GOLGA7-204ENST00000520817 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CFAP73A6NFT4 RHOF-201ENST00000267205 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CFAP73A6NFT4 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CFAP73A6NFT4 PCDHGC5-202ENST00000610789 2763 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CFAP73A6NFT4 TEKT5-201ENST00000283025 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CFAP73A6NFT4 MFSD2A-202ENST00000372811 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CFAP73A6NFT4 KIFC3-203ENST00000445690 3379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CFAP73A6NFT4 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CFAP73A6NFT4 GPR135-201ENST00000395116 4578 ntAPPRIS P1 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CFAP73A6NFT4 SALRNA1-201ENST00000555871 2086 ntTSL 4 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CFAP73A6NFT4 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CFAP73A6NFT4 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CFAP73A6NFT4 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CFAP73A6NFT4 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CFAP73A6NFT4 PHKA2-201ENST00000379942 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CFAP73A6NFT4 TMEM198B-203ENST00000482378 2230 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CFAP73A6NFT4 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CFAP73A6NFT4 TRAM1-201ENST00000262213 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CFAP73A6NFT4 LDLRAP1-201ENST00000374338 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CFAP73A6NFT4 RBM15B-201ENST00000563281 6641 ntAPPRIS P1 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CFAP73A6NFT4 PDLIM7-203ENST00000359895 1567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CFAP73A6NFT4 SKOR1-202ENST00000380035 3675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CFAP73A6NFT4 NYX-201ENST00000342595 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CFAP73A6NFT4 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CFAP73A6NFT4 KCNQ5-212ENST00000628967 3527 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CFAP73A6NFT4 SASH1-201ENST00000367467 7711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CFAP73A6NFT4 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CFAP73A6NFT4 PXK-206ENST00000463280 2825 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CFAP73A6NFT4 FADS1-204ENST00000433932 1690 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CFAP73A6NFT4 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CFAP73A6NFT4 PCK2-205ENST00000558096 2433 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CFAP73A6NFT4 CBSL-202ENST00000617706 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CFAP73A6NFT4 SYNPO-201ENST00000307662 5374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CFAP73A6NFT4 SNED1-204ENST00000401884 4538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CFAP73A6NFT4 KLHL24-201ENST00000242810 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CFAP73A6NFT4 HOXC11-201ENST00000243082 2039 ntTSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CFAP73A6NFT4 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CFAP73A6NFT4 PTGDR-201ENST00000306051 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CFAP73A6NFT4 NAT9-201ENST00000357814 1875 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.4 ms